摘要：目的:研究双特异性蛋白磷酸酶B(CDC25B)与细胞周期素A(Cyclin A)和细胞周期素依赖性激酶2(CDK2)蛋白发生相互作用的结构基础。方法:应用Discovery Studio(DS)v3.5中的ZDOCK模块对CDC25B与CDK2/Cyclin A蛋白进行对接。应用"Analyze Protein Interface"模块计算CDC25B蛋白和CDK2/Cyclin A蛋白的溶剂可及表面积(SAS)并分析CDC25B蛋白和CDK2/Cyclin A蛋白相互作用界面的关键氨基酸残基。应用"Calculate Interaction Energy"模块计算CDC25B蛋白和CDK2/Cyclin A蛋白相互作用界面处的关键氨基酸残基间的相互作用能。结果:对pose 1的疏水相互作用、氢键相互作用、相互作用能进行计算分析,预测得到CDC25B-CDK2/Cyclin A复合物的结合模式及起相互作用的氨基酸残基(CDC25B:GLY380,TYR382,ARG485,ARG488,GLU489,ARG490,ARG492,TYR497;CDK2/Cyclin A:THR165,TRP167,ASP206,SER207,ASP210,PHE213)。结论:该结果为今后深入研究CDC25B通路和发挥协同刺激作用的信号体系以及基于该信号途径新型分子靶向药物的设计提供了理论基础。

摘要：目的:设计并合成可以检测弱酸性环境的pH荧光探针,为检测溶酶体(pH=4~5)和内涵体(pH=5~6)中的酸性环境提供科学的方法依据。方法:以2,7-二溴芴为荧光母核,分别与电子给体二乙胺基和电子受体苯并噻唑相连,构建供体-π-受体体系,并在芴的亚甲基上引入能够改善水溶性的二乙二醇甲醚乙基得到目标化合物5,并对其进行核磁表征确定结构,采用紫外分光光度计法和荧光光谱法研究目标化合物5对pH值的响应性,计算p Ka。结果:核磁数据与化合物结构相吻合,化合物5紫外吸光度与荧光强度变化具有pH依赖性,通过非线性回归显示p Ka为5.88。结论:基于芴母核结构设计并合成了探针化合物5,紫外和荧光结果表明是一个弱酸性pH荧光指示剂,在弱酸性环境的检测方面应该具有很好的应用前景。

摘要：随着高校科研水平的提高,实验室排放的大量废弃物已经对生态环境造成了严重的威胁,高校环保问题不容忽视。通过分析高校实验室污染物的类型以及实验室污染的特点,针对我国实验室环保现状,总结了污染物的处理原则和处理办法,提出了合理设计实验,增强师生环保意识,制定科学合理的管理规范,加强实验室环保管理等建议。

摘要：目的:设计PPARα/γ双重激动剂,提高其降糖活性,为以后相关疾病的治疗提供科学的方法和依据。方法:应用Schrodinger Suite 2009中的Glide模块对drug-like数据库进行高通量虚拟筛选,对筛选出的结构利用"Core Hopping"模块进行修饰,利用Gromacs 4.0软件包进行分子动力学模拟研究,将PPARα/γ的空载蛋白及其与选出的配体小分子复合物体系分别进行10 ns的分子动力学模拟,最后应用Qikprop模块做ADME(吸收、分布、代谢、排泄)预测来推测这些化合物的成药可能性。结果:设计出一系列新的PPARα/γ双重激动剂。用分子对接方法和分子动力学模拟分析了新激动剂和PPARα/γ的相互作用机制,与临床应用的激动剂ragalitazar相比有更好的结合能力。通过ADME预测得出设计出的化合物均符合类药5原则。结论:通过计算机辅助设计得到的小分子与PPARα/γ的结合能力理论上优于激动剂ragalitazar。预期这些化合物可能成为新的治疗2型糖尿病的目标化合物。

摘要：目的:虚拟筛选更高活性的神经氨酸酶(NA)抑制剂,提高抵抗变异病毒的能力,为以后相关疾病治疗新药的设计提供科学依据。方法:利用Schrodinger Suite2009中的Glide模块对Leadnow数据库进行高通量虚拟筛选,对选出的结构用"Core Hop-ping"模块改造结构;利用Desmond2.4软件包进行分子动力学模拟研究,将NA的空载蛋白及靶点与筛选结果较好的配体小分子复合物共3个模型分别进行10 ns的分子动力学模拟。结果:高通量虚拟筛选得到一个五元环结构的化合物ZINC13219479,并以此为核心向150-cavity延伸,得到8个能很好进入的结构。建立了靶向这些位点的配体库,方便后续有关研究的进行。分子动力学结果表明模拟过程中各靶点与配体复合物体系稳定,结合位点正确。作为抑制剂,小分子配体与NA酶的150-cavity区域残基形成稳定的氢键作用,牢牢占据NA的催化位点。结论:通过计算机辅助设计得到的小分子与NA的结合能力理论上优于抑制剂达菲。在动力学模拟这些化合物后,更加确定了这些化合物的有效性,具有一定的科研价值。

