摘要：为丰富甜瓜分子标记类型,并为后续甜瓜种质、品种及种子纯度鉴定提供简便、高效的检测方法,分别在甜瓜每条染色体上挑选6个核心SNP位点,共72个标记,通过kasp技术对11份甜瓜种质进行基因分型,确定了45对具有较好分型效果的标记,标记设计成功率为62.5%。从45对分型较好的标记中挑选25个基因型分簇集中的最优标记,对31份甜瓜种质进行基因分型,明确了各种质在25个SNP位点的多态性,通过聚类分析,分成了3组,并构建了31份甜瓜种质的指纹图谱,为甜瓜种质资源利用和种子纯度鉴定提供了参考。

摘要：辣椒素是辣椒特有的物质,含量的高低是影响辣椒果实品质的重要因素。本研究拟建立1个与辣椒素含量高低紧密连锁的分子标记,从而有利于快速检测辣椒素含量,避免因口尝等传统方法带来的不便。Pun1是辣椒素合成途径中关键基因,以Pun1基因序列为参考,进一步根据基因变异设计kasp分子标记。利用kasp高通量分子标记分型系统对自然群体材料进行基因分型发现,采用该标记对85份自然群体材料进行鉴定,符合率达到100%。本标记为辣椒素含量高低紧密连锁的分子标记,可以为快速鉴定自然群体材料辣椒素含量高低提供依据。

摘要：本研究利用kasp标记对青海省不同小麦品种进行多态性分析,以期了解青海省不同小麦品种间的遗传多样性。选择青海省48个不同小麦品种,利用SNP芯片结果,设计kasp标记并对不同小麦品种进行多态性分析。结果显示kasp标记多态性比率为90.4%,其中A染色体组标记数最多,为2417个,位于小麦第二染色体的kasp标记数目最多,为2368个,占43.75%。多态性结果显示48个不同的小麦品种可分为5个(距离20)或12个(距离15)类群,表明不同小麦品种存在较大差异,有些品种虽然来自同一系列,但亲缘关系却较远,而来自不同系列的小麦遗传关系较近,说明青海省下一步小麦遗传育种需引进其他遗传关系较远的品种。

摘要：检疫性杂草糙果苋(Amaranthus tuberculatus)与同属其他种的鉴别一直是个难点。本研究建立糙果苋的kasp(Kompetitive allele-specific PCR)检测方法,可用于糙果苋快速、准确的分子鉴定。提取11种23份苋属植物的DNA后,根据长芒苋(Amaranthus palmeri)核基因组序列,设计引物AP4F和AP4R,通过序列扩增和比对,发现糙果苋有特异性SNP (Single nucleotide polymorphism)位点。利用引物设计软件Primer 5设计了用于鉴定糙果苋的kasp反应引物。结果表明,特异引物基于kasp技术扩增后,可以形成明显的基因分型,能将糙果苋与同属近缘种进行区分。该研究为进口粮谷中糙果苋的检测鉴定提供了新技术。

摘要：为了建立濒危植物黑牡丹的kasp鉴定方法,选取6种13份岩牡丹属植物样品为材料,根据磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶(PEPC)基因上的单核苷酸多态性(SNP)位点,设计黑牡丹特异性kasp引物,用于PCR扩增。结果表明,通过PEPC序列的SNP位点所设计的kasp引物可以在黑牡丹与其近似种之间形成明显的基因分型,能够将其与同属近缘种及其他仙人掌科物种准确地区分开来,可用于黑牡丹的真假鉴定及进出境口岸濒危物种的查验鉴定。

摘要：叶绿体标记具有遗传保守性高且不受核基因重组干扰等特点,适于对玉米种质资源进行分类管理。本研究基于Maize6H-60K芯片对玉米叶绿体标记筛选获得叶绿体分组候选位点,使用上述位点对3549份玉米种质资源进行聚类分析,将玉米种质资源划分为B、D、H、C、T共5个类群。通过基因型信息对比筛选出29个叶绿体分组特异标记(Varietal Chloroplast Panel,VCP)并设计kasp引物。开发兼容芯片、kasp平台的快速分组分析算法,算法结果与聚类分析一致。挑选5个类群特异位点利用序贯法对种质资源进行快速分组检测,构建玉米种质资源快速分组方法,减少了95%的检测量,为玉米种质资源提供一种新型高效的分组管理方法。

摘要：为明确矮秆基因Rht-B1和Rht-D1在青海春麦区小麦品种中的分布,以青海春麦区历年种植的45份春小麦品种(25份育成品种,14份引进品种,6份地方品种)为材料,利用kasp标记技术检测其两个矮秆基因的分布,并分析这两个矮秆基因对株高、穗长、小穗数和穗粒数的影响。结果表明,Rht-B1位点上存在Rht-B1a和Rht-B1b两种等位变异,分布频率分别为91.11%和8.89%;Rht-D1位点上存在Rht-D1a和Rht-D1b两种等位变异,分布频率分别为86.67%和13.33%。25份育成品种中,Rht-B1b和Rht-D1b的分布频率分别为16.00%和12.00%,未发现Rht-B1a和Rht-D1a;引进品种中仅含有Rht-D1b,分布频率为21.43%;地方品种中未发现Rht-B1b和Rht-D1b。Rht-B1b和Rht-D1b均具有一定的降秆效应,Rht-D1b的降秆效应大于Rht-B1b。携带Rht-B1a/Rht-D1b品种的株高显著低于携带Rht-B1a/Rht-D1a和Rht-B1b/Rht-D1a的品种,该组合类型不仅可使株高降低,也可增加小穗数和穗粒数;未发现携带Rht-B1b/Rht-D1b组合类型的品种。

摘要：为了解青海高原地区春小麦品种中粒重基因的分布情况,采用kasp标记检测3个粒重基因( TaCwi-A1、 TaGW2-6A和 TaTGW6-4A)等位变异在青海高原地区主栽的49个小麦品种中的分布,并结合千粒重表型,分析不同等位变异组合对小麦粒重的影响,探索最优基因型。结果显示,49个品种的千粒重在不同年度均存在显著差异;TaCwi-A1位点存在 TaCwi-A1a和 TaCwi-A1b两种等位变异,分布频率分别为69.39%和30.61%;TaGW2-6A位点存在 Hap-6A-A和 Hap-6A-B两种等位变异,分布频率分别为46.94%和53.06%;TaTGW6-4A位点存在 TaTGW6-4Aa和 TaTGW6-4Ab两种等位变异,分布频率分别为97.96%和2.04%。 TaCwi-A1、 TaGW2-6A和 TaTGW6-4A位点的不同等位变异均会导致小麦千粒重发生显著变化,其中, TaCwi-A1位点的等位变异对小麦千粒重影响较为重要。49个小麦品种中, TaCwi-A1a/ Hap-6A-A/ TaTGW-6-4Aa等位变异组合类型的品种的分布频率为32.65%,其千粒重最高,显著高于其他等位变异组合类型的品种,是青海高原地区优异的基因型组合。