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检索条件"机构=中国疾病预防控制中心传染病预防控制所生物信息室"
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基于同源基因的病原菌鉴定和分型靶位点的功能基因组学研究
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中国科学:生命科学》2011年 第8期41卷 640-648页
作者:杜鹏程 张雯 刘翟 陈晨中国疾病预防控制中心传染病预防控制所生物信息室传染病预防控制国家重点实验室北京102206 中国科学院微生物研究所网络信息中心北京100101 
利用病原菌序列差异,对病原菌特定基因和位点进行检测,可以快速发现和鉴别病原菌的分类和特征,对传染病快速诊断和溯源具有基础性意义和重要价值.本文旨在覆盖中国重要传染病的103种病原菌,寻找各分类阶元中特有的同源基因,并从中挑选...
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卡介苗各亚株间Rv1985c和Rv1986基因缺失的研究
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中国医药指南》2013年 第15期11卷 1-1,3页
作者:张雯 张媛媛 陈晨中国疾病预防控制中心传染病预防控制所生物信息室北京102206 
目的明确卡介苗群体内在Rv1985c和Rv1986两个位点上的遗传差异。方法基于结核分枝杆菌设计引物,针对21株卡介苗标准株和临床株进行Rv1985c和Rv1986两个位点的PCR鉴定,鉴定基因的缺失情况。结果 21株卡介苗中10株缺失Rv1985c基因,11株缺...
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病原菌特异基因数据库系统的开发及应用
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中国预防医学杂志》2013年 第5期14卷 396-400页
作者:陈晨 杜鹏程 吴一雷 王海印 张雯 闫鹏程 张媛媛 陈禹保 于伟文中国疾病预防控制中心传染病预防控制所生物信息室传染病预防控制国家重点实验室北京102206 北京市计算中心 
利用前期研究获得的病原菌各分类水平特有同源基因,构建了病原菌特异基因数据库,采用四层架构模型和单向依赖结构构建了在线展示及查询系统,为科研工作者提供了病原菌特异基因基础数据。可通过简洁直观的方式进行查询和展示,为分型位点...
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生物在线生物信息分析系统的开发及应用
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疾病监测》2012年 第4期27卷 316-319页
作者:于伟文 杜鹏程 陈超 陈晨 吴一雷 张雯中国疾病预防控制中心传染病预防控制所生物信息室传染病预防控制国家重点实验室北京102206 北京市计算中心北京100094 
目的基于浏览器/服务器模式构建微生物在线生物信息分析系统,应用于传染病预防控制工作。方法将目前在传染病病原微生物研究和传染病分子诊断、溯源中常用的基于客户端/服务器模式的一些开源的或免费提供使用的分析软件,采用远程桌面、...
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基于16S rDNA数据库的细菌在线分类鉴定平台的构建
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疾病监测》2013年 第3期28卷 236-240页
作者:陈晨 彭珂 王海印 杜鹏程 张雯 张媛媛 于伟文中国疾病预防控制中心传染病预防控制所生物信息室传染病预防控制国家重点实验室北京102206 中国科学院北京基因组研究所信息室 
目的利用且兼并简化现有16S rDNA基础数据库,建立可用于传染病预防控制及感染性疾病的临床诊疗的细菌快速分类的核糖体基因数据库,构建快速鉴定在线分析平台。方法收集整理已有的包括RDP、GenBank、SILVA、HOMD等国际公认、公开的16S r...
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