摘要：参考GenBank中禽呼肠孤病毒S3基因序列设计一对引物,以禽呼肠孤病毒内蒙古分离株(C-98)基因组RNA为模板,应用RT-PCR方法获得病毒的S3基因,并克隆到pMD19-T载体后测序。应用计算机软件将所测定序列与参考毒株ARV 176、ARV S1133、ARV 138的S3基因序列进行比较,核苷酸同源性分别为99.8%,99.6%,87.7%,推导其氨基酸同源性分别为99.5%,98.9%,94.8%。应用PHD程序和DNAStar软件,对S3基因所编码的σB蛋白结构进行预测,结果表明,σB蛋白为结构紧密的球状蛋白分子。

摘要：提取鸡病毒性关节炎病毒(AVAV)内蒙古分离株(C-98株)总RNA,参考GenBank中禽呼肠孤病毒(ARV)S1133株S1基因序列设计了2对引物,应用RT-PCR技术扩增了病毒S1基因,将S1基因cDNA克隆到pGEM-T Easy载体后测序。将测定序列拼接后与参考毒株ARV-176、ARV-138、ARV-S1133、MDRV-YJL的S1基因序列进行了比较。结果显示,AVAV C-98分离株的S1基因与强毒株ARV-176株的同源性最高,达99.9%;与MDRV-YJL的同源性为99.3%,与弱毒疫苗株ARV-S1133的同源性也达97.9%;与ARV-138株的同源性最低,为81.2%。表明,AVAV C-98株与参考毒株的差异较小,与疫苗株ARV-S1133有很高的同源性。

摘要：本试验对鸡病毒性关节炎病毒(AVAV)包头地区分离株(B-98株)进行总RNA的提取。参考GenBank中ARV-S1133株S1基因组序列设计两对引物,应用RT-PCR技术特异性地扩增病毒的S1基因的cDNA片段,将S1基因cDNA克隆到pGEM-TEasy载体后进行测序。ARV S1基因包含3个开放阅读框(ORF1,ORF2和ORF3),分别编码P10、P17和SigmaC蛋白。应用计算机软件把所测得的序列与参考毒株ARV-176,ARV-138,ARV-S1133,Muscovy duck reovirus strain YJL(MDRV-YJL)的S1基因3个阅读框的核苷酸序列进行比较分析。结果表明:AVAV B-98株与ARV-176株P10、P17和SigmaC蛋白的核苷酸序列的同源性最高,与ARV-S1133株、MDRV-YJL株的同源性次之,与ARV-138株的同源性最低。

摘要：对三株布鲁氏菌内蒙古分离株的omp31基因进行克隆与序列分析。参照GenBank中布鲁氏菌的omp31基因序列,设计一对特异性引物,用PCR方法扩增布鲁氏菌omp31基因,对PCR产物进行克隆、测序,将测定序列拼接后与GenBank中获得的参考毒株omp31基因序列进行了比较。结果显示,三株布鲁氏菌分离株的omp31基因开放阅读框核苷酸序列同源性均为100.0%;与Brucella ceti B14/94、Brucella neotomae 5K33、Brucella suis1330三个参考毒株omp31基因核苷酸序列同源性最高,为100.0%;与Brucella canisRM6/66、Brucella melitensis183、Brucella melitensis16M三个参考毒株omp31基因核苷酸序列同源性为99.9%;与Brucella melitensis Rev1参考毒株omp31基因核苷酸序列同源性为99.6%;与Brucella ovis ATCC25840参考毒株omp31基因核苷酸序列同源性最低,为98.8%。

摘要：参考禽呼肠孤病毒s1133株（GenBank）L1基因序列设计3对特异性引物，采用RT—PCR方法对禽呼肠孤病毒内蒙古分离株C-98的L1基因进行了克隆和序列测定。结果表明：获得的C-98L1基因全长3959bp，其中包括21bp的5’非编码区和56bp的3’非编码区，阅读框位于5’端第22位核苷酸与3’端第3903位核苷酸之间。将C一98株与国内外禽呼肠孤病毒群和哺乳动物呼肠孤病毒群的不同分离株进行序列比较，结果显示：C-98与台湾地区分离株919和美国分离株1733、2408、S1133亲缘关系最近，其核苷酸同源性分别为99．8％、99．7％、99．7％、99．4％；与哺乳动物呼肠孤病毒L3基因核苷酸及其编码的氨基酸同源性较低，为43％～45％。

摘要：根据已发表的牛传染性鼻气管炎病毒(GenBank NC_001847)gD基因序列设计1对特异性引物,采用PCR方法扩增出内蒙古分离株gD基因的cDNA,重组到PMD19-T载体中,并进行克隆及序列测定。经限制性内切酶谱分析和序列分析,证明所克隆的cDNA为gD基因。该基因片段长1 559bp,包含1个由1 251bp组成的完整开放阅读框(ORF),共编码417个氨基酸。序列比较和系统进化树分析结果显示:内蒙古分离株gD基因与GenBank上已发表的其它分离株相比,核苷酸同源性在99.1%～99.9%之间,其推导的氨基酸同源性在90..6%～99.8%之间,在系统进化树中内蒙分离株与AJ004801株亲缘关系较近,属于同1个分支。生物信息学分析表明,该基因编码的蛋白具有亲水性,有很强的抗原性,有3个潜在糖基化位点,可能存在2个蛋白激酶C磷酸化位点,存在4个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点。

摘要：参考GenBank发表的禽呼肠孤病毒M1基因序列设计2对引物(M1-1、M1-2)。应用RT-PCR扩增禽呼肠孤病毒内蒙古分离株C-98的M1基因序列。将纯化的目的基因片断与PMD19-T载体连接并转化DH5α感受态细胞,将经鉴定为阳性的重组菌送生物工程公司测序。结果表明,ARVC-98株M1基因片段长2283bp,具有完整的开放性阅读框架,编码732个氨基酸残基的μ1蛋白。ARVC-98分离株M1基因与ARV参考毒株M1的核苷酸同源性为89.1%～99.7%,与哺乳动物M1基因序列同源性较低,约为28%。

摘要：参考GenBank发表的牛疱疹病毒Ⅰ型全基因序列设计gE基因PCR扩增引物,以牛传染性鼻气管炎病毒内蒙古分离株NM06提取的DNA为模板,运用PCR的方法扩增gE基因,扩增产物经克隆、序列测定和拼接,结果表明:测定序列全长为2086bp,包含gE基因1793bp,其中有1728bp组成的完整开放阅读框,编码576个氨基酸。将NM06株gE基因序列与GenBank发表的参考毒株核苷酸序列相比,与4株BHV-1病毒的同源性在99.3%～99.9%;与2株BHV-1.1型分离株同源性高达99.5%、99.6%;与BHV-1.2型分离株同源性为93.4%。从进化树中也可以看出:NM06株与BHV-1.1型分离株属于同一个进化分支,而BHV-1.2BH83株属于另一个进化分支,可以推测IBRVNM06分离株属于BHV-1.1型。NM06株与牛疱疹病毒5型N569病毒的同源性为82.9%,与鹿疱疹病毒2型Norway4病毒的同源性为72.6%。