摘要：为研究人工抗菌肽MA-D4的高效制备方法 ,检测其体外生物活性,探索该抗菌肽作为新型抗菌药物的应用前景和开发潜力,本试验设计人工抗菌肽MA-D4的氨基酸序列,并采用大肠杆菌偏嗜性密码子设计编码该抗菌肽的核苷酸序列;采取重叠区扩增基因拼接法合成目的基因,构建原核表达载体,并转化至大肠杆菌中诱导表达;表达产物经肠激酶酶切处理和镍离子亲和层析纯化后,进行体外生物活性检测。结果表明,人工抗菌肽MA-D4具备较强的广谱抗菌活性,可抑制革兰氏阳性菌和阴性菌,同时不具有溶血活性。综上所述,人工抗菌肽MA-D4在食品防腐、疾病治疗等方面具有良好的应用前景,极具开发潜力。

摘要：桑脉带相关病毒Mulberry vein banding-associated virus (MVBaV)是广西桑树病毒病的主要病原病毒。本研究根据MVBaV基因组的核外壳蛋白(nucleocapsid protein, N)基因序列设计了5组引物,筛选获得了1组有效引物,建立了该病毒的反转录环介导等温扩增技术(reverse transcription loop-mediated isothermal amplification, RT-LAMP)检测方法。该方法能在恒温条件(63℃)下1 h内检测MVBaV,其灵敏度是RT-PCR检测方法的10倍。对6个田间样品进行RT-LAMP检测,其结果与RT-PCR的结果一致。该方法可直接在反应管中加入SYBR GreenⅠ,通过颜色变化即可判定结果,无需经过琼脂糖电泳或专门仪器,具有灵敏、快速和特异性好的优点,可应用于MVBaV的快速诊断及其田间监测。

摘要：本文建立了甘蔗花叶病毒(SCMV)RT-LAMP可视化检测方法。针对甘蔗花叶病毒的cp基因保守区设计引物,建立并优化了特异性检测甘蔗花叶病毒的高灵敏度RT-LAMP反应体系。所优化的SCMV RT-LAMP方法灵敏度高,对于SCMV cp基因的最低检测量为20 fg,可从简单提取的甘蔗总RNA中检出病毒核酸。研究结果表明所建立的针对SCMV的RT-LAMP体系具有特异性强、灵敏度高、操作简单和快速的特点,在实际检测中展示出良好的应用前景。

摘要：【目的】克隆木薯腺苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶(AGPase)小亚基基因cDNA全长序列,为木薯高淀粉品种的分子育种提供依据。【方法】根据木薯AGPase小亚基基因已知片段设计特异性引物,以木薯根、茎、叶为材料,利用PCR及RACE克隆木薯AGPase小亚基基因cDNA全长序列。运用生物信息学方法对其核苷酸序列和推导氨基酸的理化性质、蛋白质三级结构进行系统分析。【结果】克隆获得木薯淀粉合成关键酶AGPase小亚基cDNA全长1566bp,其中包括1566bp的完整ORF,编码一个含521个氨基酸的多肽。其理论蛋白质分子量57.01kDa,等电点6.1,呈酸性。多重序列比较分析结果显示,木薯淀粉合成关键酶AGPase小亚基核苷酸序列与蓖麻、麻风树和杨树相应序列的相似性分别为87%、87%和86%。结合系统进化树分析结果推测,木薯淀粉合成关键酶AGPase小亚基在不同物种及进化过程中具有高度的保守性。蛋白三级结构分析结果表明,木薯AGPase小亚基蛋白具有15个α-螺旋、24个β-折叠和多个转角。【结论】木薯AGPase小亚基基因cDNA全长序列与蓖麻、麻风树和杨树等具有较高的同源性。

摘要：目的对罗汉果甜苷V生物合成途径的关键酶法呢基焦磷酸合成酶(Farnesyl pyrophosphate synthase,FPPS)基因的全长cDNA序列进行克隆,为研究罗汉果甜苷V生物合成与基因调控奠定基础。方法根据植物FPPS基因保守功能域设计简并引物,通过PCR和RACE方法克隆罗汉果FPPS基因的全长cDNA。结果获得罗汉果FPPS(SgFPPS)基因的全长cDNA序列共1 354个核苷酸,包含一个1 026核苷酸的开放阅读框架(open reading frame,ORF),cDNA编码的蛋白包含342个氨基酸,推断蛋白质相对分子质量为3.92×104。NCBI Blastx结果显示,SgFPPS基因编码的蛋白与苹果树来源FPPS具有最高同源性,氨基酸一致度达85.1%。SgFPPS具有异戊烯基转移酶的5个典型保守功能域。进化树分析结果显示,SgFPPS基因与苹果树的FPPS具有较近的亲缘关系。结论首次克隆SgFPPS基因的全长cDNA序列,为分析SgFPPS基因表达特性及其在罗汉果甜苷V生物合成中的功能奠定基础。

