摘要：目的构建基于铜代谢相关基因和临床病理学特征的新型肾透明细胞癌(ccRCC)预后模型。方法2022年6月至2023年1月从基因集数据库(MSigDB)5.1版整理出铜代谢相关基因,应用癌症基因组图谱(TCGA)中ccRCC数据对获取的铜代谢相关基因进行生物信息学分析,得到32个铜代谢相关差异基因;用单因素比例风险回归(Cox)分析铜代谢基因,筛选出具有预后价值的60个铜代谢相关基因,两者取交集,得到14个关键基因,对其进行基因本体论(GO)分析、京都基因和基因组数据库(KEGG)通路分析及关联性分析。之后对关键基因进行套索回归分析(LASSO),结果显示有3个基因被纳入模型,计算公式为:风险分数=HAMP×0.205+TMPRSS6×0.097−CCND1×0.033。分别应用TCGA数据和基因表达综合数据库(GEO)中的ccRCC数据集GSE22541进行内部模型验证和外部模型验证;利用乘积极限法(Kaplan-Meier)生存曲线验证模型预后价值;利用受试者操作特征曲线(ROC曲线)下面积验证模型预测的准确性。结果生存状态图表明,高风险组死亡病例数多于低风险组;ROC曲线表明风险评分模型具备较好的预测能力,曲线下面积(AUC)均大于0.6;Kaplan-Meier生存分析显示,高风险组总体生存率低于低风险组(P<0.05)。结合临床病理学特征(年龄、肿瘤分级、肿瘤分期),构建诺莫(Nomogram)列线图,对病人预后具有较好的预测效果。结论基于铜代谢相关基因的预后风险评分模型可用于ccRCC的预后预测,针对铜代谢相关基因设计靶点可能是治疗ccRCC的一种新选择。

摘要：目的探讨碳水化合物磺基转移酶11(CHST11)对肾透明细胞癌(ccRCC)细胞增殖、迁移、侵袭生物学功能的影响。方法使用癌症基因组图谱(TCGA)数据库探究ccRCC组织与癌旁组织中CHST11基因的表达差异,分析CHST11表达水平与ccRCC分期、分级、预后的相关性;收集2021年1月至2021年10月在山西医科大学第一医院泌尿外科行手术切除的35例ccRCC和癌旁组织,采用荧光定量聚合酶链反应(RT-qPCR)、免疫组织化学和蛋白质印迹法(Western blot)检测ccRCC组织、癌旁组织及ccRCC细胞系中CHST11基因和蛋白表达水平;采用RNA干扰技术构建CHST11低表达的786O、769P细胞系;采用细胞计数试剂盒(CCK-8)实验方法检测细胞的增殖能力,采用Transwell实验方法检测细胞的迁移和侵袭能力。使用Graphpad Prism 9.0进行数据分析,Student’s t检验用于两组间比较,单因素方差分析用于多组间比较。结果生物信息学分析表明CHST11在ccRCC组织中mRNA表达水平高于癌旁组织(4.459±0.060比2.437±0.738,t=15.818,P<0.01),并且与患者预后生存率明显相关[风险比(HR)=1.490,P<0.01];实验结果表明,CHST11在ccRCC组织中,mRNA(1.865±1.705比1.000±0.956,t=4.949,P<0.01)和蛋白表达水平(1.989±0.353比1.000±0.539,t=4.949,P<0.01)高于癌旁组织;CHST11主要定位于细胞质与细胞膜,敲减CHST11基因可抑制ccRCC细胞增殖、迁移与侵袭的能力。结论CHST11在ccRCC中发挥促癌作用,沉默CHST11基因可抑制ccRCC细胞增殖、迁移与侵袭的能力。

