摘要：目的 对沙眼衣原体（Ct）主要外膜蛋白（MOMP）细胞毒性T淋巴细胞（CTL）表位进行预测和选择，并进行Ct MOMP多表位基因克隆和多表位蛋白的原核表达及其抗原性分析，为研制多表位Ct疫苗提供基础资料。方法利用SYFPEITHI法和多项式方案结合预测HLA-A2限制性的0MOMP的CTL表位，选取含多个CTL表位的基因片段作为目的基因，兼顾目的基因上下游存在的TH和B细胞表位的基因，共同组成含CTL、TH和B细胞表位的多表位基因。多表位基因经密码子优化后进行全序列合成，克隆入原核表达载体pET-32a（＋），经IPTG诱导在大肠杆菌BL21（DE3）表达并纯化，经SDS-PAGE和Western blot分析鉴定表达产物。结果 经预测筛选得到了多个MOMPHLA-A2限制性的CTL表位，成功克隆了含CTL、TH、B表位的MOMP多表位基因，并在大肠杆菌中获得了高效表达。表达产物的相对分子质量（Mr）约24×10^3，与预期肘，相符，并用Western blot方法初步证实多表位蛋白有抗原特异性。结论 成功设计了Ct MOMP的T、B细胞多表位基因，并证实在原核表达系统中获得正确表达的多表位蛋白具有良好的抗原性。

摘要：目的预测人类表皮生长因子受体2(HER2/neu)的B细胞表位,为肿瘤免疫治疗提供理论基础。方法以生物信息学软件综合预测筛选HER2/neu可能B细胞表位,以吴氏平均抗原性指数为标准,确定目的表位。结果HER2/neu为一跨膜蛋白,其二级结构中以无规则卷曲的区域出现较多。其N端第497～504,939～943,1 106～1 116,1 140～1 158,1 166～1 175,1 225～1 234,1 240～1 246区段,可能为HER2/neu的优势B细胞表位。结论应用多参数预测HER2/neu的B细胞表位,可进一步为HER2/neu相关肿瘤治疗性表位疫苗分子设计和研究提供理论依据。

摘要：目的:预测EB病毒(EBV)潜伏膜蛋白2(LMP2)的二级结构和B细胞表位。方法:以EBV标准株(B95.8)LMP2的完整氨基酸序列为基础,采用SOPMA、GOR、nnPredict和HNN四种方法分别预测LMP2的二级结构;并结合其跨膜区域、亲水性、表面可及性、抗原性、极性和柔韧性等进行综合分析,预测EBV LMP2的B细胞优势表位。结果:四种方法对EBVLMP2二级结构的预测均表明,其二级结构中柔性区域以无规卷曲为主,少见转角。B细胞优势表位可能位于其N端199～209、318～322和381～391区段。结论:用多参数预测EBV LMP2的二级结构和B细胞优势表位,可为其单克隆抗体的制备和表位疫苗设计等研究提供理论依据。

摘要：目的分析癌胚抗原(carcinoembryonic antigen,CEA)的B细胞表位,为肿瘤治疗提供理论基础。方法以CEA的完整氨基酸序列为研究基础,采用Hopp&Woods的亲水性方案,Emini表面可及性方案和Jameson-Wolf抗原指数方案,辅以CEA的二级结构及其柔性区域分析,预测CEA的B细胞表位。结果预测的B细胞表位可能位于CEA的N端第150￣160、168￣172、207￣211、332￣338、372￣377、467￣472、485￣490、507￣516、580￣584区段。结论应用多参数预测CEA的B细胞表位,可进一步用于CEA相关肿瘤治疗性表位疫苗的分子设计和研究。