摘要：开展茄梨hy5基因克隆及生物信息学分析,可为茄梨hy5基因功能的研究奠定基础。以茄梨为试材,提取mRNA,反转录为cDNA,设计特异性引物(F:ATGCAAGAGCAGGCGACG,R:TCAATCCGCATTTGCACT)扩增hy5基因全长序列,并进行生物信息学分析。结果显示,茄梨hy5基因(Pchy5)全长为495 bp,编码164个氨基酸;Pchy5蛋白质分子量为17.90 KD,为亲水蛋白质,具有bZIP结构域;Pchy5与云南红梨(红梨1号)、白梨等蔷薇科植物的hy5基因具有高度的同源性,Pchy5编码的蛋白质与中国白梨等的hy5基因编码的蛋白质相似性高达99.8%。表明,Pchy5与梨属其他植物的hy5基因具有相同功能。

摘要：目的 以药用植物红花Carthamus tinctorius为研究对象,克隆光信号途径关键转录因子hy5基因,并对其进行生物信息学和表达模式分析,为红花hy5基因的功能研究提供参考。方法 以红花转录数据为参考,设计引物,采用PCR扩增方法从红花中克隆得到hy5的全长c DNA和DNA序列。运用生物信息学方法对该基因进行分析,预测编码蛋白的结构与功能,并通过荧光定量PCR方法检测Cthy5基因在红花不同组织及花发育不同时期的表达情况。结果 Cthy5基因的c DNA全长为462 bp,编码153个氨基酸,DNA全长为1941 bp,包含4个外显子和3个内含子。生物信息学分析表明,Cthy5为亲水性蛋白,定位于细胞核中。系统进化树及模体结构分析结果表明Cthy5与来自菊科的刺菜蓟、黄花蒿、薇甘菊、向日葵、莴苣中的hy5进化关系较近。定量分析表明,在白色红花和红色红花中,Cthy5基因均在花中表达量最高,其次为茎和苞片,在根中表达量最低。此外,除了根外,Cthy5基因在白色红花各组织中的表达量要明显高于红色红花。结论 首次从红花中克隆得到了光信号途径关键转录因子Cthy5基因,并研究了该基因在不同花色红花品系中的表达模式,为进一步研究其生物学功能奠定了基础。