摘要：为研究苏州太湖地区桔类资源的遗传多样性,从设计的41对EST-SSR和Indel引物中筛选出20对多态性强、重复性好的引物,对38份采自苏州太湖地区及长江流域其他地区的柑桔种质DNA进行了扩增,对多态性位点进行了统计,采用群体遗传结构分析、主成分分析和聚类分析方法对不同材料的亲缘关系进行了分析。结果表明,利用筛选的20对引物扩增,共获得84个多态性标记位点,240条多态性条带,统计所得38份柑桔种质的观测等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、观测杂和度(Ho)、期望杂和度(He)以及香农多样性指数(I)平均值分别为3.63、2.06、0.215、0.435和0.79。遗传结构分析、聚类分析和主成分分析结果表明,苏州地区的黄皮桔和朱红桔是两个古老的桔类资源,长江上游流域的红桔是与朱红桔不同的古老桔类资源;城固冰糖桔、大头料红、迟红为杂种起源类型,南桔、福桔与黄皮桔的亲缘关系较近,土桔、土柑为黄皮桔和朱红桔的杂种类型。黄皮桔和朱红桔应作为重要的古老桔类资源加以保护。