摘要：以光皮桦茎叶组织为材料,构建了cDNA文库。初级文库滴度为1.5×106pfu/mL,重组率达97.3%,插入片段大小在0.5～3.0kb之间,平均长度约为1.3kb,表明所构建的文库质量较高,可用于后续基因克隆及基因表达谱的研究。利用微卫星查找软件对获得的224条EST序列进行微卫星位点搜寻及其丰度、分布比较,发现47条序列含微卫星位点60个,占全部EST序列的26.80%;在所有ssrs中二碱基重复最多,为42个,占总数的70.00%,含三、四碱基重复分别占总数的28.30%和1.70%。通过对光皮桦EST序列中微卫星位点信息的发掘分析,为有针对性地设计EST-ssr引物、进行遗传多样性分析奠定了基础。

摘要：对陆地棉品种T582和T586两个多标记基因系及其杂交后代F1进行了ssr分析。结果表明,从50对ssr引物中筛选出6对引物具有多态性,占总引物数的12%。ssr序列位点多数呈共显性标记,少数为显性标记。ssr序列的扩增与两端设计引物有很大关系。

摘要：为给小麦矮秆新种质N0381D的利用提供依据,采用田间观察、赤霉酸鉴定以及ssr分析相结合的方法,对该种质的矮秆性状进行了遗传分析和分子标记定位。结果表明,N0381D与高秆品种阿勃的杂种F1代株高均接近或稍高于中亲值,F2代高、矮秆比例为123∶33,经χ2测验,符合3∶1遗传分离比例;(N0381D/阿勃//N0381D)BC1代矮秆植株数和半矮秆植株数的分离比例符合1∶1遗传分离比例,说明N0381D的矮秆性状由1对隐性主效基因控制。赤霉酸鉴定表明,该种质为赤霉酸不敏感型。利用337对ssr引物在亲本及高、矮秆池间进行多态性筛选,引物Xwmc503与该矮秆基因连锁,遗传距离为19.3 cM,通过中国春及其第2部分同源群缺体-四体系和双端体系将其定位于2DL染色体上。由于2DL上目前还没有发现矮秆基因,利用Xgwm261对高、矮秆池进行分析,也没有扩增出特异条带,表明N0381D携带的矮秆基因与定位于2DS上的Rht8不同,因此推测该基因是一个新的矮秆基因,暂命名为RhtN0381D。

摘要：为明确海蓬子EST序列中ssr的总体特征,开发海蓬子EST-ssr引物,从NCBI网站下载海蓬子及其近缘植物EST序列,利用Cross match等软件过滤掉载体序列、polyA/T和过短或过长的低质量序列,经CAP3软件拼接后获得非冗余EST,然后用在线软件ssrIT从这些序列中查找ssr,采用primer5.0软件设计ssr引物,并进行PCR扩增,对引物适用性进行评价。结果表明,截止2013年5月,NCBI数据库共有海蓬子相关EST序列1 439条,经软件处理后获得无冗余EST序列1 139条,总长542 084 bp,从这些序列中搜索到210个ssr,分布于167条EST中,出现频率为14.66%。ssr平均分布距离为2.58 kb,平均长度为14.56 bp;三核苷酸重复是主导类型,占ESTssrs总数的40.95%,其次为四核苷酸和五核苷酸重复,分别占29.52%和13.33%;二核苷酸占11.90%,六核苷酸最少,仅占4.29%。在所有类型的重复基元中,ACT/AGT类型最多,占10.95%,其次为AAT/ATT和ACG/CGT,分别占8.10%和6.67%。随机挑选了30个ssr位点,根据其两侧保守序列,设计并合成了相应的EST-ssr引物,对海蓬子DNA进行PCR检测分析,结果有14对引物获得了清晰的条带,进一步将其中的5对引物对10个样本小群体进行了验证,结果显示有较好的多态性。该研究结果表明海蓬子EST序列中含有高频率的ssr位点,ESTssr标记开发效率较高,为进一步开展海蓬子分子标记研究提供了一批适用的EST-ssr引物。