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共显分子标记基因型数据转换为二元型数据的处理软件及其在研究种质资源遗传多样性中的意义
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《植物遗传资源学报》2009年 第1期10卷 97-102页
作者:夏寒冰 卢宝荣复旦大学生物多样性研究所/生物多样性与生态工程教育部重点实验室上海200433 
遗传多样性研究是植物种质资源有效利用和保护的重要基础。遗传多样性研究所采用的分子标记工具主要有显和共显两种,两种不同类型的分子标记将产生不同的数据类型。显分子标记产生二元型数据,共显分子标记产生基因型数据。数据...
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籼稻93-11和粳稻日本晴DNA插入缺失差异片段揭示的水稻籼-粳分化
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复旦学报(自然科学版)》2006年 第3期45卷 309-315页
作者:蔡星星 刘晶 仇吟秋 赵伟 宋志平 卢宝荣复旦大学生物多样性科学研究所生物多样性与生态工程教育部重点实验室上海200433 
碱基的插入/缺失(InDel)引起DNA序列变化并形成了DNA片段长度多态,可以用作遗传标记.为了评价基于籼稻93-11和粳稻日本晴全基因组序列比对获得的差异片段而设计的InDel引物在鉴定籼稻和粳稻两种生态型以及研究稻属不同物种之间亲缘关系...
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小分子功能筛选平台M & Function的设计与实现
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复旦学报(医学版)》2012年 第6期39卷 633-640页
作者:陈健 鞠元虎 修婧 张国庆 南蓬复旦大学生命科学学院生物多样性与生态工程教育部重点实验室上海200433 上海生物信息技术研究中心上海200235 
目的建立一个综合了生物信息学和化学信息学的网络信息平台M&Function,致力于新药筛选和研究。方法通过数据挖掘,整合小分子药物的名称、结构、功能、分类等信息,建立一个小分子药物信息资源库。在此基础上,借助基于最大公共子结构(...
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微卫星标记在人参和西洋参鉴别中的应用
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复旦学报(自然科学版)》2011年 第2期50卷 185-191页
作者:陈子易 吕旭楠 程舟 陈家宽 张文驹复旦大学生命科学学院生物多样性科学研究所生物多样性与生态工程教育部重点实验室上海200433 同济大学生命科学与技术学院上海200092 
从GenBank中寻找含有简单重复序列(SSR)位点的人参DNA片段序列,设计SSR引物,挑选PCR扩增条带清晰的引物,对人参和西洋参进行PCR扩增及聚丙烯酰胺凝胶电泳分析,选择能够区别2个种的引物.共有来自8个SSR位点的9对引物能扩增出可区分人参...
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水稻(OryzasativaL.)磷酸盐转运蛋白编码基因的表达研究(英文)
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复旦学报(自然科学版)》2003年 第4期42卷 546-549页
作者:明凤 郭滨 梁斌 王敬文 韩颖颖 沈大棱复旦大学生命科学学院遗传学研究所遗传工程国家重点实验室基因多样性与设计农业中心生物多样性与生态工程教育部重点实验室上海200433 
研究揭示了水稻磷酸盐转运蛋白编码基因的表达.低磷处理下,根系与叶片中的PTW J转录子迅速表达,处理7d时达到最高表达量.PTW JmRNA的诱导积累具有元素的专一,因为在缺氮、缺钾与缺铁情况下此基因不表达.缺磷处理后恢复供磷,PTW J转录...
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铝诱导普通野生稻(Oryza rufipogon L.)光合系统相关基因表达
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复旦学报(自然科学版)》2002年 第6期41卷 679-683页
作者:明凤 梁斌 娄玉霞 王敬文 叶鸣明 沈大棱复旦大学生命科学学院遗传学研究所遗传工程国家重点实验室基因多样性与设计农业研究中心生物多样性与生态工程教育部重点实验室上海200433 上海师范大学生物工程实验室上海201418 
采用抑制差减杂交技术对正常与铝毒处理的普通野生稻植株进行表达基因差异分析.通过对差异表达基因的PCR选择研究、阳表达基因的测序、Northern杂交的进一步分析,得出3个cDNAs在铝毒处理的叶片中高效表达,其中2个与光合系统代谢相...
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水稻柠檬酸合酶编码基因的初步研究
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《中国水稻科学》2005年 第6期19卷 501-505页
作者:张珊珊 明凤 路群 郭滨 沈大棱复旦大学生命科学学院遗传学研究所 生物多样性与生态工程教育部重点实验室上海200433 上海师范大学生命与环境科学学院 
以粳稻cDNA为模板,设计一对特异引物,获得编码水稻柠檬酸合酶基因的cDNA序列,全长为1470bp,ORF区含475个氨基酸,推定蛋白序列与红葡萄、烟草、甜菜、拟南芥和柑橘等物种都有较高的同源(>70%),氨基末端含一线粒体靶信号。Souther...
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贵州玉舍国家森林公园树木及其残体附生苔藓植物的组成和分布特征
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《北方园艺》2014年 第16期 77-81页
作者:杨再超 谢斐 左经会 林长松 向红 廖雯六盘水师范学院生命科学系贵州六盘水553004 复旦大学生物多样性科学研究所生物多样性与生态工程教育部重点实验室上海200433 
对贵州玉舍国家森林公园树干、腐木和凋落物附生苔藓植物进行了调查,结合多样性指数和相似指数的计算,研究了树木及其残体附生苔藓植物分布和种间关系。结果表明:附生苔藓植物共有26科35属56种,优势科为灰藓科、指叶苔科、叉苔科和青...
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贵州山地森林公园地面生苔藓植物多样性
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《北方园艺》2015年 第9期 71-75页
作者:谢斐 杨再超 左经会 林长松 向红 廖雯六盘水师范学院生命科学系贵州六盘水553004 复旦大学生物多样性科学研究所生物多样性与生态工程教育部重点实验室上海200438 
苔藓植物是构成山地森林地表覆被的重要组分之一,在生态系统生物多样性的维系等方面发挥着重要的生态功能。以贵州玉舍山地国家森林公园林下地面生苔藓为研究对象,研究了物种组成和分布特点。结果表明:该区拥有丰富的苔藓植物,共记录地...
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外来种互花米草和土著种芦苇空中凋落物氮动态的比较研究
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生物多样性2010年 第6期18卷 631-637页
作者:廖成章 唐小平 程小玲 李博 骆亦其国家林业局调查规划设计院北京100714 复旦大学生物多样性与生态工程教育部重点实验室长江河口湿地生态系统野外科学观测研究站上海200433 
土壤氮含量是限制植物生长的重要因素,所以入侵植物要入侵成功必须突破土壤氮限制的瓶颈。近年来,外来种互花米草(Spartina alterniflora)在中国海岸带盐沼中快速取代土著种芦苇(Phragmites australis),引起了多方面的生态学后果。为了...
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