摘要：目的预测唾液酸结合免疫球蛋白样凝集素-15(sialic acid binding Ig like lectin-15,SIGLEC-15)的生物学信息。方法应用多种生物信息学工具对SIGLEC-15的理化性质、组织表达特异性、亚细胞定位、空间结构、翻译后修饰位点、蛋白相互作用等进行预测,同时建立SIGLEC-15的系统进化树,并进行分析。结果 SGLEC-15是一种碱性不稳定蛋白,具有亲水性,含有信号肽结构。SGLEC-15具有1个跨膜结构域,主要定位于细胞外(34.80%)、细胞膜(30.40%)、内质网(21.70%)和高尔基体(13.00%),在正常细胞及癌细胞中均有表达。SGLEC-15的高级结构弹性较大,拥有2个N-糖基化位点,1个O-糖基化位点及8个可能的蛋白磷酸化位点。SGLEC-15与TYROBP等4个蛋白具有高置信度的相互作用关系。人类SIGLEC-15与猩猩、白狨猴等灵长类动物SIGLEC-15的同源性最高,在脊椎动物进化过程中相对保守。结论 SIGLEC-15可作为肿瘤免疫抑制的靶点,为进一步肿瘤免疫疗法的研究奠定了基础。

摘要：目的构建靶向Pin1基因的短发夹RNA(shRNA)干扰真核表达质粒,并检测其对大肠癌SW620细胞Pin1基因的抑制作用。方法设计合成特异性针对人Pin1基因的寡核苷酸序列,退火后与pGenesil-1载体连接,构建靶向Pin1基因的shRNA真核表达质粒pGenesil-1-Pin1(+),利用脂质体转染大肠癌SW620细胞,以质粒pGenesil-1-Pin(-)转染细胞和未转染细胞为对照。利用荧光显微镜观察转染后细胞表达的绿色荧光蛋白,估算转染效率;应用实时荧光定量PCR和Western blot检测其对SW620细胞Pin1基因mRNA转录及蛋白表达的影响。结果所构建的特异Pin1shRNA真核表达质粒经酶切及测序证明构建正确,转染SW620细胞的转染效率为64%。shRNA对SW620细胞Pin1基因mRNA的抑制率在转染后72h最高,为70.2%,蛋白抑制率为60%。结论已成功构建了靶向Pin1基因的shRNA干扰真核表达质粒,可抑制SW620细胞Pin1基因mRNA的转录及蛋白的表达。

摘要：目的分析肿瘤免疫调控新靶点YTH N6-甲基腺苷(m6A)RNA结合蛋白1[YTH N6-methyladenosine(m6A)RNA binding protein 1,YTHDF1]的分子结构及生物学功能。方法应用NCBI、ExPASy、SignalP、PSORTⅡ、SOPMA、STRING、SWISS-MODEL等软件工具分析YTHDF1蛋白的理化性质及其生物学功能,并通过MEGA 7软件建立YTHDF1蛋白的系统进化树。结果YTHDF1是一种不稳定的碱性亲水蛋白质,无信号肽,无跨膜区;YTHDF1在多种肿瘤中高表达,在胃肠道肿瘤中表达最高;YTHDF1可能部分或更多定位在细胞核中;YTHDF1的二级结构主要由无规则卷曲构成;与YTHDF1相互作用的蛋白质包括WTAP、METTL3、FTO、METTL14、ALKBH5,YTHDF1主要参与RNA的转录后修饰、mRNA剪切的调控及DNA损伤修复反应。YTHDF1蛋白在进化过程中高度保守。结论YTHDF1可能在细胞质中通过识别m6A提高蛋白翻译来促进肿瘤发生,也可能在细胞核中通过其他机制促进肿瘤发生。

摘要：基本局部比对搜索工具(basic local alignment search tool,BLAST)是核酸或蛋白质序列相似性分析最常用的工具之一。因为程序涉及参数较多,一些学生和研究者有时不根据实际情况也不阅读说明书就直接选择默认参数,可能会得出错误结论。BLAST可以进行核酸、蛋白质序列及其相互间的比对,一些低年级学生会有困惑,不知如何进行程序的选择等问题。鉴于这些情况,笔者尝试用2020年初网络的热议话题"新冠病毒极有可能源于实验室"作为引子吸引学生注意力,通过复现并从理论上初步分析其错误,以及产生错误的原因来达到让本科生快速熟悉BLAST的使用及易错点,达到BLAST理论教学的目的。在实验课中,虚构恐龙基因,即一个小组在基因中插入"密码",由另一小组解开"密码",通过小组间利用BLAST工具进行加密与解密的趣味活动,从而加深对程序正确选择的理解,同时巩固了理论教学内容。此教学设计利用当下新冠病毒起源的热点话题不仅提高了学生的学习兴趣,同时也帮助他们利用该工具解决实际问题,培养了学生利用专业知识进行言论分辨的能力。希望此文能对BLAST工具的正确使用和新医科背景下生物医学教学有所启发和帮助。

