摘要：目的了解广州地区2008年5—6月份手口足病的病原。方法设计肠道病毒71型、柯萨奇病毒A16型和肠道病毒属通用实时荧光RT—PCR引物和TaqMan探针，运用TaqMan实时荧光***技术，对2008年5至6月，到广州市儿童医院就诊的疑似手足121病患儿咽拭子标本1023例（份），同时分别进行肠道病毒属、肠道病毒71型和柯萨奇病毒A16型检测。对肠道病毒属荧光RT—PCR检测阳性，而肠道病毒71型和柯萨奇病毒A16型荧光RT—PCR检测阴性的标本进行5’非编码区（Untranslated RegionUTR）的扩增和序列测定。结果在1023份临床标本中，肠道病毒属阳性434例，检出率为42．42％。其中，肠道病毒71型276例，柯萨奇病毒A16型126例，肠道病毒84型4份，埃可病毒11型3例，埃可病毒9型2例，柯萨奇病毒B3型3例，柯萨奇病毒A10型4例，柯萨奇病毒A6型3例，柯萨奇病毒A12或A5型6例，另有7例难以区分型别，没有混合感染。结论2008年5—6月广州地区手足口病的主要病原是肠道病毒71型和柯萨奇病毒A16型，并有肠道病毒84型、柯萨奇病毒A10型、柯萨奇病毒A12型、柯萨奇病毒A6型、柯萨奇病毒B3型、埃可病毒11型、埃可病毒9型等小部分其他型别肠道病毒感染。

摘要：目的研究2008年和2010年广州地区手足口病患者中肠道病毒7l型（EV71）病毒全基因组序列的基因型与变异特点。方法参照GenBank上EV71深圳株SHZH03（AY465356）基因组设计分段扩增引物，进行RT-PCR分段扩增EV71病毒基因组，PCR产物直接进行序列测定，用Clustal W／X、DNASTAR、MEGA4．1等软件分析基因组序列。结果克隆9株广州株EV71，病毒全基因组全长序列均为7405bp，提交到GenBank上的序列号为HQ456305、HQ456306、HQ456307、HQ456308、HQ456309、HQ456310、HQ456311、HQ456312、HQ4563i3。将9株广州株EV71与EV71的A、B3、B4、B5、C1、C2、C3、C4型及阜阳株全基因组核苷酸序列进行ClustalW比较，发现与C4a型阜阳株等同源性为98％～99％，与C4b同源性为91％～93％，与c1～c3同源性为82％～83％，与B3。B5同源性为81％～83％，与A型同源性为80％。将9株广州分离株EV71的VP1基因与EV71病毒A、B、C型进行ClustalW比较，同样是与C4a为98％-99％，与C4b同源性为92％～94％，与C1-C3的同源性为88％～89％，与B1～B5型同源性为83％～84％，与A型同源性为81％～82％。将9株广州株与EV71的A、B、C型VP1基因氨基酸序列进行Clustal W比对，发现VPI基因22位点的谷氨酰胺转变为组氨酸（0-H），聚合蛋白中213位点（S—T）和1764位点（V—I）也发生了氨基酸的点突变，P的213位点属于VP2基因，1764位点属于3D基因。结论2008年和2010年分离的9株广州株EV71属于C4a型，与阜阳株同源性为98％～99％，VP1基因22位点发生了点突变，聚合蛋白中213位点和1764位点也发生了氨基酸的点突变。

