摘要：洪湖碘泡虫(Myxobolus honghuensis)引起的鲫“喉孢子虫病”严重危害我国异育银鲫养殖。病原丰度是决定病害发生的最重要因素之一,因此建立洪湖碘泡虫的定量检测方法,不仅可用于异育银鲫“喉孢子虫病”的早期诊断,也可应用于养殖系统中洪湖碘泡虫的定量监测,为该病的暴发风险预警及防控措施的效果评价提供技术手段。研究根据洪湖碘泡虫的ITS基因序列,设计合成一对特异性引物HHF/R,建立了洪湖碘泡虫的SYBR greenⅰ实时荧光定量pcr方法,并对该方法的特异性、灵敏性、重复性及应用性进行了验证。结果显示,该方法能特异性检测出洪湖碘泡虫,而与多涅茨尾孢虫、倪李碘泡虫、普洛宁碘泡虫、吴李碘泡虫之间无交叉反应;最低检测限为3.02×101copies/μL,灵敏性较常规pcr高出1000倍;组内和组间重复性试验的变异系数均小于2%。应用该方法可定量检出洪湖碘泡虫全生活史阶段,包括鱼体内移行发育的前孢子阶段及养殖系统环境,如池塘水样及底泥样品中分布的洪湖碘泡虫。因此,所建立的洪湖碘泡虫SYBR greenⅰ实时荧光定量pcr方法特异性好、灵敏度高、重复性稳定,可应用于异育银鲫全养殖阶段洪湖碘泡虫的定性、定量监测。

摘要：为建立一种快速检测跨膜蛋白39A(TMEM39A)基因的方法,根据GenBank中登录的不同种属TMEM39A基因序列的保守区域,设计并合成1对荧光定量通用性引物,经过条件优化,建立了检测TMEM39A基因的SYBR greenⅰ实时荧光定量pcr方法。结果显示:标准品模板在3. 937×10~8～3. 937×10~3拷贝·μL^(-1)范围内呈良好的线性关系,R^2可达0. 999;该方法特异性较好,检测灵敏度可达3. 937×10~2拷贝·μL^(-1);组内和组间变异系数均小于1%,具有较高的重复性和稳定性;利用该方法能够检测出不同细胞中的TMEM39A含量,具有种属通用性。该研究方法的建立为临床上提供了一种TMEM39A的快速检测和定量分析技术。

摘要：【目的】建立一种检测牛分枝杆菌的SYBR greenⅰ实时荧光定量pcr,为防控牛结核病提供技术支持。【方法】根据牛分枝杆菌特异性基因序列(***87961,gi9954088)设计合成一对扩增牛分枝杆菌的特异性引物,从引物设计、各成分配比、样品采集及样品DNA提取等方面进行优化,并对建立的方法进行标准曲线、溶解曲线分析及特异性、敏感性、重复性、临床样品检验试验。【结果】牛分枝杆菌SYBR green Ⅰ实时荧光定量pcr的检测模板范围为1.0×109～1.0×10拷贝/μL时,其标准曲线呈良好的线性关系,溶解曲线表现为单一波峰,Tm值为86.48～86.65℃。SYBR greenⅰ实时荧光定量pcr的牛型分枝杆菌扩增结果为阳性,其他参试菌株均为阴性;可检测出10拷贝/μL的牛分枝杆菌DNA,敏感性是常规pcr的100倍;Ct值变异系数小于5%,重复性好;对50份PPD检测为阳性的牛鼻黏液、牛奶和淋巴结进行检测,其结果与常规pcr检测结果一致。【结论】建立的SYBR green Ⅰ实时荧光定量pcr具有快速、便捷、准确等优点,适合于牛分枝杆菌的鉴别诊断。

摘要：针对牛冠状病毒(BCoV)N基因保守序列设计合成了1对特异性引物,以体外转录法制备的cDNA标准品为模板,建立了检测BCoV的SYBR greenⅰ实时荧光定量pcr方法。在1个反应体系中模板最低检测限为7.8 copies/μL,比普通RT-pcr更加灵敏;与牛主要消化道和呼吸道病毒病病原均无交叉反应;批内、批间重复变异系数均低于1.5%;应用定量pcr检测了39份疑似临床病料,阳性检出率为51.28%(20/39),普通RT-pcr为41.03%(16/39)。结果表明,该方法特异性强、稳定性好、准确率高,本方法将为BCoV的临床诊断和流行病学调查提供技术保障。

摘要：根据编码PRRSV M蛋白的基因序列设计用于SYBR greenⅰ实时荧光定量pcr扩增的引物,通过温度梯度法优化反应体系;以不同科属常见猪致病性RNA病毒疫苗验证该检测方法的特异性,参考国内PRRSV分子流行病学特征,选择基因型代表性的2株疫苗株验证该检测方法的稳定性;以10倍梯度稀释的质粒为标准品扩增并构建标准曲线,探究该检测方法的灵敏度,随机挑取10份保存的PRRSV阳性病料和10份阴性病料同时使用农业部推荐的PRRSV RT-pcr检疫标准方法和建立的方法进行检测,以确定2种方法检测的符合率。结果显示,使用建立的方法可以在54.4℃80min内完成对PRRSV的检测,该检测方法具有特异性和稳定性;检测灵敏度为6.8×10拷贝/μL;以Ct值为横坐标,扩增序列拷贝浓度的对数值为纵坐标,得到标准曲线,方程为y=-3.411 x+39.002,R2=0.999;对随机挑取的10份PRRSV阳性病料和10份阴性病料进行检测,结果2种方法检测结果的符合率100%。结果表明,成功建立了PRRSV SYBR greenⅰ实时荧光定量pcr快速检测方法,为临床提供了一种很好的检测手段。

摘要：目的建立SYBR greenⅰ实时荧光定量pcr检测血清中miR-203的表达水平,并检测宫颈癌患者、良性宫颈疾病及健康对照者血清miR-203的表达水平。方法设计miR-203、U6茎环逆转录引物和pcr扩增引物进行荧光定量pcr,以U6为内参相对定量比较不同宫颈疾病患者血清中miR-203的表达水平。结果该研究建立的方法能特异性检测到血清中miR-203的扩增信号,熔解曲线单一,pcr产物特异。宫颈癌患者血清中miR-203表达水平明显高于子宫肌瘤、宫颈炎等其他良性宫颈疾病,差异有统计学意义(P<0.05)。结论 SYBR greenⅰ实时荧光定量pcr是一种快速简便、灵敏度高、特异度好的检测方法,可能在宫颈癌辅助诊断中有较好的应用前景。