摘要：基本局部比对搜索工具(basic local alignment search tool,BLAST)是核酸或蛋白质序列相似性分析最常用的工具之一。因为程序涉及参数较多,一些学生和研究者有时不根据实际情况也不阅读说明书就直接选择默认参数,可能会得出错误结论。BLAST可以进行核酸、蛋白质序列及其相互间的比对,一些低年级学生会有困惑,不知如何进行程序的选择等问题。鉴于这些情况,笔者尝试用2020年初网络的热议话题"新冠病毒极有可能源于实验室"作为引子吸引学生注意力,通过复现并从理论上初步分析其错误,以及产生错误的原因来达到让本科生快速熟悉BLAST的使用及易错点,达到BLAST理论教学的目的。在实验课中,虚构恐龙基因,即一个小组在基因中插入"密码",由另一小组解开"密码",通过小组间利用BLAST工具进行加密与解密的趣味活动,从而加深对程序正确选择的理解,同时巩固了理论教学内容。此教学设计利用当下新冠病毒起源的热点话题不仅提高了学生的学习兴趣,同时也帮助他们利用该工具解决实际问题,培养了学生利用专业知识进行言论分辨的能力。希望此文能对BLAST工具的正确使用和新医科背景下生物医学教学有所启发和帮助。

摘要：目的预测唾液酸结合免疫球蛋白样凝集素-15(sialic acid binding Ig like lectin-15,SIGLEC-15)的生物学信息。方法应用多种生物信息学工具对SIGLEC-15的理化性质、组织表达特异性、亚细胞定位、空间结构、翻译后修饰位点、蛋白相互作用等进行预测,同时建立SIGLEC-15的系统进化树,并进行分析。结果 SGLEC-15是一种碱性不稳定蛋白,具有亲水性,含有信号肽结构。SGLEC-15具有1个跨膜结构域,主要定位于细胞外(34.80%)、细胞膜(30.40%)、内质网(21.70%)和高尔基体(13.00%),在正常细胞及癌细胞中均有表达。SGLEC-15的高级结构弹性较大,拥有2个N-糖基化位点,1个O-糖基化位点及8个可能的蛋白磷酸化位点。SGLEC-15与TYROBP等4个蛋白具有高置信度的相互作用关系。人类SIGLEC-15与猩猩、白狨猴等灵长类动物SIGLEC-15的同源性最高,在脊椎动物进化过程中相对保守。结论 SIGLEC-15可作为肿瘤免疫抑制的靶点,为进一步肿瘤免疫疗法的研究奠定了基础。

摘要：目的构建靶向Pin1基因的短发夹RNA(shRNA)干扰真核表达质粒,并检测其对大肠癌SW620细胞Pin1基因的抑制作用。方法设计合成特异性针对人Pin1基因的寡核苷酸序列,退火后与pGenesil-1载体连接,构建靶向Pin1基因的shRNA真核表达质粒pGenesil-1-Pin1(+),利用脂质体转染大肠癌SW620细胞,以质粒pGenesil-1-Pin(-)转染细胞和未转染细胞为对照。利用荧光显微镜观察转染后细胞表达的绿色荧光蛋白,估算转染效率;应用实时荧光定量PCR和Western blot检测其对SW620细胞Pin1基因mRNA转录及蛋白表达的影响。结果所构建的特异Pin1shRNA真核表达质粒经酶切及测序证明构建正确,转染SW620细胞的转染效率为64%。shRNA对SW620细胞Pin1基因mRNA的抑制率在转染后72h最高,为70.2%,蛋白抑制率为60%。结论已成功构建了靶向Pin1基因的shRNA干扰真核表达质粒,可抑制SW620细胞Pin1基因mRNA的转录及蛋白的表达。

摘要：目的分析肿瘤免疫调控新靶点YTH N6-甲基腺苷(m6A)RNA结合蛋白1[YTH N6-methyladenosine(m6A)RNA binding protein 1,YTHDF1]的分子结构及生物学功能。方法应用NCBI、ExPASy、SignalP、PSORTⅡ、SOPMA、STRING、SWISS-MODEL等软件工具分析YTHDF1蛋白的理化性质及其生物学功能,并通过MEGA 7软件建立YTHDF1蛋白的系统进化树。结果YTHDF1是一种不稳定的碱性亲水蛋白质,无信号肽,无跨膜区;YTHDF1在多种肿瘤中高表达,在胃肠道肿瘤中表达最高;YTHDF1可能部分或更多定位在细胞核中;YTHDF1的二级结构主要由无规则卷曲构成;与YTHDF1相互作用的蛋白质包括WTAP、METTL3、FTO、METTL14、ALKBH5,YTHDF1主要参与RNA的转录后修饰、mRNA剪切的调控及DNA损伤修复反应。YTHDF1蛋白在进化过程中高度保守。结论YTHDF1可能在细胞质中通过识别m6A提高蛋白翻译来促进肿瘤发生,也可能在细胞核中通过其他机制促进肿瘤发生。