摘要：目的:探讨长链酰基辅酶A合成酶3(ACSL3)对肾透明细胞癌(ccRCC)细胞增殖、迁移、侵袭及脂质合成的影响。方法:使用肿瘤基因组图谱数据库分析ccRCC中ACSL3基因的表达情况。选取山西医科大学第一医院2021年10月至2022年10月手术切除的60对ccRCC和癌旁组织作为研究对象，利用荧光定量聚合酶链反应和免疫组织化学方法检测ccRCC组织中ACSL3表达水平;采用转染获得过表达ACSL3基因的细胞，采用细胞计数试剂盒(CCK-8)、平板克隆形成实验验证细胞的增殖能力;采用划痕实验和Transwell实验验证细胞的迁移、侵袭能力;采用流式细胞术检测细胞的凋亡能力;采用油红O实验检测细胞的脂质合成能力。两组间计量资料比较采用 t检验，多组间比较采用方差分析。 结果:ACSL3在ccRCC中的表达水平显著低于正常肾组织(0.42±0.20比1.01±0.16， t＝17.946， P<0.05)。CCK-8结果显示转染96 h后，h-ACSL3组细胞吸光度( A)值显著低于对照组(1.095±0.047比1.295±0.025， t＝8.393， P<0.05)。h-ACSL3组细胞形成的细胞集落数显著小于对照组[(309.00±93.30)个比(499.00±53.66)个， t＝3.947， P<0.05]。h-ACSL3组划痕愈合率显著低于对照组[48 h：(45±7)%比(66±2)%， t＝5.253， P<0.05]。h-ACSL3组穿过基底膜细胞数少于对照组[(1 445.33±107.75)个比(1 963.00±294.28)个， t＝2.861， P<0.05]。h-ACSL3组细胞凋亡率高于对照组[(7.28±1.95)%比(3.53±0.24)%， t＝－3.305， P<0.05]。h-ACSL3组细胞脂滴积累减少。 结论:ACSL3在ccRCC中表达降低，ACSL3过表达会抑制ccRCC的增殖、迁移、侵袭能力，促进细胞凋亡，影响癌细胞中脂滴聚集。

摘要：目的基于生物信息学方法筛选肾透明细胞癌关键基因,识别可能的微RNA(miRNA)-mRNA作用轴,探讨相关基因在肾透明细胞癌组织和细胞中的表达。方法选取基因表达综合(GEO)数据库基因表达谱GSE40435、GSE71302数据集,肾透明细胞癌TCGA-KIRC数据集来自癌症基因组图谱(TCGA)数据库。采用R软件筛选差异表达的mRNA和miRNA,并对mRNA进行功能富集分析。采用STRING数据库和Cytoscape软件进行蛋白质互作分析。采用Oncomir数据库筛选预后相关的差异表达miRNA。采用TargetScan和miRDB靶基因预测工具筛选miRNA可能调控的靶基因。收集2021年6月至12月山西医科大学第一医院收治的34例肾透明细胞癌患者的组织样本及临床资料,并选择正常肾细胞株293T和肾透明细胞癌细胞株786O。采用实时荧光定量聚合酶链反应检测基因的相对表达量;蛋白质印迹法、免疫组织化学染色法检测目的蛋白的表达水平;双荧光素酶报告基因实验验证基因间的靶向关系。结果差异分析筛选得到1351个差异表达mRNA和50个差异表达miRNA。功能富集分析提示肾透明细胞癌中脂肪酸代谢、异生物质代谢等途径被抑制,细胞凋亡、免疫应答途径被激活。蛋白质互作分析提示肾透明细胞癌中信号转导、蛋白泛素化等途径起到关键作用。筛选结果显示miRNA-224-5p(miR-224-5p)与肾透明细胞癌进展关系最紧密,且在肿瘤组织中高表达,其预后相关靶基因为NEDD4L。肾透明细胞癌组织与癌旁组织的NEDD4L mRNA相对表达量分别为0.138±0.103、1.000±0.026(t=46.23,P<0.05);miR-224-5p相对表达量分别为1.000±0.043、0.129±0.108(t=45.28,P<0.05)。不同分级及分期肾透明细胞癌组织NEDD4L mRNA、miR-224-5p的表达差异均有统计学意义(均P<0.05)。NEDD4L蛋白在肾透明细胞癌中表达降低。293T与786O细胞中NEDD4L基因相对表达量分别为1.000±0.125、0.210±0.044(t=17.52,P<0.05);miR-224-5p基因相对表达量分别为0.209±0.049、1.000±0.234(t=10.609,P<0.05)。转染后的293T细胞样本中,miRNA模拟物组与阴性对照组的NEDD4L mRNA相对表达量分别为0.236±0.062、1.000±0.024,差异有统计学意义(t=43.56,P<0.05)。NEDD4L蛋白在miRNA模拟物组中表达降低。双荧光素酶报告基因实验提示NEDD4L是miR-224-5p的直接靶基因。结论在肾透明细胞癌中,miR-224-5p靶向调节NEDD4L表达,这一机制可能与肾透明细胞癌的发生、发展有关。

