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基于因特网的STM远程实时控制系统的设计与实现
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《计算机工程》2003年 第4期29卷 93-95页
作者:蔡英文 杨誉宗 吕露 胡钧 李民乾 孙洁林 陈良尧上海交通大学纳米科技研究中心 中国科学院上海原子核研究所 上海交通大学BIO-X研究中心上海200030 上海交通大学BIO-X研究中心 复旦大学信息学院 
在分析因特网信息传输机制的基础上,采用TCP/IP协议和客户机/服务器模式实现了多用户远程分权控制STM(扫描隧道显微镜)仪器。分析了远程实时控制系统对设备硬件及网络带宽的要求,初步探讨了因特网远程实验过程中的网络与设备安全问题...
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基于DNA自组装级联反应的纳米开关的构建
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《复旦学报(自然科学版)》2022年 第4期61卷 435-443页
作者:吴沛柯 温燕勤 周娟 张金脉 李晓柒 张含 潘敦 师咏勇上海交通大学Bio-X研究院教育部发育和神经精神疾病遗传学重点实验室上海200030 上海交通大学医学院附属上海精神卫生中心上海市精神疾病重点实验室上海200030 
DNA纳米技术是纳米科学领域的一门新兴学科,它是依据DNA的碱基互补配对原则通过自组装行为构建成为各种维度的空间结构,具有长远的开发应用价值。DNA折纸术是一种新型DNA自组装方法,它通过向一条长的DNA骨架链上加入一系列经过特殊设计...
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DNA树枝状大分子有效运输免疫刺激剂CpG
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《基因组学与应用生物学》2018年 第6期37卷 2679-2684页
作者:曲艺姣 蒋乔 杨娟娟 李璨 丁宝全 上海交通大学Bio-X研究院上海200240 国家纳米科学中心北京100190 
DNA纳米结构由于其结构稳定性、精确可控的尺寸、和良好的生物相容性,近年作为新型药物运输载体受到广泛关注。本研究中,我们设计了一种DNA树枝状结构,具有多分支、组装速度快、产率高等优良特性。我们采用这种DNA树枝状结构携载具有免...
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DNA纳米机器药物递送研究进展
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《科技导报》2018年 第22期36卷 66-73页
作者:蒋乔 韦雨 李璨 宋琳琳 丁宝全 赵宇亮国家纳米科学中心北京100190 上海交通大学Bio—X研究院上海200030 
天然分子机器是细胞正常功能(包括DNA复制、细胞内物质运输、离子平衡和细胞运动等)的重要执行者。受天然分子机器的启发,人工分子机器的概念被提出并逐步实践。DNA分子独特的理化性质使得其可作为自组装基元用于构建分子机器类纳米结构...
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小鼠闭合性股骨骨折模型的建立与评估
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《中国矫形外科杂志》2010年 第2期18卷 143-146页
作者:张连方 齐进 王晋申 钱念东 周琦 杨军 邓廉夫上海市伤骨科研究所上海交通大学医学院附属瑞金医院骨科上海200025 上海交通大学Bio-X中心上海200030 
[目的]建立小鼠标准闭合性股骨骨折模型。[方法]将60只C57BL/6雄性小鼠的右侧股骨髓腔插入0.45 mm直径的钢针,然后通过自行设计的骨折造模支架造成股骨中段闭合骨折。通过影像学、组织学方法观测骨折愈合进程。[结果]术后通过x线证实横...
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DNA折纸术研究进展
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《应用化学》2010年 第2期27卷 125-131页
作者:付衍明 张钊 李璨 师咏勇 阎秀峰 樊春海东北林业大学生命科学学院 中国科学院上海应用物理研究所上海201800 上海交通大学Bio-X中心 
DNA折纸术是近年来提出的一种全新的DNA自组装的方法,是DNA纳米技术与DNA自组装领域的一个重大进展。与传统的DNA自组装技术不同,DNA折纸术通过将一条长的DNA单链(通常为基因组DNA)与一系列经过设计的短DNA片段进行碱基互补,能够可控地...
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DNA纳米结构仿中国地图
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《科学通报》2006年 第24期51卷 2860-2863页
作者:钱璐璐 汪颖 张钊 赵健 潘敦 张益 刘强 樊春海 胡钧 贺林上海交通大学Bio-X中心DNA计算机交叉团队上海200030 中国科学院上海应用物理研究所上海201800 
用DNA在纳米尺度构造了中国地图形状.所构造的纳米结构由DNA折叠而成,直径约150nm,分辨率约6nm.通过原子力显微镜观测到的图形与设计图形几乎完全一致.该图形的构造方法采用了Rothemund于2006年发明的DNA折纸术.该研究证明了DNA折纸术...
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一种新的等温单向生长基因合成法初步探索
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《遗传》2007年 第6期29卷 765-770页
作者:林继伟 张晓东 曹雪雁 胡钧上海交通大学生命科学技术学院Bio-X生命科学研究中心 中国科学院上海应用物理研究所上海201800 
基因合成正日益成为基因获取的一种有效手段。两种常用的基因合成方法是基于PCR的基因合成(P法)和基于连接酶的基因合成(L法)。这两种方法都不是独立于所合成基因的序列内容的。文章首次提出了一种新的基因合成策略-等温单向生长法(Isot...
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纳米金增强复杂体系中PCR扩增低拷贝基因的反应特异性初步研究
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《中国生物工程杂志》2009年 第8期29卷 75-80页
作者:李海阔 曹雪雁 周智磊 陈恒上海交通大学生命科学技术学院Bio-X研究中心纳米生物学实验室上海200040 中国科学院上海生命科学信息中心上海200031 
目的:利用纳米金颗粒提高复杂体系基因组低拷贝基因PCR扩增的反应特异性。方法:首先,模拟复杂基因组扩增模式体系,以接近单拷贝的λDNA为模板,在PCR过程中加入纳米金颗粒,设计优化实验,以便模拟建立复杂基因组低拷贝目的基因PCR扩增的...
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一种基于关键路径法的DNA计算用寡核苷酸序列设计算法
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《生物信息学》2007年 第2期5卷 62-66页
作者:吕鸣 张晓东 潘家奎 张治洲 胡钧上海交通大学Bio-X中心DNA计算交叉团队生命科学技术学院 天津科技大学 中国科学院上海应用物理研究所上海201800 
在原有的生物大分子序列比对算法的基础上,结合图论中的关健路径法,提出了一种新的计算两寡核苷酸序列间最大配对程度的算法。采用此算法结合生成并测试的方法,能够寻找给定长度的一组适用于DNA计算的寡核苷酸序列。同时采用DNA芯片杂...
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