摘要：目的:得到治疗效果好,副作用小的PPAR泛激动剂。方法:用core hopping的方法对LY465608中间链部分和尾链部分进行结构替换。得到新的化合物并与3个蛋白质受体进行分子对接。应用分子动力学模拟先导化合物与PPAR-α、β、γ受体的相互作用情况。基于Lipinski’s rule of five,对得到的先导化合物进行ADME预测。结果:对接结果表明得到的目标化合物能与PPAR-α、β、γ活性位点区域的氨基酸残基形成氢键,使AF-2螺旋稳定于激活构象。分子动力学模拟结果表明模拟过程中受体与激动剂复合物体系是稳定的。ADME预测发现它们体内的吸收、分布、代谢和排泄情况符合作为药物的一般特点。结论:得到的8个化合物可以作为PPAR泛激动剂予以进一步的研究。

摘要：目的:研究激动剂能够使过氧化物酶体增殖物激活受体-γ(PPAR-γ)的α螺旋结构更稳定的原因以及PPAR-γ可能的活化机制。方法:利用分子动力学模拟的方法研究激动剂对PPAR-γ的α螺旋的诱导契合效应。结果:激动剂的存在能够增加PPAR-γ中α螺旋H2’、H3和H12(AF-2)的骨架氢键概率。结论:激动剂能够使PPAR-γ的α螺旋H2’、H3及H12(AF-2)结构更稳定,同时也影响α螺旋之间氢键的形成与断裂,而且残基侧链二面角的分布也同样能佐证上述观点。

摘要：目的:探讨研究糖原合成酶激酶(GSK-3β)的活性调节机制。方法:利用Desmond 9.0软件对GSK-3β-轴素复合物和GSK-3β-FRATtide复合物进行分子动力学模拟研究。结果:与GSK-3β-轴素复合物相比,在GSK-3β-FRATtide复合物中,Lys205同Glu211、Asn213之间的氢键作用消失,Lys205与Glu211不能形成稳定的盐键;FRATtide的Arg219与GSK-3β的Asp264,GSK-3β的Gly259与Arg220之间能形成稳定的氢键。此外,Phe67和Phe93显示出位置的偏移。这些都将导致GSK-3β活性环的构象变化进而抑制GSK-3β的催化活性。结论:GSK-3β的活性调节是通过改变其活化环构象来实现的。

摘要：目的:以硝苯地平为模型药物,应用星点设计-效应面法优化其分散片处方。方法:采用固体分散技术,以提高硝苯地平的溶解度。以处方中聚乙二醇4000(PEG4000)、交联聚维酮(PVPP)以及交联羧甲基纤维素钠(CCNa)的含量为考察因素,以分散均匀性和10 min累积溶出百分率为评价指标,根据星点设计原理进行试验,并用多元线性回归和二次多项式方程拟合指标与影响因素之间的数学模型,经效应面法预测最佳处方。结果:采用二次多项式拟合的相关系数优于线性方程,具有较高的可信度。综合效应面优化和评估结果,最佳处方为固体分散体中硝苯地平∶PEG4000=1∶4,PVPP占处方的15%,CCNa占处方的8%。结论:通过星点设计-效应面优化法所建立的模型可以用于硝苯地平分散片处方的优化。

摘要：目的:星点设计-效应面优化法设计复方阿托伐他汀钙依折麦布胶囊的最佳处方及工艺。方法:对复方制剂采取分开制粒的方式,首先利用单因素考察方法大致确定处方中部分辅料的种类与用量,然后分别采用正交设计和星点设计,主要以药物在PBS 4.5和水两种介质中的溶出度为评价指标,进行筛选优化,以期得到最佳的处方与工艺。结果:经处方筛选确定最终处方为:依折麦布部分:依折麦布10 mg;十二烷基硫酸钠(SDS)10 mg;聚维酮(PVP)40 mg;微晶纤维素(MCC)70 mg;羧甲基淀粉钠(CMSNa)50 mg。阿托伐他汀钙部分:阿托伐他汀钙10 mg;Na HCO310 mg;羟丙基纤维素(HPC)50 mg;MCC 28.2 mg;一水乳糖80 mg。硬脂酸镁外加1.8 mg。结论:按照最终确定的复方阿托伐他汀钙依折麦布胶囊的处方与工艺所制得制剂性状良好,含量均匀,与对照制剂相比,溶出行为相似。