摘要：为了解白掌株型突变的转录组序列功能和SSR位点分布特征,并探索与株型关联的SSR位点信息。以对照‘美酒’及其小株型突变体为材料,选取叶片、叶柄、佛焰苞片、苞梗组织进行高通量PE150的转录组测序和序列筛选;开展unigene的GO、KOG、KEGG功能注释及分类;开展SSR位点筛选及批量设计引物;发掘差异表达含SSR位点unigene的GO、KEGG富集功能信息。结果显示,白掌转录组共筛选127153个unigene,其中有41370个获注释,包含GO注释25925个、KO注释12727个、KOG注释21487个;从18636个unigene中发掘出28046个SSR位点,出现频率22.06%,包含有193种重复基序,其中以二核苷酸AG/CT(14305,51.01%)、AC/GT(3907,13.93%)、AT/AT(2322,8.28%)和三核苷酸AAG/CTT(2087,7.44%)居多,基序重复次数以5~10次重复占优势;从18636个unigene中筛选17070个批量设计出51210对SSR引物,有效扩增和多态性好。差异转录组结合SSR位点信息显示,在与株型相关的4个组织中共获得1578个差异表达的unigene,其中有552个具SSR位点,占总SSR 2.96%、差异基因中的SSR 34.98%。KEGG富集分析筛选了26个含SSR位点的显著性差异unigene参与植物激素信号传导,脂肪酸延长,角质、琥珀和蜡的生物合成,甘露糖型O-聚糖的生物合成,苯丙素的生物合成,二萜生物合成等6个代谢途径。本研究为白掌株型变化的分子机制研究提供理论依据。