摘要：选取丝氨酸蛋白酶超家族作为研究对象, 采用SSAP算法从结构比较的层次上进行蛋白质超家族分子进化的研究. 分析了相同或相似物种中酶结构和功能的演化、鼠类胰蛋白酶突变体结构的聚类关系以及不同抑制剂对牛?-胰蛋白酶天然结构的影响, 探索了结构比较对于蛋白质工程中定点突变改造蛋白质结构与功能以及蛋白质抑制剂设计等方面的指导作用. 基于结构比较的方法是蛋白质分子进化研究的一种新方法.

摘要：目的:为克服目前组织工程中细胞和材料的复合方法中存在的缺陷,利用细胞装配系统将细胞和材料的共混物按照预先设定的结构直接打印成三维复合支架,并通过体外培养检测支架里细胞的形态和活性。方法:实验于2006-06/2007-03在清华大学生物膜与膜生物工程国家重点实验室和清华大学机械系组织制造中心完成。①选用海藻酸盐和明胶的混合水凝胶作为支架材料,配制终浓度为7%且藻酸盐和明胶比例为3∶4的混合物,用CaCl2溶液交联后,冷冻干燥,用扫描电镜观察共混材料的内部结构。②取出生3～5 d的新西兰乳兔的关节软骨组织,用Ⅱ型胶原酶消化获得原代软骨细胞并体外扩增至2或3代后备用。③将软骨细胞悬液与复合水凝胶混合均匀后,再利用快速成形技术组装的细胞装配系统将此共混物直接打印成组织工程三维复合支架,并体外培养此复合支架。④在培养的1,7,14和21 d采用MTT的方法检测软骨细胞在支架中的增殖;培养7 d后用苏木精-伊红染色的组织学方法观测细胞的形态;培养14 d后采用免疫组化检测支架中软骨细胞的Ⅱ型胶原表达。结果:①扫描电镜观察的结果表明共混物的内部是交错的网格结构,有着互相连通的孔。②在细胞装配系统上按照预先设计的参数将细胞和材料直接组装为网格状的细胞/凝胶复合支架,尺寸为10 mm×10 mm×6 mm,锥虫蓝染色表明成形后支架里细胞的存活率大于90%。③MTT实验表明软骨细胞在细胞/凝胶的支架里增殖很快,21 d的吸光度是1 d的3.5倍。④苏木精-伊红染色显示体外培养7 d后,复合支架里的软骨细胞都是圆形的,是生理状态下软骨细胞的正常状态,而且还可以看到正在分裂的细胞。⑤免疫组化的结果表明培养14 d后,培养在支架里的软骨细胞仍保持着分泌Ⅱ型胶原的活性。结论:通过细胞装配系统按照预先设定的结构形成包含细胞的软骨组织工程三维支架,成形的一系列操作对细胞损伤极小,并且支架里的软骨细胞在体外培养中能够正常的生长,具有生理形态和软骨活性,从而为软骨修复提供了新途径。

摘要：继人类基因组计划后，后基因组时代揭开了序幕。在后基因组时代，功能基因组与蛋白质组的研究将进一步揭示基因的表达调控规律和所表达蛋白质的生物学功能。这将推动生物技术发展进入一个更精确、更高效设计和应用的新阶段。同时生物芯片技术对生命科学发展起了很大的推动作用。中药现代化研究，应该大力借鉴和引入这些新观念和新技术，发展和完善自身理论体系，使传统中药的研究能够与现代科技研究接轨，开创中药现代化研究的新局面。作者论述的后基因组时代核心生物技术的进展，对中药材生产、中药鉴定、中药化学、中药药理等学科发展的影响，值得一读。本文对于中医药研究人员洞察宏观发展趋势，拓宽创新思路具有较高的参考价值。

摘要：香石竹斑驳病毒(CarMV)是侵染香石竹的主要病毒.关于该病毒的株系和不同地区分离物的病毒核酸序列研究报道较少.我们根据Guilley报道的该病毒的核酸序列设计引物,对香石竹斑驳病毒云南分离物的CP基因进行了RT-PCR扩增和序列分析.