摘要：儿童/青少年性腺功能减退的病因多种多样,且由于在各阶段患儿自身情况不同,使得诊断更加困难。对于性腺功能减退,睾酮替代治疗在多种情况下是唯一的治疗方法,但其在应用方面存有争议。因为儿童/青少年性腺功能减退的鉴别诊断比较困难,且性腺功能减退的治疗方案多为成人设计。对于儿童/青少年的性腺功能减退仍然缺乏标准化的诊断、治疗和监测方案,应根据其的预期治疗目标进行个体化治疗。本研究回顾相关文献并对儿童/青少年性腺功能减退的临床表现、诊断、治疗目的、治疗方式进行综述。

摘要：目的通过生物信息学方法探讨肾透明细胞癌(cc RCC)中脂肪酸合酶(FASN)基因和蛋白的表达水平及其与肿瘤免疫细胞浸润的相关性。方法从癌症基因组图谱数据库检索FASN与cc RCC相关的表达谱数据,通过UALCAN数据库分析cc RCC中FASN基因表达水平及其与cc RCC患者临床病理分期、分级的相关性,使用基因表达谱动态分析网站分析FASN基因与cc RCC患者预后的相关性,使用人蛋白图谱数据库分析人组织中FASN蛋白表达水平,使用肿瘤免疫评估数据库和肿瘤微环境数据库分析FASN与肿瘤免疫的相关性,使用基因注释和分析数据库对FASN及相关基因进行功能富集分析。结果在不同病理分期、分级cc RCC中FASN基因表达水平均显著高于正常组织,FASN基因高表达的患者预后较差。FASN蛋白S207和S2198位点磷酸化水平在cc RCC中显著降低。FASN表达与cc RCC中CD8^(+)T免疫细胞浸润水平呈负相关,与调节性T细胞浸润水平呈正相关,免疫治疗会影响FASN与免疫细胞在cc RCC中共定位。FASN主要参与细胞脂质代谢、甾醇调节元件结合转录因子1激活基因表达、过氧化物酶体增殖物激活受体信号通路、脂肪酸生物合成等生物功能。结论FASN在cc RCC中高表达,且与cc RCC患者临床预后、肿瘤免疫细胞浸润相关。

摘要：目的探讨CDH13基因在肾透明细胞癌(ccRCC)中的表达及临床价值。方法利用TCGA、GEO、CPTAC、HPA、UALCAN、cBioPortal和Metascape数据库分析并探究CDH13基因在ccRCC中的差异表达、预后价值、基因组变异和富集通路。运用qRT-PCR、Western blot和免疫组织化学染色法进一步检测40对ccRCC组织和癌旁组织中CDH13基因的表达水平。结果与正常组织相比,ccRCC组织中CDH13基因的mRNA和蛋白质表达水平明显升高(P<0.05),并且与患者的临床病理特征密切相关。生存分析显示CDH13基因的高水平表达与ccRCC患者较高的总体存活率及无进展生存率显著相关,并且是ccRCC患者预后的独立预测因素(P<0.05)。此外,约4%的ccRCC患者中存在CDH13基因组变异,并且该基因的变异与患者预后相关(P<0.05)。富集分析结果表明,CDH13相关基因主要涉及血管发育、内皮发育、细胞迁移及细胞粘附等生物过程。基于40对临床样本的研究进一步验证了CDH13基因在ccRCC组织中高水平表达。结论作为ccRCC潜在的生物标志物及治疗靶点,CDH13基因在ccRCC组织中呈现高水平表达,并且与ccRCC患者临床病理特征及预后相关。

摘要：肾细胞癌是泌尿系统常见的肿瘤之一。尽管肾细胞癌发病率在世界范围内一直居高不下，但是得益于腹腔镜技术的发展以及靶向药物的应用，癌症的控制和患者的生存率取得了一定的改善。最新研究证实肾细胞癌的进展与肿瘤免疫微环境中的细胞代谢相关。因此在现有手术、免疫治疗的基础上，探求靶向肿瘤细胞代谢途径、干扰肿瘤细胞微环境的新型代谢疗法会为肾细胞癌提供一种独特的治疗方案。

