摘要：rbcl为催化光合作用的关键酶Rubisco大亚基的编码序列,它在种间和种内水平保守性都很高。本研究首先设计出引物并扩增到取自安徽太和的桔梗rbcl部分序列,紧接着从Gen Bank中下载相关桔梗科植物进行系统学分析。结果表明,桔梗科rbcl部分的遗传多样性较低,利用该序列构建的系统树与形态分类学的结果有一定的差异。但总体来看,还是可以将不同的属分开,因而rbcl可以用作桔梗科的系统学相关分析。

摘要：为了甄别卷烟制品的成分,本研究采用植物条形码技术设计通用引物,通过PCR扩增获得条带,然后将PCR克隆到载体中,挑选单克隆进行测序,对测序的结果在NCBI进行序列比对;序列比对结果揭示混合物中发现辣椒、菊科莴苣类、茄子、番茄、菜豆族、烟草的rbcl序列。本研究结果表明该方法可以有效的获得植物混合样品中的植物源成分,即便对深加工后的植物叶也具有很强的分辨效果;同时也对鉴定植物源食品内成分提供借鉴意义。

摘要：目的:分析浙南忍冬属药用植物叶绿体rbcl基因序列,探讨其差异。方法:Primer Premier5.0设计引物,用于rbcl基因PCR扩增,ClustalX1.83进行序列全比对。MEGA 4.0分析转换值、颠换值等;以七子花Heptacodium miconioides为外类群,邻接法(Neighbor-Joining,NJ)和最大简约法(Maximun Parsimony,MP)进行聚类分析(models:p-distance);自展法(Bootstrap)检验各分支可信度。结果:5种忍冬属药材rbcl基因片段长度在1 143～1 167 bp之间,手工校正后长度为1 137 bp,保守位点1 126个,变异位点11个,简约信息位点6个,碱基转换和颠换分别为3和2,比值为1.6;MP和NJ两种方法所得结果几乎一致,均将5种忍冬属药材分为两大支,黄褐毛忍冬与忍冬为第一大支,红腺忍冬、华南忍冬和灰毡毛忍冬为第二大支。结论:rbcl基因能够从分子水平揭示5种忍冬属药材的差异,为忍冬属药材鉴定以及系统发育提供重要参考依据。

摘要：目的探讨多重实时荧光PCR检测方法对川贝母及伪品鉴别的可行性。方法通过对常见贝母属植物的ITS、psb Atrn H、rbc L和matK基因序列种间变异、遗传距离及系统发育关系分析,选择进化速率快、种间变异大、种内变异小的基因作为靶基因,设计川贝母及伪品贝母的特异性引物和Taqman探针,建立一种多重实时荧光PCR检测方法。通过特异性、灵敏度及混合样本检测与测序方法比较进行方法评估。结果贝母属ITS和psb A-trn H变异位点高于rbc L和mat K,通过遗传距离分析rbc L和mat K基因显著低于ITS和psb A-trn H基因,以ITS作为靶基因,建立多重实时荧光PCR检测方法特异性强,灵敏度达0.01ng,对18份样本抽查检出4份伪品贝母,检测结果与构建的NJ树聚类分析结果完全一致。结论基于ITS区域序列为靶基因建立多重实时荧光PCR检测方法能够成功鉴定川贝母及其混伪品,为川贝母真伪鉴别提供依据。

摘要：应用双向电泳结合液相色谱-质谱联用(LC-MS)分析,筛选得到干旱胁迫下白菜型冬油菜与光合作用相关差异蛋白质RuBisCo小亚基。根据已发表白菜型油菜(Brassicarapa)RuBisCo亚基rbcl和rbcS保守序列设计引物,采用RT-PCR扩增陇油7号的cDNA,获得rbcl和rbcS基因开放阅读框,长度分别为1095 bp和549 bp,编码364和181个氨基酸的蛋白质。生物信息学分析结果显示, rbcl与大白菜(Brassica rapa subsp. chinensis)的蛋白质同源性达到99%以上,其保守序列属于RuBisCoLarge超家族,该蛋白质理论相对分子量及等电点分别为40.29kDa和6.70,不稳定指数(instabilityindex,II>40为不稳定蛋白质)为41.67,属于不稳定蛋白;脂融指数(aliphaticindex)为83.63,平均亲水性值(grand average of hydropathicity)为-0.232,属于亲水性蛋白质;二级结构包括38.74%α-螺旋(alpha helix)、10.99%延伸链(extendedstrand)及50.27%自由卷曲(randomcoil);三级结构具有5个不同的活性口袋。rbcS与甘蓝(Brassicaoleracea)蛋白质同源性达到99%,其保守序列具有rbcS超家族和RuBisCo Small Like超家族,理论相对分子量为20.32 kDa,理论等电点为8.23,不稳定指数为33.66,属于稳定蛋白质;脂融指数为74.86,平均亲水性值为-0.142,属于亲水性蛋白质;二级结构包括16.02%α-螺旋、28.73%的延伸链及55.25%自由卷曲;三级结构具有4个不同的活性口袋。实时荧光定量和半定量分析显示,干旱胁迫下,白菜型冬油菜叶片rbcl和rbcS基因表达量下调是光合作用下降的原因。并且,冬油菜叶片Pn下降与RuBPCase表达抑制和活性降低有关,非气孔限制是Pn下降的主要因素。