摘要：旨在对北京黑猪hoxb簇9个基因(hoxb1-7、9和13)的多态性与脊椎数和胴体性状(胴体长、胴体直长、胴体斜长及胴体重)进行关联分析。本研究提取251头220日龄的健康北京黑猪耳组织DNA,对hoxb簇的9个基因通过引物设计、聚合酶链式反应(PCR)技术、Sanger测序技术等对SNPs进行基因分型,并计算变异位点基因型频率以及等位基因频率分布,并与脊椎数和胴体性状进行关联分析。结果,本试验共筛选到4个基因共12个非编码区的(UTR)SNPs,包括hoxb2基因的1个5′UTR突变、hoxb5基因的2个3′UTR突变、hoxb9基因的2个3′UTR突变以及hoxb13基因的7个3′UTR突变。将12个SNPs分别与脊椎数和胴体性状使用Duncan′s多重检验统计分析发现,hoxb2基因的1个5′UTR突变(c.40 C>T)、hoxb5基因的2个3′UTR突变(c.1766 A>G、c.1767 A>G)均与性状关联不显著(P>0.05);而hoxb9基因中的1个3′UTR突变(c.2743 C>T)与胴体性状关联显著(PA、c.1440 A>C)与脊椎数关联显著(PT与胴体性状关联显著(PA、c.1440 A>C均与脊椎数性状关联显著(P<0.05),这3个位点可作为北京黑猪脊椎数及胴体性状变异的候选基因功能位点。