摘要：钙离子和镁离子是生物细胞中重要的二价阳离子,对生物膜结构保持和功能行使发挥重要作用。但至今,对两种阳离子在不同浓度下与大肠杆菌内膜相互作用的认识仍存在局限。本文采用动态光散射(DLS)、zeta电势实验、全原子分子动力学模拟(AA-MD),定量研究了不同浓度的钙离子和镁离子对混合磷脂双分子层膜(1-棕榈酰基-2-油酰基-sn-丙三基-3-磷酸乙醇胺(POPE):1-棕榈酰基-2-油酰基-sn-丙三基-3-磷酸甘油(POPG)的摩尔比为3:1)模拟的大肠杆菌内膜的影响。DLS结果表明,在0和1 mmol·L-1钙离子或镁离子溶液中,POPE/POPG脂质体为均匀的单分散体系。当两种离子浓度分别提高到5–100 mmol·L-1范围时,单室脂质体间发生脂分子聚集或脂质体融合事件。Zeta电势数据表明,钙离子或镁离子对电负性的POPE/POPG脂质体均有电荷反转效果。AA-MD模拟计算结果表明,当模拟时间超过100 ns时,各浓度的钙离子稳定地吸附在磷脂双分子层膜上,而镁离子动态地吸附/解吸附于磷脂膜,这些结果与DLS和zeta电势实验基本吻合。同时,通过计算径向分布函数,分析了0、5、100 mmol·L-1浓度溶液中POPE和POPG的磷酸、羰基和羟基基团氧原子的第一配位壳层中的钙离子或镁离子的平均配位数目,结果表明两种离子主要结合在POPE和POPG电负性的磷酸基团上,因此可以解释DLS实验中钙离子或镁离子对POPE/POPG脂质体的电荷反转现象。另外,随着离子浓度的增高,钙离子减小了磷脂双分子层膜的单个磷脂面积,同时使膜的厚度增大,而镁离子对膜的两种参数影响较小。同时,相同浓度条件下两种离子对膜中磷脂分子的取向影响不同。这些模拟结果可在原子水平上解释DLS和zeta电势实验中钙离子和镁离子对POPE/POPG脂质体的不同影响。本文的实验和分子动力学模拟结果可以解释一些与二价阳离子调控相关的生物学过程,例如,膜融合。

摘要：配体和受体之间的相互作用研究有助于阐明配体的作用机理,为合理药物设计提供线索.新发展的拉伸分子动力学模拟使原来在微秒至秒时间范围内发生的生物化学过程可以在纳秒尺度内进行模拟,从而动态再现目前实验所无法提供的配体与受体的结合或解离过程.文中通过详细介绍拉伸分子动力学方法对石杉碱甲与乙酰胆碱酯酶结合和解离过程以及HIV-1逆转录酶和其非核苷酸类似物抑制剂a-APA解离过程的成功模拟,综述拉伸分子动力学模拟在研究配体和受体相互作用中的应用.

摘要：利用基于α-溶血素(α-HL)的纳米通道单分子检测技术在单分子水平上探测位于肿瘤抑制蛋白P53 DNA结合域的多肽分子(P53-P)与含有p21waf1/cip1基因结合域的双链DNA(B40)之间弱相互作用.在电场力的作用下,单个P53-P/B40复合物被α-HL纳米通道捕获并限制在其前庭中.通过空间限域作用,P53-P与B40之间的弱相互作用被放大为具有显著电压依赖性的复合物-α-HL间强烈的相互作用,从而产生极易分辨的离子流特征阻断信号.统计分析特征阻断信号显示P53-P与B40之间的弱相互作用使得B40产生微小的构型变化.分子对接模拟进一步证明,P53-P能够插入B40的小沟并使得小沟间距变窄.因此,基于α-HL的纳米通道单分子检测技术可以作为研究单个生物大分子间弱相互作用的超灵敏分析方法.

摘要：目的:研究治疗获得性免疫缺陷综合症药物raltegravir的合成工艺。方法:经过成氨基腈,苄氧羰基保护氨基,从腈成氨肟,环合成二羟基嘧啶,氮甲基化,微波催化成酰胺,脱保护,再经酰化缩合成酰胺等8步反应制备raltegravir。结果:经过对合成工艺的改进得到了目标产物,其结构经1H NMR,13C NMR,LR-MS和HR-MS确证,总收率为12.0%。结论:此方法原料易得、操作简单、成本低。

摘要：Drug discovery is a costly and time-consuming process, with very few novel molecular entities approved for clinical use today. With the advancement of computational chemistry, integrated X-ray crystallography and nuclear magnetic resonance spectroscopy technology, more and more potential therapeutic agents for the treatment of human diseases are discovered. Furthermore, multiple medicinal chemistry approaches have been developed in support of early drug discovery. However, there is still much can be done in the early phase of drug discovery to improve the chances of success of a drug candidate. This paper reviews the discovery and evaluation of new chemical entities in the early stages of drug development.

