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木糖还原酶定点突变设计的生物信息学分析
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《华南理工大学学报(自然科学版)》2008年 第12期36卷 122-127页
作者:杜红丽 王靖方 曾琦锴 凌飞 魏冬青 林影 王小宁华南理工大学生物科学与工程学院广东广州510006 上海交通大学生命科学与工程学院上海200240 
木糖代谢过程中,木糖还原酶(XR)和木糖醇脱氢酶(XDH)的氧化还原不平衡是利用纤维素生成酒精的关键问题之一.文中借助生物信息学手段(同源建模、酶和辅酶分子对接),通过分析数据库资源,找到了一些影响XR活性或辅酶依赖性的关键氨基酸.结...
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多通道非接触电导检测装置用于自由流电泳分离在线检测
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《色谱》2022年 第4期40卷 384-390页
作者:梁子其 张强 姜晓腾 刘小平 曹成喜 肖华 刘伟文上海交通大学电子信息与电气工程学院上海200240 上海交通大学生命科学技术学院上海200240 
现有自由流电泳(FFE)装置因不具备在线检测功能,其实用性仍然存在明显不足。针对这一问题,该工作发展了一种多通道电容耦合式非接触电导检测(MC-C^(4)D)装置并开发了自动测量软件。MC-C^(4)D装置采用了并行分时的非接触电导检测技术,即...
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基于氧化还原反应界面可视化定量检测辣根过氧化物酶
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《色谱》2020年 第2期38卷 177-182页
作者:孔昊 张强 张薇 刘伟文 曹成喜 樊柳荫上海交通大学学生创新中心上海200240 上海交通大学生命科学技术学院上海200240 上海交通大学电子信息与电气工程学院上海200240 
该文建立了一种可视化的、基于氧化还原反应界面移动距离定量检测辣根过氧化物酶(HRP)的方法。比较了隐色结晶紫显色体系和3,3′,5,5′-四甲基联苯胺显色体系对HRP的显色效率,并构建了基于3,3′,5,5′-四甲基联苯胺显色体系的氧化还原...
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贵州汞污染地区大米神经毒性基因水平研究
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《中国环境科学2004年 第6期24卷 743-745页
作者:程金平 王文华 瞿丽雅 贾金平 郑敏 林学钰上海交通大学环境科学与工程学院上海200240 贵州省环境科学研究设计院贵州贵阳550002 上海交通大学生命科学技术学院上海200240 吉林大学环境与资源学院吉林长春130026 
为从分子基因水平探讨汞污染地区大米的神经毒性,用贵州 2 个汞污染区(万山汞矿和清镇化工厂)产的大米喂养大鼠,分别于20d 和30d 后,用 RT-PCR 方法检测脑中即刻早期基因 c-fos mRNA 表达变化,并以非污染区作对照.结果表明,汞污染大米...
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环面蜗杆螺旋线参数建模与齿面生成
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《机械设计与研究》2006年 第6期22卷 53-56页
作者:孙昌佑 李儒琼 何凤琴 孙传文上海师范大学机电工程学院上海201418 上海交通大学生命科学学院上海2000030 
提出了快速构建环面蜗杆3D实体的环面蜗杆螺旋线参数方程及建模,并用此模型完成了直廓和平面包络环面蜗杆以及渐开面包络环面蜗杆的3D实体构建。所生成的齿面能为数控加工提供精确的坐标参数,也为后继的各种复杂的环面蜗杆深入实用性的...
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“Zx-Tx”类蜗轮的当量参数计算与建模
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《机床与液压》2007年 第1期35卷 42-44,29页
作者:孙昌佑 黄小强 孙传文上海师范大学机电工程学院上海201418 上海交通大学生命科学学院上海200030 
以渐开线蜗轮为例,依据空间几何关系,首次给出了蜗轮三维螺旋扫掠路径与螺距的当量解析式。并利用MDT6.0二次开发功能,提出了一种简捷实用,又真实反映蜗轮运动型面的参数化实体建模的方法。该方法精度高(理论值),能解决圆柱蜗杆传动中...
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基于形状与纹理特征的显微图像识别
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《计算机工程与设计》2011年 第4期32卷 1379-1382页
作者:张树恒 阳维 廖广姗 王莲芸 张素上海交通大学生命科学技术学院生物医学工程系上海200240 南方医科大学生物医学工程学院广东广州510515 上海交通大学生命科学技术学院实验教学中心上海200240 
为了实现对空气中的致敏花粉信息进行自动化统计,针对上海地区典型气传致敏花粉的光学显微镜图像,提出了基于形状和纹理特征的识别方法。对图像中分割得到的花粉区域,使用全局形状描述和傅里叶描述子提取形状信息,灰度共生矩阵提取纹理...
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代谢网络的蝴蝶结结构特征及其功能意义
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科学通报》2007年 第1期52卷 47-54页
作者:赵静 陶林 俞鸿 骆建华 曹志伟 李亦学上海交通大学生命科学技术学院 上海生物信息技术研究中心 中国科学院上海生命科学研究院上海200031 重庆后勤工程学院数学教研室重庆400016 
研究全基因组代谢网络的结构拓扑对于了解结构与功能间的联系是必不可少的.而可视化有助于获取网络组织结构的直观信息.从网络拓扑的角度考察了75个物种的全基因组代谢网络.提出了一个展开蝴蝶结模型,实现了对代谢网络的蝴蝶结结构的清...
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重复经颅磁刺激仪的优化设计
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《中国生物医学工程学报》2002年 第4期21卷 337-340页
作者:乔清理 王秀宏 朱贻盛 王明时上海交通大学生命科学技术学院生物医学工程系上海200030 天津大学系统工程研究所天津300072 天津大学精密仪器与光电子工程学院天津300072 
本文建立了RLC磁刺激仪模型 ,给出了模型参数计算方法。将磁刺激系统的性能指标分为三部分 :反映磁刺激仪输出性能的损耗能量 ;反映线圈输出性能的峰值磁能 ;反映线圈结构的几何变量。在给定磁刺激条件下 ,调整平面螺旋线圈的结构并计...
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应用双特异分子探针技术定性定量检测圆海链藻(Thalassiosira rotula)
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《海洋与湖沼》2009年 第1期40卷 12-18页
作者:李秀芹 于志刚 甄毓 蔡青松 米铁柱 李荣秀中国海洋大学生命科学与技术学部青岛266003 中国海洋大学化学化工学院青岛266003 中国科学院上海生命科学研究院上海200031 中国海洋大学环境科学与工程学院青岛266003 上海交通大学生命科学技术学院上海200030 
设计了一套圆海链藻(Thalassiosira rotula)特异性探针,运用双特异分子探针技术,对圆海链藻(Thalassiosira rotula)进行了定性定量检测。结果表明,本实验中设计的一套探针与其它十几种藻无交叉反应,具有种特异性;细胞裂解液直接杂交检...
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