摘要：目的明确PERV的整合是否影响HEK293细胞中HERV-W各基因表达水平。方法根据GenBank中登录的基因序列,分别设计HERV-W gag、HERV-W pol、HERV-Wenv、syncytin-1和humanβ-actin引物,并分别建立SYBR Green Ⅰ荧光定量PCR检测方法,用于检测HEK293、HEK293-PERV中各基因mRNA的表达。结果本研究建立的检测方法均具有良好的特异性、敏感性和稳定性,标准曲线的相关系数大于0.99,扩增效率介于95%~110%,可用于检测。结论检测结果经2^(-△△Ct)分析后,发现与对照相比,PERV整合后的HEK293-PERV中HERV-Wgag、HERV-Wpol、HERV-Wenv和syncytin-1 mRNA相对表达量分别升高37.08倍、42.56倍、2.49倍和13.17倍,为进一步明确PERV在异种移植中的安全性提供参考。

摘要：【目的】分析叶蝉EST序列信息，为其分子标记体系建立、遗传图谱构建及相关致害基因挖掘奠定基础。【方法】利用生物信息学技术对NCBI数据库中的4种叶蝉亚种EST序列进行SSR基序分析与统计，并对筛选出的SSR基序区段进行引物设计，开发出SSR标记。【结果】11044条叶蝉EST序列的总长为5866kb。按照引物筛选设定的参数，筛选获得1946条含有SSR基序的EST序列，占总EST序列的17．6％；其中包含2230个SSR基序并全部获得相应的SSR引物，平均间距为2．63kb。在2～5个核苷酸重复中，3个核苷酸重复为优势基序，占总基序的77．3％，尤以AAT类最丰富，占3个核苷酸重复总数的40．7％；双核苷酸重复中，AG类所占的比例最大，为39．1％。【结论】从叶蝉EST序列中筛选获得2230个SSR引物，以3个核苷酸重复基序所占比重最大。

摘要：基于NCBI数据库中固氮菌nif D基因的核苷酸序列,设计并合成特异性引物,以甘蔗内生固氮菌Klebsiella variicola DX120E为模板,通过PCR方法获得了Klebsiella variicola DX120E nif D基因的ORF;以p ET30a(+)为原核表达载体,构建重组表达质粒p ET30a-nif D。将正确的重组质粒转入原核表达菌株BL21(DE3),在28℃培养条件下经1 mmol/L的异丙基硫代半乳糖苷(isopro-ply-β-D-thiogalactopyranoside,IPTG)诱导表达;通过SDS-PAGE电泳检测融合蛋白表达情况。结果表明,本研究克隆得到甘蔗内生固氮菌Klebsiella variicola DX120E nif D基因的ORF为1 452 bp,编码483个氨基酸;原核诱导表达后经提纯和质谱鉴定,该蛋白等电点为5.90,分子量为53.87 k D,与预期大小一致。该蛋白在原核表达系统中以包涵体的形式成功表达。利用Ni柱亲和层析方法进一步获得了纯度较高的重组蛋白,为今后单克隆抗体的制备、蛋白质印记杂交检测(Western Bloting)等研究奠定了基础。

摘要：蛋白质组学已成为研究生物学过程及直接描述细胞和组织变化的有力手段。双向电泳结合生物质谱技术是蛋白质组学研究中的最常用的蛋白质分离和鉴定技术之一。该项技术是生物技术专业本科生必须掌握的一门实验技术。通过双向电泳-MALDI质谱分析的蛋白组学本科教学实验的设计,建立了完善的本科教学实验方案,让大型仪器全面支撑本科教学实验,进一步提高了大型仪器的利用率。

摘要：【目的】探索南方水稻黑条矮缩病毒(SRBSDV)和水稻齿叶矮缩病毒(RRSV)的分子检测技术,了解两种病毒在广西的分布,为生产上开展两种病害的防治奠定基础。【方法】用RT-PCR技术检测采自广西各地的水稻、杂草及稻飞虱样品;用CF-11纤维素粉提取水稻茎叶组织中的dsRNA,1.5%琼脂糖凝胶电泳观察dsRNA图谱。【结果】从水稻、稗草、五节芒、李氏禾和白背飞虱样品中获得850bp左右的SRBSDV序列,从水稻和褐飞虱样品中获得700bp左右的RRSV序列;首次从五节芒和李氏禾中检测到SRBSDV。SRBSDV单独侵染、SRBSDV和RRSV复合侵染可见8条dsRNA条带,但带谱不一致;RRSV单独侵染可见5条dsRNA带。在供检测的181株水稻样品中,除了来自北海、贵港和梧州市的水稻样品外,其余样品均检测到SRBSDV;除了来自梧州、贺州、玉林、贵港和来宾的水稻样品外,其余样品均检测出RRSV;其中带SRBSDV的样品数占44.8%,带RRSV的样品占21.5%,两种病毒复合感染占11.0%。【结论】研究设计的特异性引物能用于RT-PCR检测SRBSDV和RRSV、水稻样品提取dsRNA能快速直观地鉴定SRBSDV、RRSV单独感染及混合感染水稻。用设计的引物首次检测出SRBSDV的两种新寄主五节芒和李氏禾。