摘要：样点识别是生物芯片信息处理的基础。本文通过分析基因芯片的图象特征,提出了基于变形模板技术的基因芯片杂交样点自动识别方法。以芯片设计点样阵列为模板,建立了芯片杂交样点的变形模板模型,用多个参数表征了模板的平移、旋转和缩放。结合图象的特征设计了变形模板的能量函数,采用遗传算法搜索变形模板,实现了变形模板与杂交样点的最佳匹配。实验结果表明,该方法具有很好的稳健性和较快的收敛速度,能够准确识别杂交样点。

摘要：SNP位点选择是是国境口岸致病微生物基因芯片检测探针设计的关键环节,目前主要依靠手工完成,严重影响着检测速度和检测质量。我们提出了一种基于遗传算法的SNP位点的自动选择方法,该方法运用粗糙集理论评估SNP位点组合的分类能力,综合与检测实验密切相关的设计指标,采用遗传算法进行优化搜索。实验结果表明,该方法具有很好的稳健性和较快的收敛速度,能够准确地寻找致病微生物的SNP位点组合,为大规模的检测基因芯片探针自动设计提供了快速可靠的途径,缩短了国境口岸致病微生物的检测时限,提高了检测结果的准确性。

摘要：能力验证作为一种实验室质控手段,目前受到越来越多的重视和应用。由于其应用范围和影响的不断扩大,能力验证活动本身的质量控制也成为新的研究点。本文在总结已开展植物病原真菌领域能力验证项目的基础上,根据植物病原真菌检测特点结合能力验证活动要求,梳理出在植物病原真菌领域开展能力验证活动项目设计思路及注意事项。为同行在该领域开展能力验证项目提供参考。

摘要：现有的动物疫病诊断技术多是针对单一病原检测,而动物疫病的流行通常是多种病原混合感染,目前的诊断技术不能很好地满足国境口岸快速、高通量检疫的需求,一直以来多重检测技术的研究是动物疫情监测、疫病控制领域关注的焦点。本试验在前期猪病混合感染诊断研究基础上,进一步利用多重连接探针扩增(MLPA)技术,以蓝舌病病毒(BTV)、牛传染性鼻气管炎病毒(IBRV)、牛病毒性腹泻病毒(BVDV)、牛地方流行性白血病病毒(EBLV)和口蹄疫病毒(FMDV)为研究对象,分别设计这5种牛病毒的MLPA探针,将这5种探针混合,建立可以同时检测这5种病毒的MLPA扩增方法。特异性试验表明:每种病毒的探针都是特异的,只能识别各自的目的片段,不能扩增出其他相关病毒,探针之间也不存在交叉反应;敏感性试验结果表明:5重MLPA扩增的最低检测限可以达到单个病毒核酸的2 000个拷贝。经过对136份临床样品的检测,该方法与现有荧光PCR方法的符合率达到100%,能够正确地检测出每份阴、阳性样品及混合感染样品。本研究建立的5种病毒MLPA检测方法可以实现1次采样,1次分析,同时检测5种牛病毒的目的,该技术特异性强、敏感性高,加之其多重性检测的优势,有望成为未来疫病检测的新方向。

摘要：环介导恒温扩增技术（LAMP）是一种新型核酸扩增技术,是依赖于靶目标上6个区域的4条引物和一种具有链置换活性的DNA聚合酶Bst的作用,在60℃-65℃恒温条件下1 h之内即可完成的基因扩增技术。该技术虽然起步较晚,但发展迅速,目前在很多领域的研究和应用已经取得很大进展。论文从技术原理、引物设计、反应机制和特点等方面了介绍了环介导恒温扩增技术,并就该技术在动物细菌性病原微生物、病毒和寄生虫检测中的应用做了介绍。

摘要：能力验证样品的制备是实验室病原核酸检测能力验证的难点和核心内容,本研究以伪狂犬病病毒南阳株细胞培养物为材料,通过高温处理的方式灭活病毒,研制了伪狂犬病病毒核酸检测的能力验证样品,经均匀性和稳定性检验证实样品达到中国合格评定国家认可委员会对能力验证样品的要求。利用能力验证样品,设计和实施了"BIQTC-2013-01《猪伪狂犬病病毒核酸检测》能力验证计划",共有7家实验室参试,验证满意率达100%。伪狂犬病病毒核酸检测能力验证样品的研制和在能力验证计划中的应用,为评估我国各级实验室伪狂犬病病毒核酸检测的能力提供了较有价值的借鉴和参考。

摘要：玉米内州萎蔫病是北美玉米生产上的严重病害之一,为预防其传入我国,利用人工注射接种的方法模拟自然感病的玉米籽粒,通过Clavibacter michiganensis不同亚种的转录间隔区序列,设计了特异性的TaqMan-MGB探针,将Clavibacter michiganensis ***(Cmn)的半选择性培养基sCNS和特异性的探针结合,建立了进出境玉米种子上Cmn的Bio-real-time PCR检测方法,该方法可以检测到105粒玉米种子中含有一粒感病籽粒(带菌量为1.2×106 CFU/粒)的种子样品,可以应用于实际检测。

摘要：为了解国内蓝舌病病毒(bluetongue virus,BTV)核酸检测的整体水平,督促实验室保持和提高BTV核酸检测的能力,设计和实施了"CNCA-15-A02《蓝舌病病毒核酸检测》能力验证计划"。本次能力验证制备了BTV阴性,强阳性和弱阳性样品。无菌采集健康山羊抗凝血加少量TRIzol后制备阴性样品;将BTV1型细胞培养物通过TRIzol处理灭活病毒后,用阴性样品做适当稀释制备了BTV强阳性和弱阳性样品;均匀性和稳定性检验证实样品均达到中国合格评定国家认可委员会对能力验证样品的要求。将能力验证样品编号后通过快递的方式下发给参试实验室,共有21个省、市的31实验室参加了本次能力验证活动,其中1家实验室选用了套式RT-PCR进行检测,其余30家均选用荧光RT-PCR方法,报送结果经比对验证均为满意,满意率达100%。本次能力验证对提升我国BTV的检测水平和评估各级实验室检测能力具有重要意义,为我国蓝舌病的诊断和防控工作提供技术保障。

摘要：分析了经典梳状谱信号发生器的原理及应用局限,研制出了一种新型数字超宽带梳状谱信号发生器。该方案采用数字电路方法实现,电路设计独特,信号稳定性好,同时具有较好的电路移植性,是传统梳状谱信号发生器的创新和突破。设计出的新型数字超宽带梳状谱信号发生器能够产生稳定的梳状谱信号。

摘要：目的:建立食品过敏原芥末成分环介导等温扩增(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)检测方法,并与实时荧光-聚合酶链式反应(real-time polymerase chain reaction,RT-PCR)检测方法比对。方法:针对白芥的主要过敏原基因Sin A1,设计LAMP引物并建立反应体系,在特异性和灵敏度方面与RT-PCR检测方法比对。结果:建立的LAMP检测方法,经特异性验证,与所测试的13种植物,无交叉反应。通过添加实验,方法的检测灵敏度为0.5%,与RT-PCR方法检测灵敏度相当。检测了25份实际样品,检测结果与RT-PCR检测结果一致。结论:建立的食品过敏原芥末成分LAMP检测方法简单经济,检测结果可靠,可有效缩短检测时间,适用于芥末过敏原成分的检测,具有良好的应用前景。