摘要：乳头瘤病毒(PV)是人畜共患的重要病原体。为调查北疆地区马携带的PV类型,本研究对北疆3个地区采集的205份马鼻拭子样品进行高通量测序和宏病毒组学分析,结果显示马匹携带人乳头瘤病毒124型(HPV-124)。根据HPV-124 E6基因序列设计引物,对800份各种临床样品经PCR检测HPV-124 E6基因,PCR结果显示,健康马鼻拭子样品中HPV-124的总阳性率为2.4%(4/168),存在呼吸道疾病的马鼻拭子中HPV-124的阳性率为100%(37/37),表明HPV-124可跨种感染马,且与呼吸道疾病密切相关;在纯血马和伊犁马流产胎儿胎盘、脐带样品中也检测到HPV-124,表明HPV-124可垂直传播,可能与马流产有关。另外,在多个马场工人鼻拭子中均检测到HPV-124,提示马源HPV-124可能来源于人。E6基因序列的同源性分析结果显示,本研究鉴定的2株人源和5株马源HPV-124 E6基因与美国HPV NJ3900株E6基因同源性均为100%,进一步表明马源HPV-124可能来源于人。采用最大似然法绘制E6基因的进化树,结果显示,本研究鉴定的马源HPV-124与人源HPV-124形成独立进化分支,均处于Beta-1进化分支。本研究首次在马体内扩增到HPV-124 E6部分基因序列,它与人源HPV-124同源性达100%,HPV-124可能会跨物种感染马,并导致感染马流产,该研究结果为动物源HPV-124的流行病学研究提供了参考依据。