摘要：目的·探究结直肠癌(colorectal cancer,CRC)组织T细胞受体(T cell receptor,TCR)组库多样性与患者临床特征以及具核梭形杆菌(Fusobacterium nucleatum,Fn)丰度之间的关系。方法·收集63例上海交通大学医学院附属仁济医院胃肠外科收治的CRC患者的肿瘤组织及匹配的癌周正常黏膜组织,运用Illumina HiSeq 4000测序平台对符合质量标准的53对组织样本进行深度RNA测序,测序方案为双末端测序(pair-end 150 bp,PE150)。对原始测序数据进行质量控制和基因组注释,并利用TRUST4算法从RNA测序结果中提取肿瘤组织及癌周正常黏膜组织的TCR组库信息。同时对该53对样本16S rDNA的特定序列进行高通量测序分析,通过对测序数据进行质量控制及聚类,获得操作分类单元(operational taxonomic units,OTU)信息,并基于rdp_16s_***分类学数据库对OTU进行分类学注释以获取细菌的丰度信息,尤其是Fn的丰度信息。利用immunarch R包分析肿瘤组织及癌周正常黏膜组织TCR组库克隆型和多样性的特点。TCR组库多样性采用Chao1指数、逆Simpson指数以及Hill数值曲线等指标评价。根据患者性别、年龄、肿瘤位置、TNM分期等临床特征和Fn丰度因素进行分组,使用Wilcoxon检验比较不同临床特征以及Fn丰度下TCR组库多样性的差异。结果·CRC患者肿瘤组织TCR克隆型的数目低于癌周正常黏膜组织(P=0.000),肿瘤组织Chao1指数、逆Simpson指数以及Hill数值显著小于癌周正常黏膜组织(P=0.000)。不同性别、年龄(≥65岁vs0.05)。发生于直肠部肿瘤的TCR克隆型数目较非直肠部位肿瘤更高(P=0.040)。Fn高负荷的CRC患者TCR组库Chao1指数显著低于Fn低负荷患者(P=0.030)。结论·TCR组库多样性与CRC患者多项临床特征以及Fn的丰度有关,提示其在CRC的发生和发展中具有重要意义。

摘要：目的·基于单细胞RNA测序(single cell RNA sequence,scRNA-seq)技术构建结直肠癌预后预测模型。方法·利用GEO(Gene Expression Omnibus)数据库获取结直肠癌样本的scRNA-seq数据集,筛选与结直肠癌转移相关的差异基因作为预测模型的候选基因,运用套索回归算法(LASSO)、Logistic回归和Kaplan-Meier生存分析进一步在癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库中筛选及验证与结直肠癌预后相关的基因集,并建立结直肠癌预后预测模型。通过决策曲线分析和受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线评估预测模型在临床应用中的价值。结果·利用GEO数据库获取的scRNA-seq数据筛选出30个差异表达基因,进一步在TCGA数据库中利用LASSO回归得到9个关键基因,并以此对每例患者的关键基因表达进行评分。分别在训练集和验证集中对复发和未复发患者的评分进行比较,差异均有统计学意义(P<0.05)。采用Logistic回归分析将肿瘤原发灶分级(T stage)和是否发生远处转移(M stage)2个独立的临床变量纳入评分-临床变量整合模型。对评分-临床变量整合模型的实际预测价值进行评估,ROC曲线在训练集和验证集的曲线下面积分别为0.775和0.705。结论·基于scRNA-seq结果,构建了较为稳定的结直肠癌预后预测模型,可供临床评估患者预后参考。

摘要：目的·根据粪便样本宏基因组学数据建立肠道菌群标签,探索用于筛查与诊断大肠癌的非侵入性方法。方法·共纳入285例样本,根据随机森林分类算法筛选出与大肠癌发生密切相关的特征细菌;利用6种机器学习分类模型建立大肠癌的诊断模型,并进行内部和外部验证。结果·首先筛选出了9种与大肠癌发生密切相关的特征细菌,利用这9种细菌建立了6种诊断模型。其中随机森林模型准确率最高(达0.847 7),其在内部验证集和外部验证集中的准确率分别为0.815 8和0.734 4,在全集中受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线下面积(area under curve,AUC)为0.894。结论·根据粪便样本的宏基因组学数据,利用随机森林算法建立了由9种细菌组成的诊断大肠癌的菌群标签,能够有效对健康者与大肠癌患者进行区分。

