摘要：以NCBI维护的一级数据库为数据源建立植物激素相关核酸和蛋白质二级数据库。将该二级数据库设计为基因、蛋白质和文献三部分,编写软件从上述数据源中采集数据,并以XML作为中间格式保存,通过解析提交到二级数据库中并集成部分生物信息学工具软件,初步实现了数据检索、统计分析、基于Web的本地化BLAST同源序列检索、序列的自动拼接以及蛋白质结构和功能位点的分析等功能。该二级数据库的构建为植物激素作用分子机理研究提供了高针对性的植物激素数据源和生物信息学辅助工具。

摘要：为了研究高钾植物商陆高亲和性K+吸收机制,本试验选用野生商陆为材料,以拟南芥、冰叶日中花、小麦、大麦和水稻等多种植物的HAK家族基因的保守序列,设计简并引物,获得了981bp的PaHAK1的基因片段。然后应用RACE技术克隆到PaHAK1基因序列,其cDNA全长为2337bp,编码771个氨基酸。该编码蛋白质分子量为86.66kDa,等电点为7.54。蛋白质疏水性和拓扑结构分析显示该氨基酸序列共有12～13个跨膜区。该cDNA序列与冰叶日中花HAK1基因序列相似性高达88%。Real-Time PCR分析表明PaHAK1主要在商陆根中表达,低钾状态可以诱导PaHAK1的高表达。

摘要：生长素受体TIR1通过形成SCFTIR1复合体与生长素直接结合,即为Aux/IAA在26S蛋白酶体降解过程中的关键蛋白质。在Blast检索和生物信息学分析的基础上设计特异引物,以超级杂交水稻(Oryza sativa)亲本株1S为材料,通过RT-PCR扩增并经T-A克隆后测序,获得一条长度为2219bp的序列,其开放阅读框长度为1764bp,编码含587个氨基酸残基的肽链。该序列经生物信息学分析发现,其与拟南芥TIR1相似性为77%,同样具有2个保守的结构域,即F-box和亮氨酸富集重复区域(LRR),且都不具有跨膜结构域和信号肽。该cDNA序列命名为OsTIR1。

摘要：通过生物信息学分析得到正确的水稻镁离子螯合酶H亚基（Mg-chelatase H subunit，CHLH）的cDNA。以超级杂交稻母本株1S为材料提取总RNA，并反转录成cDNA，用得到的序列设计特异引物，经PCR扩增出株1ScDNA片段，cDNA片段经T-A克隆后进行测序，获得一条长1350bp序列。提交NCBI的GenBank数据库后接收，登录号为EU569725。

摘要：小麦籽粒中高分子量麦谷蛋白的含量与小麦的品质密切相关。通过Blast检索和生物信息学分析设计小麦高分子量麦谷蛋白亚基基因Dx5的特异引物,以优质小麦济麦20基因组DNA为模板,通过PCR扩增后测序,获得长度为2 619 bp的序列。生物信息学分析表明其开放阅读框长度为2 520 bp,编码839个氨基酸残基,与GenBank数据库中的Dx5蛋白质一致性最高达到99%,且具有高分子量麦谷蛋白亚基结构域。该序列命名为JMDx5,提交GenBank数据库后被接收,登录号为KJ144185,为后续研究其表达机理及改良小麦品质奠定了基础。

摘要：采用CTAB法提取籼稻的基因组DNA;根据TIGR数据库中Os VQ6基因序列设计合成特异性引物,通过PCR扩增成功地获得了籼稻Os VQ6基因。该基因具有VQ结构域,其编码区全长为351 bp,编码116个氨基酸残基。经T载体连接转化后测序,进一步构建了Ca MV 35S启动子驱动Os VQ6基因的植物表达载体p SN1301-Os VQ6。

摘要：目的:VQ模序蛋白是植物中所特有的一类具有高度保守序列的蛋白质,广泛参与植物的生长发育与逆境反应,本研究拟克隆拟南芥的AtVQ29基因并进一步构建由组成型启动子CaMV 35S驱动的植物表达载体pSN1301-AtVQ29。方法:采用CTAB法提取拟南芥基因组DNA,根据已报道的AtVQ29基因序列设计并合成引物,通过PCR技术扩增获得拟南芥AtVQ29基因,经T载体克隆后测序。利用生物信息学软件对序列进行初步分析,同时基于基因重组技术构建植物表达载体。结果:序列分析表明已成功克隆AtVQ29基因,该基因编码区全长为372bp,共编码123个氨基酸残基,具有保守的VQ模序。并进一步构建了由组成型启动子CaMV 35S驱动的AtVQ29基因植物表达载体pSN1301-AtVQ29。结论:本研究所构建的AtVQ29基因植物表达载体能够在转基因植株中过量表达AtVQ29基因,为后期开展基因功能研究与植物基因改良奠定了基础。

摘要：基于Chalkiness V1.0,以Visual C++.NET为开发工具,设计开发计算机图像处理系统Chalkiness V2.0,专用于NY147—88标准中优质稻米分级质量指标垩白粒率、垩白度和粒型等参数的检测。系统由图像数据预处理模块、样品识别模块、垩白识别模块、长宽比识别模块、统计分析模块和输出模块组成。运用该系统测定丰源B、密阳46和日本晴等3个水稻品种稻米垩白指标,只需1次图像分析即可输出垩白粒率、垩白度、投影面积等参数。

摘要：为了探索利用PCR简单扩增高GC含量的长重复序列的方法,经反复摸索后选用LAPCR法即LAPCRTaq酶结合GC缓冲液Ⅱ来扩增奶牛高GC含量的长片段重复序列,成功获得了全长2538bp,GC含量为65.7%的DNA序列,其中ITS1的GC含量高达80%.探索了克隆复杂DNA序列时引物设计的特别规则、反应体系的改进、DNA聚合酶的选用等措施.

摘要：研究生的教育水平是一个国家核心竞争力的标志,而高等教育发展的核心任务是如何提高研究生的教育质量。保障研究生培养质量的关键在于课程学习,因此,良好的课程建设能够激发研究生的创新潜力,进一步地提升研究生的教育水平。从关于研究生优质课程建设的必要性、课程内容设计与教学实施、课程考核与课程特色及教学感想等方面介绍了湖南农业大学“植物逆境与信号转导”研究生优质课程的建设与实施,为进一步探讨线上线下混合式课程的建设与改革提供了借鉴。