摘要：探针集的挑选是寡核苷酸芯片设计过程中最重要的部分。基于合成探针成本的考虑,探针的个数成为评价探针集优劣的一个最重要的指标。一个好的探针挑选算法应该挑选出尽可能少的探针。为此,对探针选取的贪心算法作了改进,提出一个类似于逐步向前回归算法的探针选取算法。该算法在每次向探针集加入边际效用最大的探针的同时,把边际效用没有或者很小的探针从探针集中剔除出去。对HLA等位基因数据的实验结果表明,逐步选取算法得到的探针集优于贪心算法挑选出的探针集。

摘要：在NCBI网站BLAST得到5个烟草表达序列标签(EST),据此设计引物,从烟草(Nicotianabenthamiana)品种本塞母氏中分离出2条DREB(dehydration-responsiveelementbindingprotein)-like转录因子基因,分别命名为NbDREB1和NbDREB2。与相关AP2/EREBP类转录因子比对结果显示,NbDREB1和NbDREB2都具有典型的AP2/EREBP转录因子家族EREBP亚族A类AP2区特征,并且都能在大肠杆菌(Escherichiacoli)中表达。酵母单杂交结果显示,都不具有激活功能。连接pGADT7反式激活载体进行酵母单杂交结果显示:NbDREB1能与DRE顺式作用元件结合,NbDREB2则不能,表明NbDREB1为抑制型DREB类转录因子。比较NbDREB1和NbDREB2的AP2区发现:两者在第2位和第49位氨基酸处不同,NbDREB1为Y和K,NbDREB2为N和R。

摘要：脂蛋白代谢过程十分复杂。从血浆中的酶和蛋白到细胞膜上的各种蛋白与受体 ,从细胞内的一些酶类到细胞核中的一些转录因子 ,这些生物活性因子无不参与了脂蛋白代谢的过程。调节它们可优化脂蛋白和脂质代谢 ,发挥抗动脉粥样硬化 (atherosclerosis ,AS)作用。同时一些可作为新药设计的新靶点 ,据此有可能设计出一批具有新作用机制的药物 。

摘要：背景:甲基强的松龙(MP)具有多方面的神经保护作用,目前广泛应用于治疗急性颅脑和脊髓损伤,但其作用机制尚不完全清楚。目的:探讨大鼠脊髓损伤后应用大剂量甲基强的松龙(MP)对诱导型一氧化氮合酶(iNOS)表达及细胞凋亡的影响。设计:采用随机分组、安慰剂对照实验研究。单位:大连医科大学第一附属医院骨科。材料:实验在大连医科大学第一附属医院骨科实验室完成。成年雄性SPF级SD大鼠56只,体质量300～350g。由大连医科大学实验动物中心提供。干预:成年大鼠随机分为脊髓损伤后应用大剂量甲基强的松龙组(A组)和应用生理盐水组(B组)。损伤后不同时间点(4,8h,1,3,7,14,21d)按Tarlov标准评价大鼠双后肢神经功能恢复情况,然后处死。用苏木精-伊红(HE)染色观察损伤脊髓组织病理变化,用免疫组化染色检测iNOS阳性细胞,原位末端标记法(TUNEL法)标记凋亡细胞。主要观察指标:两组大鼠各时相点iNOS表达阳性细胞率,凋亡指数和Tarlor平分。结果:HE染色镜检发现脊髓组织病理学改变甲基强的松龙组明显轻于生理盐水组。两组均发现凋亡细胞及iNOS表达,神经细胞凋亡指数及iNOS表达均为生理盐水组大于甲基强的松龙组(P<0.01或P<0.05)。结论:大剂量甲基强的松龙能抑制大鼠脊髓损伤后iNOS表达及细胞凋亡。

摘要：设计了3对含不同数目CpG基元(CpGmotifs)的引物,用SARS冠状病毒(SARSCoV)S1基因片段作为靶基因,通过PCR扩增出目的片段,插入真核表达载体pVAX1中。用电击法把构建好的不同质粒注入相应组BALB/c小鼠的股四头肌,2周后再加强免疫一次。每周分别测定血清IgG1和IgG2a抗体水平。结果,免疫组IgG1和IgG2a抗体浓度以及IgG2a与IgG1的比值均显著增加(P<0.001)。表明所构建的SARSCoVS基因S1片段的真核表达质粒可诱导小鼠产生很强的免疫反应。

摘要：目的探讨Polycomb家族基因Nspc1在模式生物斑马鱼发育早期的表达模式。方法根据GenBank中斑马鱼Nspc1的cDNA序列设计Nspc1原位杂交探针片断,并制备地高辛标记的探针。收取单细胞期、双细胞期、胚芽期及不同时间点的体节期斑马鱼胚胎,用制备好的探针作原位杂交,显微镜下拍照,获得信号适当的杂交结果。结果在斑马鱼体节期前,Nspc1在全身表达;从体节期开始,其表达逐渐表现出特异性,主要在头部的神经系统中表达。结论Nspc1在模式生物斑马鱼的早期发育、尤其是神经系统发育的过程中可能扮演重要角色。