摘要：转录因子是真核表达调控中非常重要的一类反式作用因子,通常由DNA结合结构域与效应结构域两部分组成,研究发现这两个结构域可以各自独立发生作用。基于转录因子的这种结构特点,可以人为地选择针对特定序列的DNA结合结构域与具有特定作用的效应结构域构建人工转录因子。目前人工转录因子的DNA结合结构域多为C2 H2 型锌指结构,每一个锌指单元由大约30个氨基酸组成,识别DNA双螺旋大沟中相连的3bp序列,并可通过氢键作用与相应的碱基结合;多个锌指可以串联成簇,从而识别并结合较长的DNA序列区域。常见的人工转录因子的效应结构域有激活结构域以及抑制结构域,不同的效应结构域赋予人工转录因子不同的功能。目前人工转录因子已经在基础研究、药物设计以及基因治疗等领域得到了广泛的应用。

摘要：用Ｂｉｏｓｙｍ公司开发的计算机辅助分子设计系统模建了鼠抗人纤维蛋白抗体Ｆｖ片段的三维结构。Ｆｖ是由重链可变区（Ｖｈ）和轻链可变区（Ｖｌ）两个结构域组成的具有抗原结合能力的最小抗体片段。先分别模建了Ｖｈ和Ｖｌ两个结构域，然后搭建出Ｆｖ片段的整体三维结构，并对模建的结构进行了分子力学和动力学优化。对结构的合理性验证显示模建结构是合理的。本研究为鼠抗人纤维蛋白抗体Ｆｖ片段的人源化的分子设计打下了基础。

摘要：产生免疫原性的残基主要是位于蛋白表面的暴露残基，为了消除鼠抗体对人的免疫原性，利用表面再塑的方法对本室克隆的鼠抗人纤维蛋白抗体单链Ｆｖ片段进行了人源化分子设计．首先确定了鼠及人Ｆｖ片段的表面残基，在此基础上分析了鼠与人抗体Ｆｖ片段表面残基的差异，将存在差异的鼠抗体的表面残基换成人的，从而实现鼠抗体的人源化．提出了残基最高频率人源化及最相似链人源化两种分子设计方案．人源化的鼠抗人纤维蛋白抗体单链Ｆｖ片段的结构经Ｐｒｏｆｉｌｅｓ－３Ｄ检测证明合理，替换的表面残基的溶剂可及性未变，而且未对ＣＤＲｓ的空间构象产生明显影响，应不会影响与纤维蛋白的亲和力，为鼠抗体人源化实验研究奠定了基础．

摘要：来源于大肠杆菌的L 天门冬酰胺酶是临床化疗的常用药 ,其毒副作用影响了其更为广泛的临床应用。利用蛋白质工程技术对其进行体外分子改造 ,获得毒副作用较小的突变体是克服其毒副作用的有效途径。为此 ,克隆了L 天门冬酰胺酶的前导信号肽、成熟肽编码序列 ,以及其翻译、转录终止序列 ,置于一设计合成的中等强度 β 内酰胺酶启动子调控之下 ,在大肠杆菌中获得可溶性表达 ;表达产物可分泌至细菌周质中 ,并具有催化L 天门冬酰胺解离为天门冬氨酸和氨的反应。本研究为依据酶活性为筛选指标的高通量筛选方法的建立奠定了基础。

摘要：利用同源模建方法预测了ｔＰＡＫ１区的三维结构。通过结构叠合确定了ｔＰＡＫ１、Ｋ２区，纤溶酶原Ｋ１、Ｋ４区及ＵＫＫ区的Ｌｙｓｉｎｅ结合口袋。静电势计算及疏水性分析表明，在ｔＰＡＫ２区以及纤溶酶原Ｋ１、Ｋ４区与纤维蛋白裸露的Ｌｙｓｉｎｅ之间存在明显的静电势互补和疏水面契合。确定了影响Ｋｒｉｎｇｌｅ区结合口袋与Ｌｙｓｉｎｅ亲和的重要氨基酸，分析了ｔＰＡＫ１区、ＵＫＫ区不能结合Ｌｙｓｉｎｅ的原因，由此设计了具有Ｌｙｓｉｎｅ亲和力的新型ｔＰＡＫ１区及ＵＫＫ区突变体。利用模拟残基突变技术预测了突变体的结构变化，分析了突变后ｔＰＡＫ１区及ＵＫＫ区与Ｌｙｓｉｎｅ亲和力的变化，初步在理论上肯定了设计方案的合理性。

摘要：本文利用PCR技术,对人肿瘤坏死因子α(hTNFα)基因进行了改造,并将其与人白细胞介素-6(hIL-6)成熟肽编码区cDNA进行融合,构建了5′IL-6-TNF△融合蛋白的表达质粒pBVIL6-TNFA△。DNA序列分析证明,PCR扩增片段核苷酸序列与引物设计序列及相应的cDNA序列完全一致;重组子用限制性内切酶酶切鉴定,含有正确的IL6-TNF△融合cDNA片段;表达产物经SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳,分子量约为37kD,与预计的相符合;生物学活性分析初步表明,该融合蛋白具有抗肿瘤活性。