摘要：基于表示、业务逻辑和数据的三层软件体系结构已成为大规模分布式软件系统的基本模式。针对其结构灵活、可维护、易扩展的进一步需求,探讨了采用Web Portal实现表示层,采用工作流实现逻辑层的技术思路;在此基础上,为三层软件体系结构设计了一种通用、灵活的软件框架;最后,给出了作者实现的框架原型和用例。

摘要：目的:针对下一代测序数据量大、序列长度短的特点,研究数据分析和质量评估方法。方法:选择已发布的Illumina-Solexa平台测序数据为研究对象,通过MAQ软件将测序数据与人类全基因组序列进行比对,并以外显子区域为例,在位点水平对测序数据质量进行评估。结果:结合已有软件系统和本文自创线性算法,建立了一套包括比对、拼接在内的测序数据质量评估系统。比对分析后,发现原始测序序列共覆盖了127,113,378个位点,涉及24条染色体上的64868个外显子。其中,每个位点都被测到的外显子为0.50%,位点平均测序深度大于等于1的外显子为3.98%。结论:成功构建了基于Illumina-Solexa测序平台的数据分析和质量评估方法,其可适用于其它第二代测序平台。研究者可在质量评估的基础上完善测序试验设计,并进行SNP和突变筛选及后续功能性研究。