摘要：目的 :分析并验证调控E74样因子3(E74-like factor 3,Elf3)表达的微RNA(microRNA,miRNA),并探索该miRNA对结直肠癌细胞功能的影响。方法 :运用数据库miRGen Targets、miRNA Viewer及MicroCosm Targets分析调控Elf3表达的miRNA。根据miRNA序列设计miRNA模拟物及抑制因子,应用miRNA转染技术改变结直肠癌SW1116细胞中该miRNA表达水平后,采用实时荧光定量-PCR法和蛋白质印迹法检测Elf3表达水平的变化。同时,提取30例结直肠癌组织及对应癌旁正常黏膜组织的RNA,反转录并实时荧光定量-PCR检测该miRNA和Elf3的表达水平。FCM和MTT法分别检测该miRNA模拟物转染对结直肠癌SW1116细胞周期、凋亡和增殖能力的影响。结果 :数据库分析显示,微RNA-198(microRNA-198,miR-198)可调控Elf3表达。应用其模拟物转染可显著提高结直肠癌SW1116细胞中miR-198水平(P0.05)。结论 :miR-198在结直肠癌中可调控Elf3的表达,并抑制结直肠癌细胞增殖。

摘要：自身免疫性肝炎(AIH)是一种由异常自身免疫反应介导的慢性炎症性肝病。AIH确切的病因和发病机制尚不清楚,环境因素、遗传背景均可能参与AIH的发生和发展。近年来,AIH的遗传学研究越来越受到关注,多个AIH相关的基因已被报道。目前人类白细胞抗原(HLA)多态性位点是AIH最明确的遗传风险因子,且与疾病临床表型相关。全基因组关联分析发现了2个非HLA区域的遗传易感基因,即SH2B3和CARD10。AIH遗传学研究有助于进一步揭示AIH的遗传发病机制。

摘要：目的 评价铝碳酸镁咀嚼片治疗功能性消化不良上腹痛综合征的有效性及安全性,并探讨其在首次服药后的起效时间和药物经济学.方法 采用多中心、随机、开放、平行阳性对照设计.将240例功能性消化不良上腹痛综合征患者随机分为铝碳酸镁组和奥美拉唑组,各组连续服药2周.观察治疗后临床症状的改善情况和铝碳酸镁组服药后症状消失时间.同时比较两组药物的成本效应.结果 治疗1周及2周后两组患者的临床症状均得到显著改善.治疗2周后,铝碳酸镁片组总有效率为85.71%;奥美拉唑组总有效率为90.43%.两组间差异无统计学意义（P＞0.05）.患者在上腹痛发生后,首次服用铝碳酸镁后上腹痛缓解的中位起效时间估计值为0.417 h.铝碳酸镁组平均每治疗1例有效患者的费用为122.29元,奥美拉唑组为242.95元.不良反应主要为腹泻、口干、腹胀、头痛和打嗝等,两组均未发生严重不良事件.结论 铝碳酸镁咀嚼片能通过多种作用途径快速缓解功能性消化不良患者上腹痛综合征的临床症状,且安全有效,其成本效应比显著优于奥美拉唑肠溶胶囊.