摘要：目的:建立一种准确、快速的双抗体夹心酶免疫吸附的方法,以定量检测组织中过氧亚硝基阴离子的水平。方法:分别以小鼠源性抗3-硝基酪氨酸单克隆IgG抗体和兔源性抗3-硝基酪氨酸IgG抗体为包被抗体和检测抗体,采用正交设计方法摸索以上各抗体的浓度,建立定量检测3-硝基酪氨酸(3-NT)的双抗体夹心ELISA法。同时,测定心肌缺血再灌注大鼠心肌组织3-NT的含量。结果:本研究建立的双抗体夹心ELISA法检测3-NT的最低检测下限为0.10 ***-1,具有良好线性关系的检测范围是(0.15～7.50)***-1(r2=0.995);心肌缺血再灌注组大鼠的心肌组织中的3-NT水平为(1022.42±97.35)*** pro-1,明显高于假手术组(246.58±56.52 *** pro-1,P<0.01)。结论:本研究建立的定量检测3-NT的双抗体夹心ELISA法能够方便、准确、快速地检测组织中3-NT的含量,为定量检测组织中ONOO-的水平提供了新的方法。

摘要：近年来年份白酒市场中行业规范有所缺失,因此年份白酒的研究具有深远意义和市场价值。白酒中单体物质的浓度会随着白酒的年份改变,检测白酒中单体浓度可用来鉴定白酒质量及其年份。基于国内某品牌年份原桨白酒的三维荧光光谱,对其中乙酸浓度进行了建模研究。对原始光谱进行了小波分解和求导预处理。研究发现小波分解第一层和第二层呈噪声特征,浓度信息主要分布在第三层和第四层信号中。不同激发波长的荧光发射光谱强度分布不同,如何选择合适的激发波长目前还没有一个统一的方法。根据小波分解信号引入有效信号强度概念并获得了合适的建模激发波长(200 nm);导数光谱的细节特征比原始光谱丰富,光谱求导可以提高光谱的分辨率。研究了乙酸浓度与荧光光谱的相关性,原始荧光光谱与乙酸浓度之间相关性较小,小波分解光谱和导数光谱与浓度的相关性达0.8以上,且呈现出更多离散化的相关性特征峰。因此,小波分解光谱和导数光谱中包含更多乙酸浓度信息且分布比原始光谱更广。基于荧光光谱和模拟退火法研究了乙酸浓度偏最小二乘法(PLS)多元回归模型。研究发现原始光谱的乙酸浓度预测集的均方根误差高达70.03 mg·L^(-1),模型效果较差;小波分解光谱和导数光谱由于光谱之间多重相关性降低且分辨率提高的特点,模型预测效果更好,其中二阶导数光谱的乙酸浓度预测集的均方根误差和相关系数分别为20.32 mg·L^(-1)和0.9998,建模效果最好。基于1000次循环执行模拟退火算法建模得到的光谱信息密度曲线显示出二阶导数光谱比原始光谱包含更多的乙酸浓度信息。以乙酸为例,为年份白酒中物质浓度预测提供了一种简易的光学方法,研究方法对研究多组分渐变体系浓度预测具有一定的参考价值。

摘要：以岗位胜任力为出发点,以学生为中心,基于混合式教(导)+学模式,运用多种教学法,重构心血管系统整合课程。文章主要从团队组建、课程整合思路、整合流程、实施计划、课程评价等几个方面介绍教学改革设计,以提高教学效果。

摘要：文章针对当前基础化学实验课无法在实验室开展的问题,构建以任务为导向、以讨论为中心的线上实验教学模式,从课前、课中、课后分三个模块精心设计线上教学课程,保证线上实验课在内容上具备丰富多样性、在学习环节上具备高效互动性,以期达到与线下课堂教学质量同质等效的教学目标,同时为线上线下相结合开展实验教学,提供有意义的参考。

摘要：有机化学课程是临床医学类专业来华留学生必修课程之一。文章从课程教学改革的角度,提出重构课程教学目标、创新设计教学内容、构建特色性教学体系、调整教学方法、推行多元化考核方式,构建了“一依托、二结合、三阶段”的教学方法体系,通过线上线下有机融合和循序渐进式混合式教学方法,形成以学生为中心的教学理念。通过师生互动的增强、教学时间和空间的拓展以及形成性评价的实施,不仅培养学生的分析、评价、创新和高阶思维能力,进而提高了教学质量。

摘要：简单地介绍了美国“医学院入学考试”(MCAT)的基本内容,可将其作为我国医学院校医用化学的教学目标。通过与我国现行的医用化学教学内容、要求等相比较,提出对我们医用化学教学的建议:改变教学观念,让学生唱主角;调整教学内容,让重点更突出;改进教学方法,在使用中学习。