摘要：运用微扰MP2和密度泛函B3LYP方法在不同的基组水平上对锂离子与一系列以杂环为主的芳香化合物所形成复合物的可能构型进行了优化 ,获得了复合物的几何构型、电荷转移量、结合能等重要信息 ,对阳离子 π作用与阳离子 -杂原子作用的竞争情况进行了讨论 .特别是 ,我们发现此体系阳离子 π复合物的结合能和芳环单体中心上方一个点的静电势成很好的线性相关 .揭示了锂离子与芳香杂环形成阳离子 π复合物的形成过程中静电势起着非常重要的作用 ;同时表明 ,可用芳环表面静电势来定量预测较复杂体系阳离子 π作用结合能的大小 .

摘要：从三种冠状病毒主要蛋白酶SARS 3CL ,HCoV 3CL和TGEC 3CL蛋白酶结构出发 ,着重研究了三种蛋白酶二聚体单体之间的静电和疏水相互作用 .用连续介质模型有限差分方法计算得到三种蛋白二聚体界面处的静电势 ,发现三种蛋白酶单体和单体之间静电势分布具有明显的互补性 ,三种蛋白酶二聚体单体之间具有相同的静电相互作用能 .用溶剂可及表面积模型分析了分子表面积及疏水性 ,发现三种蛋白酶具有相同的疏水分布 ,其中SARS 3CL蛋白酶疏水率为 74% ,驱动其单体聚合成二聚体 .对三种蛋白酶的去溶剂化能疏水项的计算表明 ,三种蛋白酶二聚体单体之间具有相似的疏水相互作用能 .

摘要：采用实验和计算的方法研究了甲磺酸培氟沙星与人血清白蛋白之间的结合作用.荧光法测得甲磺酸培氟沙星与人血清白蛋白形成一种类型的复合物,结合常数为1.7×105L·mol-1,有1.05个平均结合位点;微量热法测得该药物-蛋白结合过程中焓变为1.03kJ·mol-1,熵变为101.28J·K-1·mol-1,反应为熵驱动.用分子对接的方法预测了甲磺酸培氟沙星与人血清白蛋白的结合模式.计算表明,甲磺酸培氟沙星可结合在人血清白蛋白的两个药物结合位点,疏水作用即熵效应在药物与蛋白的结合中起重要作用,预测的结合自由能和实验值基本一致.

摘要：采用分子模建的方法构建了诺氟沙星-DNA复合物的初始结构,通过2 ns的分子动力学(MD)模拟研究表明:诺氟沙星能够和双螺旋d[ATATCGATAT]_2形成稳定的复合物,药物分子可紧密结合在DNA的小沟区域,并且能够与DNA的鸟嘌呤碱基形成两个稳定的氢键．在分子水平上提供了诺氟沙星直接与双螺旋DNA相互作用的结构及复合物的动态变化情况．