摘要：针对基本金豺狼优化算法(Golden Jackal Optimization,GJO)在解决高维优化问题时存在计算精度低、开发能力弱、容易陷入局部最优的缺点,提出一种改进GJO算法(I-GJO)。在改进算法中,设计一种基于正弦函数的非线性能量因子替代原随机递减能量因子,以平衡算法在搜索过程中的全局探索和局部开发能力。在算法迭代后期引入翻筋斗学习策略,从而扩大群体搜索范围和改善解的精度。为了验证I-GJO算法的有效性,选取6个基准函数优化问题进行数值实验,并与灰狼优化、海鸥优化算法和基本GJO算法比较。结果表明,I-GJO获得较高的精度和较快的收敛速度。最后利用I-GJO算法求解特征选择问题,对16个基准数据集的数值结果显示,改进算法能有效去除冗余特征和提高分类精度。

摘要：针对演化算法,使用随机法产生初始点带来的缺陷和均匀设计方法的优点,提出了演化均匀优化算法,进行了算法收敛性分析,并把它应用于多峰函数的数值优化计算,给出了计算示例,结果表明该方法是一种可行而且有效的优化算法.

摘要：DNA链置换是一种非常重要的分子自组装方法,因其操作性强、实验条件简单而被广泛应用于DNA计算中。可满足问题是非确定性多项式问题(NP问题)中的一个经典问题,文章利用DNA链置换反应网络来求解可满足问题,利用Visual DSD语言设计DNA链。求解过程主要分为3个反应模块,即变量转换模块、求和模块和阈值比较模块。变量转换模块是将不同变量所代表的DNA链通过链置换反应转换成同一条链;求和模块是将转换后的链浓度进行相加;在阈值比较模块中,由于浓度的检测会存在一定的误差,为此设计了2个链置换反应检测是否有荧光显示来判断可行解,若有荧光显示则为可行解,反之不是。通过Visual DSD仿真软件得到了变量转换模块相对应的链置换反应网络图、变量仿真图以及阈值比较图。该方法可用来求解多个变量的可满足性问题。文章利用上述方法成功解决了一个5变量的可满足问题。

摘要：分子信标具有高灵敏度、易操作以及检测成本低等优点,因此广泛地应用于DNA计算中;此外,金(Au)表面对荧光团具有猝灭能力,可以取代猝灭基团。文章将分子信标固定在Au表面上,构建一种高灵敏的分子信标模型,该模型可用于求解一类特殊的整数规划问题。首先将变量映射成固定在Au表面上的分子信标,且设计出不同的输入链表示变量的不同取值;其次根据变量的取值向试管中加入不同的输入链;在输入链加入后,试管中出现不同荧光信号,然后根据荧光信号的显示来判断约束条件的可行解;最后搜寻问题的最优解。与传统的分子信标模型相比,该模型允许反复清洗过程,可用于大规模检测,更易于应用于疾病监测、医药检测中。

摘要：在医疗卫生、金融证券等应用领域,经常会同时出现零观测值、一观测值较多的情况.为更好地拟合这类数据,提出0–1膨胀几何分布模型并进行客观贝叶斯分析.通过参数变换,得到Jeffreys先验和reference先验.设计后验分布的抽样算法,设置不同的样本量和参数真值,采用数值模拟方法对不同客观先验下的估计效果进行评估.

摘要：充分利用荧光放大检测信号的特性在不同的DNA结构上构建了逻辑与门和或门生物模型.在与门的设计中,以启动链和三链体形成寡核苷酸作为输入信号,当两个输入信号都存在时,溶液中的底物首先与启动链发生杂交链式反应;然后杂交链式反应得到的产物与三链体形成寡核苷酸结合形成三链结构;最后小檗碱将吸附至三链结构上,激发高背景荧光并将其作为输出信号.同样以启动链为输入信号,以高背景荧光为输出信号构造了或门.结合杂交链式反应、小檗碱和荧光标记技术的不同特性实现了对逻辑门输出结果的信号放大,使得实验结果易于检测且实验操作简单可行.

摘要：基于发夹结构DNA的循环杂交放大作用和圆环结构的稳定性,设计了一种类闭环双链DNA模型用于解决0-1背包问题。首先,通过碱基互补配对,将引发DNA固定在圆环DNA单链上形成类闭环双链DNA。然后,利用杂交链式反应技术,借助生物素和链霉亲和素的亲和性,将携带有大量拉曼信号分子的纳米金生物条形码结合到类闭环双链DNA上。最后,通过表面增强拉曼散射技术完成对可行解的筛选。

摘要：可满足性问题是经典的NP完全问题之一。本文建立了一个基于DNA链置换的可满足性问题的计算模型,可满足性问题的约束条件被映射成计算模型上的荧光个数,将可满足性问题中变量的两种取值(0和1)分别设计成不同的DNA链,通过DNA链置换反应,最后观察反应后的计算模型上荧光个数找出可满足性问题的可行解。该模型具有操作简单,结果便于观察和检测的优点。

摘要：DNA折纸术是一种全新的DNA自组装方法,具有可编程性、纳米可寻址性等优点,被广泛地应用于DNA计算中。利用DNA折纸术可折叠出特殊结构的特点,在DNA折纸基底上设计了一种求解可满足性问题的计算模型,该模型采用分子信标原理,通过观察荧光的明灭排除非解,从而找出可满足性问题的解。最后通过实例和模拟仿真表明了模型的可行性。

摘要：DNA步行者作为一类可执行复杂操作的新兴动态DNA纳米机器,可以在纳米尺度上以可控的方式在指定轨道内行走.文章将DNA步行者用于解决最小顶点覆盖问题,首先构造出全部顶点覆盖,用删除实验得到顶点覆盖的补集,再通过荧光探针N-甲基卟啉二丙酸(NMM)特异性识别G-四链体结构,产生荧光,最终得到最小顶点覆盖.该模型设计独特新颖,通用性好,操作简单,运行效率更高.