摘要：雌激素受体属于核受体超家族成员,是一类重要的核转录因子,它在生殖系统、骨组织、心血管和中枢神经系统中发挥着重要的生理作用,是治疗骨质疏松和乳腺癌的重要药物作用靶标。已知的雌激素受体有α和β两种亚型,它们由两个不同的基因编码组成。选择性雌激素受体调节剂是一类在不同的组织细胞中对雌激素受体发挥不同调节作用的化合物,用于治疗绝经后妇女的骨质疏松和乳腺癌等。对近年来有关这两方面的研究情况进行综述。

摘要：目的探讨肉苁蓉苷F(Cis)抑制C2C12细胞成脂分化的效应及可能机制。方法C2C12细胞随机分为空白组、模型组、Cis低(1μmol/L)、中(10μmol/L)、高剂量(100μmol/L)组。CCK8检测细胞增殖率;油红O染色观察细胞内脂滴形成的动态变化;qRT-PCR检测生肌决定因子(Myod)、过氧化物酶体增殖激活受体(PPARγ)mRNA表达水平,Western Blot检测AMP依赖的蛋白激酶(AMPK)、乙酰辅酶A羧化酶(ACC)、结蛋白(Desmin)蛋白表达。结果各剂量Cis作用72h对C2C12细胞无明显毒性。与空白组相比,模型组细胞内脂滴在d8时显著增加,PPARγmRNA和ACC蛋白表达明显升高,Myod mRNA和AMPK、Desmin蛋白表达明显降低(P<0.05)。与模型组相比,Cis干预后,C2C12细胞内脂滴明显减少,PPARγmRNA表达下调,Myod mRNA表达上调,10μmol/L Cis作用8天可显著下调ACC蛋白表达,上调AMPK、Desmin蛋白表达(P<0.05)。结论Cis可能通过调控AMPK/ACC通路抑制C2C12细胞成脂分化。

摘要：人工智能(Artificial Intelligence,以下简称为Al)是指计算机或机器展现出的智能,通过模仿人类思维来解决问题和作出决策,它不同于包括人类在内的动物所表现出的自然智慧。人工智能的概念在1956年被首次提出,随着算力和算法的不断更迭,人工智能技术也在越来越多的领域斩露头角。

摘要：核受体的研究近几年已有飞速的发展。LXRa(Liver X Receptor a)是一种与脂类代谢有关的核受体。研究发现LXRa的靶基因具有调节脂类的吸收、运输、转化和生物合成的功能,此外,LXRa在糖类的代谢等方面也有重要的调控作用。研究结果表明LXRa与动脉粥样硬化的发生有非常密切的关系。目前利用LXRa为靶标进行抗动脉粥样硬化药物筛选已经成为一个重要的研究方法。

摘要：目的建立一个基于荧光素酶报告基因系统的肝细胞核因子4α(HNF4α)活性检测系统,筛选可调控HNF4α活性的小分子化合物。方法采用亲和层析法纯化HNF4α蛋白,行蛋白热迁移实验检测相关DNA片段及小分子化合物与HNF4α蛋白的直接相互作用。分别构建含有3个拷贝和9个拷贝的Ninjurin1(NINJ1)基因启动子区HNF4α反应元件的荧光素酶报告基因质粒pGL3-NINJ1-3p和pGL3-NINJ1-9p,转染肝癌细胞,采用荧光素酶报告基因法检测肝癌细胞内HNF4α转录活性的改变,qPCR检测小分子化合物木犀草素或阿尔维林处理后肝癌细胞中HNF4α及下游基因的表达情况,荧光素酶报告基因法检测小分子化合物处理后细胞内HNF4α转录活性的改变。结果蛋白热迁移实验证实,NINJ1基因启动子区HNF4α的DNA结合片段可与HNF4α蛋白结合。在过表达HNF4α的肝癌细胞中,pGL3-NINJ1-3p和pGL3-NINJ1-9p均可检测到肝癌细胞中HNF4α活性的改变,且pGL3-NINJ1-9p较pGL3-NINJ1-3p的检测灵敏度更高(P<0.01)。木犀草素和阿尔维林与HNF4α蛋白存在直接相互作用,分别下调和上调HNF4α靶基因;pGL3-NINJ1-9p可检测到木犀草素和阿尔维林对HNF4α转录活性的影响。结论利用报告基因载体pGL3-NINJ1-9p成功建立了HNF4α活性的检测系统,为筛选调控HNF4α活性的小分子化合物等提供了基础工具。