摘要：巢蛋白（Nestin）属于中等纤维基因家族，在增殖较快的神经前体细胞中表达。该基因被克隆后，作为神经前体细胞的标记基因得到广泛应用。本文中，我们根据小鼠巢蛋白cDNA序列，设计了一对引物，在确定了反转录PCR反应的最佳反应条件后，详细地考察小鼠巢蛋白mRNA在中枢神经系统发育过程中的表达规律，发现巢蛋白mRNA在小鼠第10天胚胎的脑中表达，到第14天表达量达到最高，后下降；在出生后的小脑中，表达也有类似规律，出生后第5天，表达量最高，其后下降。在成年小鼠各组织中，均未检测到巢蛋白mRNA的表达。

摘要：在基于靶蛋白结构的多肽分子设计中，药效假说是从头设计方法的基本前提。虽然该假说是否成立已有不少议论，但尚未见到系统分析的报道。通过对８ 个蛋白质复合物界面做了氨基酸模拟图谱，并从模拟图谱的结构偏差与能量分量的关系，对药效假说的适用条件进行了讨论。同时也给出一个ＨＩＶ－ １ 蛋白酶及抑制剂复合物的功能图谱。从所得结果来看，药效假说在以氨基酸为药效基团时，尽管不少情况下仍然有效，但不是普遍成立的。

摘要：利用活性位点嫁接设计新的功能蛋白质的方法需要功能模体和蛋白质骨架两种构件。出于活性位点嫁接的需要，我们构建了一个蛋白质骨架库，且提供搜索与功能模体相配骨架的工具及其评估方法。并用两个活性位点的嫁接进行了检验。

摘要：Ribozyme是一类具有生物催化功能的RNA,它能定点切割RNA靶分子,从而达到有效地阻断基因表达的目的。本文依“锤头结构”原理设计合成了一个38个核苷酸的Ribozyme,能在体外定点切割甲型肝炎病毒的RNA片段(链长为123核苷酸残基,切削点对应于甲肝病毒RNA的559位)。测定了切割反应与温度、Ribozyme浓度和底物浓度的关系,其Km和kcat分别为0.63μmol/L和0.12min^(-1)。Mg^(2+)或Ca^(2+)均可作为参与该催化反应所必需的金属离子。

摘要：肽分子设计的命题,基本思想是以特定的构象单元与功能的关系为指导,设计具有特定功能的多肽,它不仅可以用于进一步揭示天然蛋白质的结构原则及卷曲机制,而且可以指导药物合成及工业产品的设计。本文旨在介绍一些设计形成特定构象单元的多肽的进展,并从中归纳出一些设计原则。

摘要：用一维序列模体和三维结构模体刻画与识别蛋白质功能区是蛋白质功能预测和分子设计中的重要课题．目前三维模体的提取与搜索均以残基为单位进行，特异性有限．鉴于残基的功能基团才是其发挥功能的关键要素，提出以功能基团为单位来表征三维模体（称为功能基团三维模体），并发展了相应的搜索算法，用于阐释蛋白质功能的结构基础以及预测未知蛋白质的功能．以从胰蛋白酶（ＰＤＢ代码为１ｍｃｔ）中提取的“三联体和氧穴”功能基团三维模体及其搜索为例，在整体结构极不相似的胰蛋白酶。枯草杆菌蛋白酶和α／β水解酶中均搜索到了此功能基团三维模体，为三者具有相似催化机制提供了解释．对一些具有“变异三联体”的酶亦能用此功能基团三维模体给予识别．对蛋白质结构库的搜索结果充分展示了其在功能预测中的应用．与其他三维模体搜索及序列模体搜索的结果相比较表明，功能基团三维模体是蛋白质功能区的更好的表示，在蛋白质功能预测中有更高的灵敏度。

摘要：选择小鼠腺苷脱氨酶ｍＲＮＡ做为靶ＲＮＡ系统，采用计算机辅助设计，人工设计了能特异性定点切割小鼠腺苷脱氨酶ｍＲＮＡＲｉｂｏｚｙｍｅ，命名为ＲＤＡＲｂ２６２，ＡＤＡＲｂ４５５，ＡＤＡＲｂ５８３和ＡＤＡＲｂ８６２，它们分别切割靶ＲＮＡ上不同切点。通过计算机基因库检索，在已知上鼠基因中，无其它基因ｍＲＮＡ含有靶ＲＮＡ切点两翼碱基序列的同源序列。经人工合成和仁外转录得到了Ｒｉｂｏｚｙｍｅ分子和靶ＲＮＡ分子。

摘要：人乳头状瘤病毒(human papillomavirus,HPV)是一类感染人体的皮肤粘膜并引起乳头状瘤病变的病毒。目前发现的HPV已有63型,不同型的HPV引起人体不同部位的病变。HPV 16主要与生殖系统的肿瘤尤其是子宫颈癌有密切关系。

摘要：锤头结构Ribozyme是已知一类链长较短并易于设计的Ribozyme.我们针对苜蓿夜蛾核多角体病毒(AcNPV)多角体蛋白mRNA片段而设计的Ribozyme经体外切割试验证明是有效的.利用这一模型我们研究了Ribozyme与底物的相互作用对于切割反应的影响.结果指出Ribozyme与底物的相互作用越强则反应的最适温度(T_(opt))越高,反之亦然;将Ribozyme与底物的配对由RNA·RNA配对改为RNA·DNA配对能使它们的相互作用减弱.同时,我们观察到某些反应的T_(opt)的降低比T_m降低大得多.从动力学分析看,T_(opt)

摘要：人肿瘤坏死因子(humantumornecrosisfactor,hTNFα)的生物学活性是由两种不同受体(TNFR1/R55和TNFR2/R75)介导的。为了了解hTNFα与这两种受体相互作用的异同之处,以便指导hTNFα的蛋白质工程改造,根据LT与R55受体胞外区复合物的晶体结构及hTNFα和LT与两种受体结合的相似性,预测了hTNFα与其两种受体胞外区形成复合物的三维结构模型。并根据所得的计算机模型,分析了hTNFα和受体结合前后的溶剂可及表面积的变化,以及受体与hTNFα之间可能形成的氢键、明显的静电作用和疏水作用。然后根据模型对hTNFα的结构-功能关系进行了分析,并以此为基础设计了几个新的hTNFα突变体。