摘要：目的 探讨广州地区儿童感染的偏肺病毒基因组分子结构特点和基因型类型.方法 参考GenBank上的偏肺病毒00-1株（AF371337）基因组设计分段扩增引物,进行RT-PCR分段扩增偏肺病毒基因组,克隆于T载体上,序列测定,用Clustal W/X、DNASTAR、MEGA4.1等软件分析基因组序列.结果 偏肺病毒hMPVgz01全基因组为13 327 bp,提交到GenBank上的序列号为GQ153651,有8个开放阅读框（open reading frames,ORFs）,基因组结构为：3-N-P-M-F-M2-SH-G-L-5;将hMPVgz01株全基因组核苷酸序列与GenBank上的偏肺病毒全基因组序列进行Clustal W比较,发现与偏肺病毒的A组相似性较高,为92%～97%,与A2b组的BJ1887相似性为最高,而与B组相似性为81%,与C组的禽偏肺病毒为71%.将hMPVgz01株的N、F、G基因与偏肺病毒的A1、A2、B1、B2的相对应基因进行相似性比较,同样也是与A2b型的相似性为最高,因此确认广州地区的hMPVgz01株为A2b型.结论 广州地区儿童感染的偏肺病毒hMPVgz01株全基因组序列为13 327 bp,GenBank 序列号为GQ153651,hMPVgz01与偏肺病毒的A2b型相似性最高,确认hMPVgz01株属于偏肺病毒A2b型.

摘要：目的建立基于PCR-RDB技术的可同时检测中国人群G6PD最常见的4种基因突变类型的基因分型方法并对其作出评价。方法分别针对中国人群G6PD最常见的4种基因突变类型95(A→G)、1376(G→T)、1388(G→A)、1024(C→T)设计PCR扩增引物和基因分型探针,将探针固定到尼龙膜上制做成杂交膜条,建立PCR扩增体系和杂交体系。利用13例已知基因型的样本建立针对这4种基因突变类型的PCR-RDB检测方法。盲法对109例上述4种G6PD样本和正常样本进行PCR-RDB检测以及基因序列测定,并对两种方法所得结果进行对比。结果 PCR-RDB法准确地检测出了检测范围内所有的突变类型和正常样本,检测结果与测序结果完全一致。结论 PCR-RDB是一种经济、简便、高效、准确的G6PD基因分型方法 ,可用于G6PD的分型诊断和分型研究,并可做为一种常规方法推广到临床进行基因分型检测。

摘要：目的了解2016年至2017年广州市手足口病流行病学及非肠道病毒A组71型(enterovirus 71, EV-A71)病毒非柯萨奇病毒A组16型(coxsaekievirus group A 16,CV-A16)病毒的分子流行病学特征,为其治疗和防控提供依据。方法运用荧光反转录-PCR对2016年至2017年疑似手足口病患者标本同时进行EV通用型、EV-A71、CV-A16检测,并选取EV-A71和CV-A16是阴性而EV通用型是阳性的标本进行型别鉴定,设计5′非编码区(UTR)引物,RT-PCR扩增后进行序列测定,用BLAST程序进行序列的EV型别确定。结果2016年至2017年同时进行EV通用型、EV-A71型、CV-A16型3类病毒的疑似手足口病例标本共25 779份,总阳性16 300份,阳性率为63.23%;其中EV-A71阳性1 178份,占4.57%;CV-A16阳性3 274份,占12.70%;非EV-A71非CV-A16EV阳性标本11 848份,占45.96%。2017年非EV-A71非CV-A16EV全年平均检出率(55.68%)比2016年检出率(35.14%)更高。95份非EV-A71非CV-Al6阳性标本的序列分析结果有16种型别,分别为CV-A6、CV-A10、CV-A4、CV-A2、CV-A8、CV-A12、CV-A9、CV-B5、CV-B2、CV-B4、CV-B3、E1、E16、E30、E2和E18,其中CV-A6占主,(26.32%),其次是CV-A10(15.79%),这两种病毒占到非EV-A71非CV-A16EV的42.11%。结论2016年至2017年EV-A71感染较低,2016年4月至7月CV-A16存在一个感染小高峰。2016年至2017年手足口病主要以非EV-A71非CV-A16为主,序列分析表明非EV-A71非CV-A16中以CV-A6和CV-A10为主,应加强对以CV-A6、CV-A10为主的非EV-A71非CV-A16的研究及监测。