摘要：从染料污染的土壤中分离出1株新的咔唑降解菌LSSE-H2,能以咔唑作为唯一的碳源、氮源和能源.依据16S rRNA基因序列的系统发育分析将该菌鉴定为klebsiella sp.该菌在30℃、以咔唑为唯一的碳源、氮源的选择性培养基(CNFM)中,经过56h可将浓度为12mmol/L的咔唑几乎完全降解,在浓度为16mmol/L的咔唑中也同样表现出高的咔唑降解活性.对比分析不同营养成分培养基中对咔唑的降解情况表明,LSSE-H2可能存在独特的咔唑降解活性表达调控模式.按照已公布的car基因簇序列设计同源引物,PCR扩增出LSSE-H2的包含5个咔唑降解基因的car基因簇片断,测序结果表明,咔唑降解基因高度保守,与Sphingomonas ***1和Sphingomonas ***11相应的咔唑基因的同源性都达到100%,只在基因簇的非编码区上发现少数碱基不同.对比研究表明,LSSE-H2,KA1和GTIN11中car基因簇的起源可能相同,并能在不同的细菌之间水平转移.

摘要：基于NCBI数据库中固氮菌nif D基因的核苷酸序列,设计并合成特异性引物,以甘蔗内生固氮菌klebsiella variicola DX120E为模板,通过PCR方法获得了klebsiella variicola DX120E nif D基因的ORF;以p ET30a(+)为原核表达载体,构建重组表达质粒p ET30a-nif D。将正确的重组质粒转入原核表达菌株BL21(DE3),在28℃培养条件下经1 mmol/L的异丙基硫代半乳糖苷(isopro-ply-β-D-thiogalactopyranoside,IPTG)诱导表达;通过SDS-PAGE电泳检测融合蛋白表达情况。结果表明,本研究克隆得到甘蔗内生固氮菌klebsiella variicola DX120E nif D基因的ORF为1 452 bp,编码483个氨基酸;原核诱导表达后经提纯和质谱鉴定,该蛋白等电点为5.90,分子量为53.87 k D,与预期大小一致。该蛋白在原核表达系统中以包涵体的形式成功表达。利用Ni柱亲和层析方法进一步获得了纯度较高的重组蛋白,为今后单克隆抗体的制备、蛋白质印记杂交检测(Western Bloting)等研究奠定了基础。

摘要：[目的]为了明确黑土种植的大豆根际溶磷菌的种类及不同溶磷菌溶无机磷的特性,并有效利用溶磷菌,增加黑土的可持续利用能力。[方法]以NBRIP为分离培养基从大豆根际土壤中分离到1株溶磷菌(命名为wj6),采用Vitek 2自动分析系统和16S rDNA方法对其进行鉴定;以NBRIP分离培养基为基础,利用L25(53)正交设计试验,从碳源、氮源及pH值3个方面对菌株wj6溶磷培养基进行优化;利用优化后的NBRIP培养基测定wj6溶解Ca3(PO4)2、FePO4和AlPO4的特点以及溶磷过程中磷酸酶活性和葡萄糖脱氢酶活性。[结果]经Vitek 2自动分析系统和16S rDNA方法鉴定菌株wj6为klebsiella sp.。菌株wj6以葡萄糖和蛋白胨为碳源和氮源,pH值为8时溶磷量最高;对Ca3(PO4)2、FePO4、AlPO4均有较强的溶解能力,最高溶磷量分别为409.28、60.59和32.90μg·m L-1。菌株wj6在溶解FePO4和AlPO4时受环境pH值的影响较大,当接种到pH值为8的溶磷培养基中,能溶解FePO4和AlPO4,而在培养基原液(pH3)中不具有溶磷能力;以Ca3(PO4)2为唯一磷源,在溶磷过程中酸性磷酸酶、碱性磷酸酶和葡萄糖脱氢酶活性先增加后减小,36 h内葡萄糖脱氢酶活性较大,与其他时间内酶活差异显著。[结论]从大豆根际分离到的溶磷菌klebsiella ***6在不同难溶性磷酸盐中溶磷能力差异较大,且溶磷受环境pH值的影响。磷酸酶和葡萄糖脱氢酶在溶磷过程中起重要作用。

摘要：以klebsiella oxytoca(***)HD79为出发菌株,根据α-乙酰乳酸脱羧酶基因序列相似的特点,利用Primer5.0设计一对引物,以*** HD79为模板,PCR扩增,获得*** HD79基因片段Bud A,此片段经测序显示长度为780 bp,无碱基缺失。利用生物信息学软件对该序列进行了同源性分析、氨基酸组成分析、疏水性分析、磷酸化位点预测、亚细胞定位分析及二、三级结构预测。结果表明,该片段为*** HD79的α-乙酰乳酸脱羧酶基因序列。对该酶进行的生物信息学特异性分析为其构建产2,3-丁二醇的工程菌株提供一定的理论参考。