摘要：目的:建立A型肉毒毒素抑制剂的定量构效关系模型。方法:应用分子全息定量构效关系(HQSAR)技术,研究了14种A型肉毒毒素抑制剂的抑制活性与其二维分子结构之间的关系,讨论了碎片区分参数及碎片长度对模型质量的影响。结果:最佳全息条件下产生的模型相关系数r2为0.780,交叉验证相关系数q2LOO为0.583。所建模型具有良好的拟和效果和较高的预测能力,HQSAR模型贡献图显示抑制剂分子中的噻吩环及羟胺对活性有较大贡献。结论:本研究对新抑制剂的设计具有一定的指导作用。

摘要：在生物体系、材料科学和药物设计等领域,采用计算化学方法存在计算耗时长、计算精度难以提高、计算体系难以扩大等瓶颈问题。本文介绍了使用GPU加速的量子化学计算程序和分子动力学模拟程序的新进展,并着重对完全为GPU计算设计的量子化学计算程序TeraChem和分子动力学模拟程序ACEMD在算法、功能、性能和应用等方面做了详细的介绍,展望了GPU技术在计算化学领域中新的机遇和挑战。