摘要：目的评价三九胃泰颗粒与奥美拉唑联合应用治疗功能性消化不良的疗效和安全性。方法采用多中心、随机、双盲、双模拟、平行对照设计。将405例功能性消化不良患者分为三九胃泰组、奥美拉唑组和联合用药组，每组135例，分别给予三九胃泰颗粒＋奥美拉唑模拟剂、奥美拉唑＋三九胃泰颗粒模拟剂和三九胃泰颗粒＋奥美拉唑。各组均连续服药14d。观察各组治疗后临床症状的改善情况和不良反应。计量资料行Kruskal-WallisH秩和检验。计数资料行卡方检验或Fisher确切概率法检验。三组间的两两比较，其检验水准a’=0．0125。结果治疗14d后，三组患者临床症状均得到显著改善，三九胃泰组、奥美拉唑组、联合用药组的总有效率分别为69．2％（90／130）、65．6％（86／131）、83．7％（103／123）。联合用药组的总有效率高于三九胃泰组和奥美拉唑组（X^2=7．3543和10．9033，P=0．0067和0．0010），三九胃泰组与奥美拉唑组比较差异无统计学意义（P〉0．05）。不良反应主要为头晕、嗜睡、烧心、腹痛、ALT升高等，三组的不良反应发生率差异无统计学意义（P〉0．05）。结论三九胃泰颗粒与奥美拉唑联用治疗功能性消化不良的综合疗效显著，且不良反应少。

摘要：良好的设计、严格的质量控制是构建和管理全球最大的乙肝高流行区慢加急性肝衰竭(acute-on-chronic liver failure,ACLF)高危患者队列的关键,是获得高质量循证医学证据的前提。从切实的临床问题出发,基于现有的国内外研究经验,制定科学、可行的研究方案,是该ACLF高危患者队列得以成功建立的根本。落实人员培训、定期质量核查、可追溯的原始资料获取、严格的标本管理制度等措施,保证研究数据的真实性、可靠性,保障研究的质量,是获得高质量循证医学证据的必备条件。在循证医学理念的指导下,中国慢(加急)性肝衰竭联盟(Chinese CLIF Consortium)成功完成了第1项Chinese CANONIC研究,完成了中国最大型的ACLF患者队列及世界上最大型的HBV相关ACLF患者队列建设。

摘要：目的:根据miR-126的预测靶点构建荧光素酶报告基因重组质粒,并进行功能鉴定。方法:利用sanger数据库提供的miR-126靶序列设计引物,PCR扩增目的微小RNA(microRNAs,miRNAs)靶基因3'非编码区(three-prime untranslated regions,3'UTRs)序列,PCR产物双酶切,后连入经过同样双酶切的pGL3-control载体中,连接产物转化大肠杆菌DH5α,进行阳性克隆鉴定。同样,将候选靶基因3'UTRs突变,突变型3'UTR克隆入pGL3-control报告载体,构建野生型和突变型的报告基因重组质粒。将野生型和突变型的报告基因载体分别和化学合成的microRNA以及内参质粒共转染293TN细胞,进行双荧光素酶检测。结果:成功构建miR-126报告基因野生型和突变型重组质粒pGL3-VEGF-A-3'UTR和pGL3-VEGF-A-3'UTR,质粒测序及酶切结果完全正确。瞬时转染实验显示,过表达miR-126能直接抑制VEGF-A-3'UTRs报告基因活性。结论:miR-126对VEGF-A具有靶向调节功能。

摘要：目的:制备载氟尿嘧啶的纳米粒,并考察其体外释放性能和胃癌细胞株对其的摄取能力。方法:以聚乙二醇单甲醚-聚乳酸乙醇酸-聚赖氨酸-(缬氨酸-精氨酸-甘氨酸-天冬氨酸-谷氨酸)环肽(PEAL-cRGD)为载体,用乳化-溶剂蒸发法制备氟尿嘧啶纳米粒,以粒径和包封率为评价指标,通过正交试验设计筛选最优制备工艺,并测定SGC-7901胃癌细胞株对该纳米粒的摄取能力。结果:以最优工艺制备的纳米粒为大小均匀的球形,粒径(172.9±2.3)nm,包封率(75.31±1.91)%,在pH7.4磷酸盐缓冲液中192h累积释放率为(58.63±2.47)%。SGC-7901胃癌细胞株能有效摄取该纳米粒。结论:本研究制备的氟尿嘧啶纳米粒包封率较高,粒径较小,能促进胃癌细胞对氟尿嘧啶的摄取。