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凝血因子Xa的s4口袋部分关键残基对利伐沙班结合的不同作用机制: 收藏
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引用; 《高等学校化学学报》2019年第9期40卷 1918-1925页; 作者：瞿思颖徐沁上海交通大学生命科学技术学院微生物代谢国家重点实验室; 通过生物信息学对比、分子动力学模拟和结合自由能计算分析了利伐沙班与凝血因子Xa的s4口袋部分关键残基之间动态相互作用的细节.结果表明,利伐沙班与凝血因子Xa结合不稳定是由s4口袋关键残基突变对疏水盒子完整性的破坏所致.其中Trp21...; 通过生物信息学对比、分子动力学模拟和结合自由能计算分析了利伐沙班与凝血因子Xa的s4口袋部分关键残基之间动态相互作用的细节.结果表明,利伐沙班与凝血因子Xa结合不稳定是由s4口袋关键残基突变对疏水盒子完整性的破坏所致.其中Trp215侧链的疏水作用对抑制剂结合的作用较大,但对整体结构的影响短时间内较小. Tyr99虽然在结合自由能中贡献较小,但其突变可能导致99 loop所在结构域的整体构象变化,从而对于抑制剂或底物的结合特异性产生影响. s4口袋关键残基的不同作用在凝血因子Xa直接抑制剂的药物设计及其拮抗剂的开发中应予以充分考虑.; 来源：详细信息评论

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