摘要：脂肪酸是维持人体正常生理功能的必需营养物质,在体内需被相关酶激活后才可以进入正常代谢途径,脂肪酸代谢失调与肿瘤发生密切相关。长链酰基辅酶A合成酶(ACSLs)负责激活长链脂肪酸,ACSLs家族包括5个成员,分别为ACSL1、ACSL3、ACSL4、ACSL5、ACSL6,不同亚型具有不同细胞定位及功能,可以催化不同脂类并影响其代谢去路。ACSLs通过调节脂肪酸代谢,广泛参与内质网应激、铁死亡、耐药和肿瘤炎症微环境,ACSLs在肿瘤中经常去调控,可以影响脂肪酸代谢,而脂肪酸可以通过激活多种转录因子与基因反应原件结合激活不同的ACSLs,肿瘤细胞和蛋白泛素化可以调节ACSLs基因的表达,从而导致肿瘤发生代谢紊乱和其他代谢性疾病的发生。Triacsin C是一种ACSLs抑制剂,对开发抗肿瘤药物有巨大潜力。本文就ACSLs在细胞中的表达与定位、生理作用、在肿瘤中的功能、分子机制进行综述,结果表明,ACSLs与肿瘤中的炎症反应、脂质代谢紊乱、肿瘤侵袭与转移相关,对肿瘤发生、发展具有重要意义,可能成为肿瘤治疗有价值的生物标志物和治疗靶点。

摘要：目的:探讨基于生物信息学方法构建的肾透明细胞癌（ccRCC）预后相关的铜死亡相关差异长链非编码RNA（lncRNA）评分公式在患者临床诊断、预后预测以及治疗抉择中的价值。方法:从癌症基因组图谱（TCGA）数据库获取ccRCC患者的基因矩阵和临床数据（数据更新至2022年3月29日）。基因矩阵收录539例ccRCC组织和72例癌旁正常组织表达数据;临床数据收录530例ccRCC患者资料。采用Pearson相关性分析、Wilcoxon符合秩检验和单因素Cox比例风险模型分析筛选预后相关的铜死亡相关差异lncRNA。采用R软件将530例包含生存资料的ccRCC患者以近似1∶1的比例随机抽样分组，分为训练集（266例）和验证集（264例）。采用LASSO回归构建铜死亡相关差异lncRNA评分公式并进行交叉验证。采用受试者工作特征（ROC）曲线评估铜死亡相关差异lncRNA评分公式的特异度和灵敏度，计算曲线下面积（AUC）。根据中位风险值将ccRCC患者分为低风险组和高风险组，采用Kaplan-Meier法分析高、低风险组患者总生存（OS）的差异。采用 t检验分析不同临床病理特征患者的风险值差异。采用R包rms构建可以预测ccRCC患者1、3、5年OS率的列线图。采用R包pRRophetic预测ccRCC患者临床治疗中常见的靶向药物（如索拉菲尼、舒尼替尼等）的半数抑制浓度（ IC50），采用Wilcoxon符号秩检验比较高、低风险组患者 IC50值。收集山西医科大学第一医院2021年6月至12月行根治性肾切除术患者经病理检测确诊的20例ccRCC组织及其配对癌旁正常组织。实时荧光定量聚合酶链反应（qRT-PCR）检测ccRCC组织关键lncRNA的表达。 结果:基于TCGA数据库中ccRCC患者10个铜死亡基因（FDX1、LIAS、LIPT1、DLD、DLAT、PDHA1、PDHB、MTF1、GLS、CDKN2A）的表达矩阵，筛选出153个与预后相关的铜死亡相关差异lncRNA。LASSO回归分析，最终得到包含4个铜死亡相关差异lncRNA的评分公式：风险值=0.020×AC015912.3+0.011×AC026401.3+0.063×AC103706.1+（-0.076）×EPB41L4A-DT。根据中位风险值（0.76）将患者分为高风险组（≥0.76）和低风险组（0.05）。构建的列线图对于患者1、3、5年OS率具有较好的预后准确性。高风险组应用舒尼替尼、西罗莫司敏感性更高，低风险组应用阿昔替尼、索拉非尼、帕唑帕尼敏感性更高。qRT-PCR检测结果表明，ccRCC肿瘤组织与癌旁组织比较，AC015912.3基因相对表达量为1.00±0.04比0.68±0.24（ t=6.37， P<0.01），AC026401.3基因相对表达量为1.00±0.05比0.64±0.22（ t=7.29， P<0.01），AC103706.1基因相对表达值为1.00±0.04比0.64±0.20（ t=7.49， P<0.01），EPB41L4A-DT基因相对表达量为1.00±0.06、0.73±0.10（ t=10.68， P<0.01）。 结论:基于TCGA数据库构建的铜死亡相关差异lncRNA评分公式可作为ccRCC患者临床诊断、预后预测的新型指标，帮助指导患者的临床药物治疗，有助于精准诊疗。