摘要：目的探讨靶向药物联合应用对多驱动基因调控增殖的肝癌细胞SK-Hep-1的影响及作用机制。方法利用对肝癌细胞SK-Hep-1敏感的靶向药物(HG6-64-1、dasatinib、crizotinib、sunitinib)绘制单靶点动力学分析曲线和双相分析曲线,对SK-Hep-1细胞进行动力学分析;Western blot法检测这些靶向药物对SK-Hep-1细胞关键信号通路的影响;MTT法检测这些药物单用和联合应用对SK-Hep-1细胞增殖的影响。结果与单靶点动力学分析曲线比较,双相分析曲线可更好拟合靶向药物对肝癌细胞SK-Hep-1的影响,并且预测出HG6-64-1、dasatinib和MK-2206三药联合应用能有效抑制SK-Hep-1细胞增殖。结论双相动力学分析可以更好地定量描述多驱动增殖的肝癌细胞SK-Hep-1对靶向治疗的反应,联合使用HG6-64-1、dasatinib和MK-2206是治疗肝癌潜在的药物组合。

摘要：背景:Notch信号通路在神经干细胞分化过程中起着关键作用,而γ-分泌酶是Notch信号通路调节的核心环节。目的:对神经干细胞分化过程中γ-分泌酶的活性、酶解产物Notch胞内段的生成量以及活性中心早老素1的表达进行检测。设计、时间及地点:细胞学基因水平检测,于2008-10/2009-01在山西医科大学生物化学与分子生物学实验室完成。材料:清洁级胚龄15d的BALB/c胎鼠由中国药品生物制品检定所提供,质粒Notch1△E-GVP和MH100由瑞典斯德哥尔摩诺贝尔医学学会的Urban Lendahl教授惠赠,荧光素酶质粒pRL-CMV为Promega公司产品。方法:体外分离培养胎鼠脑皮质神经干细胞,传至第5代后,按5×104/cm2密度接种到24孔板,每孔转染200ng MH100,100ng Notch1△E-GVP和2ng pRL-CMV质粒。主要观察指标:利用Gal4-VP16/UAS系统和双荧光素酶报告基因系统测定神经干细胞分化过程中γ-分泌酶的活性;通过Western blot技术检测酶解产物Notch胞内段的生成量;采用实时荧光定量PCR法测定γ-分泌酶活性中心早老素1mRNA的表达。结果:在γ-分泌酶抑制剂DAPT作用下,γ-分泌酶活性呈剂量依赖性降低,与对照组相比,0.1μmol/L DAPT即可对γ-分泌酶活性产生明显的抑制作用(P<0.05),至50μmol/L DAPT时γ-分泌酶活性降低近100倍(P<0.001)。Notch胞内段的生成量也同步减少,与DAPT抑制γ-分泌酶活性呈剂量依赖性的结果一致。与对照组相比,早老素1mRNA表达水平经0.1μmol/L DAPT干预后开始升高,并随着DAPT浓度增加而逐渐升高。结论:神经干细胞分化过程中,γ-分泌酶抑制剂干预后γ-分泌酶活性与酶解产物生成量呈剂量依赖性降低,活性中心基因表达则呈反馈性的同步增高。

摘要：医学生物化学与分子生物学是一门重要的医学公共基础课程,其课程改革一向都是高等医学院校的工作重心。"互联网+智慧教学"时代的到来,对我国的高等教育教学改革研究产生了深远的影响。本文立足于高等医学院校人才培养的教育教学理念,依据国家精品在线开放课程项目的建设宗旨,以高等医学院校生物化学与分子生物学课程为例,从课程设计理念变革、教学内容、课程资源、教学方法、信息化教学技术的综合应用、多元化评价与反馈等方面探索并实践了在线精品课程的建设,为实现线上线下混合式"金课"教学模式的开展,深化高等院校基础医学教学改革,为国家培养优秀的医学专门人才积累了经验。

摘要：为探讨混合式教学在生物化学与分子生物学理论教学中的实践效果,针对DNA重组和重组DNA技术一章设计3个学时的混合式教学课程,通过随堂小考和问卷调查对教学效果进行评价。同时,引入全英教学材料,帮助学生提高专业英文水平,掌握相关学科知识,培养国际化人才。结果表明,多数学生认为混合式教学模式能促进知识内化,提高学习效率,但课前自主学习时间延长,对学生的自学能力和小组协助能力提出更高要求。生物化学与分子生物学课程信息量大,内容多,不同的教学内容是否适合开展混合式教学,需要在实际的教学过程中结合情况具体分析。

摘要：科研反哺教学以科研论文为主线,实验方法为手段,有助于增加教学信息量,引导学生主动探索科学研究提出问题-解决问题的过程,体会科研之美和科研论文“讲故事”的逻辑性,实现教师主导、学生主体的教学。该模式充分结合学习通线上网络教学平台,将最新科研成果及时融入课堂教学,提高学生的课堂参与度和学习热情,增强学生独立思考、分析问题和解决问题的能力;最后,通过课堂表现、章节测试、课后作业和课程论文作为过程性评价的指征,及时调整每堂课每一环节的教学设计,提高生物化学教学质量。

摘要：作为生命科学领域发展最为迅速的前沿学科,分子生物学在构建医学院校学术型研究生的知识体系、创新意识及科研素养培养中发挥着重要作用。为满足新医科人才培养的需求,文章依托产出导向教育(outcome-based education,OBE)理念,旨在培养学生科研课题设计能力和创新意识,借助信息化智慧教学平台,综合运用网络优质教学资源和虚拟仿真实验平台,开展探究式和讨论式新型教学模式改革,构建了适合地方医学院校学术型研究生培养的新型分子生物学课程体系。课程考核成绩和后期的学生科研成果随访显示,该新型教学模式获得良好成效,同时为新时期医学研究型复合人才的培养积累了成功经验。