摘要：研究开发了一种基于活版印刷原理的生物芯片原位合成仪。该仪器通过设计友好的触摸屏人机界面对系统进行操作、采用可编程序控制器(PLC)实现基因芯片和多肽芯片合成过程的定位压印和液体传输控制;详细描述了仪器的组成:压印平台、精密印刷模版、平面定位系统、机械手、液气传输系统和控制系统;最后在三坐标仪下测量了该仪器的控制精度,测试结果表明,系统定位精度为28.4μm、重复精度为16μm,印刷模版精度为7μm,能实现高精度定位压印,满足活版印刷原位合成生物芯片的要求。

摘要：用DFT-B3LYP方法,在基组6-31G水平下,对34种N-取代苯基-苯并噻(噁)唑酮-3-甲酰胺类化合物分子进行几何及电子结构全优化,将ELUMO(最低空轨道能),EHOMO(最高占据轨道能),ENLUMO(次最低轨道能),ENHOMO(次最高占据轨道能),ΔE1(=ELUMO EHOMO),ΔE2(=ENLUMO ENHOMO),QZ(分子中原子的净电荷),μ(偶极矩),Ev(零点振动能),E(热力学能),Cv(比热容),Sm(熵)和前沿分子轨道组成及其电子密度等参数被选作量子化学描述符(Lc)。通过最佳变量子集回归建立15种上述化合物对蚕豆蚜和棉红蜘蛛等杀虫活性(SJ:Sa,Su)的QSAR模型。蚕豆蚜的Sa模型的相关系数(R2)和逐一剔除法交叉验证系数Rcv2依次为0.897和0.858,棉红蜘蛛Su模型的相应参数为0.858和0.757。经Radj2,F,Rcv2,VIF和FIT等检验,上述模型具有较强的稳健性和预测能力。根据模型可知,这些化合物杀虫机理包含2点:一是与生物体内大分子之间的电子转移反应,以ΔE1和ENLUMO来描述;二是氢键,用QN2表述。其中,ENLUMO与杀虫活性正相关,而ΔE1和QN2升高,SJ下降。设计与预测19种新颖化合物的杀虫活性,其中2种化合物的杀虫活性均超过100%(质量浓度为500 mg/dm3)。所建模型可为实验工作者合成新型高效N-取代苯基-苯并噻(噁)唑酮-3-甲酰胺类化合物提供理论参考。

摘要：为研究寡核苷酸芯片在确定梨品种S基因型中的应用价值,根据梨自交不亲和基因的结构特点设计了部分S基因的检测探针,并制成寡核苷酸芯片;采用引物Cy3荧光标记法标记检测样品的PCR产物并进行杂交,以检测不同样品的S基因型。结果表明:通过对不同杂交温度、杂交时间等的探索获得了较好的反应条件并用制备的芯片检测了已知S基因型的梨样品,检测结果与各品种的已知基因型相符。证明寡核苷酸芯片检测梨品种的S基因型是一种切实可行的检测方法,若对芯片进一步完善,则在今后梨自交不亲和性状的机理研究及梨自交不亲和性状的利用等方面将有着广阔的应用前景。

摘要：为给梨品种S基因芯片的制备及梨品种自交不亲和性S-RNase基因和S基因型的检测奠定基础,结合已有的对梨自交不亲和S-RNase基因的研究成果及Genbank中梨S-RNase基因信息,利用生物学比对软件Genedoce对梨S-RNase等位基因序列进行比对,得到等位基因HV区的特异序列;用oligo6.71、Premier Premier 5.0和Clustal.W等生物学软件设计特异性高、解链温度Tm值接近、长度均一的oligo探针,获得了24条32 mer的oligo探针。

摘要：研究了一种基于活版印刷原理的中低密度基因芯片原位合成新方法,该方法完全避免了掩模制备过程,合成速度快、制备成本低、便于批量生产,有望满足人们日益增长的对批量基因信息进行快速、低成本检测与分析的要求.对活版印刷法寡核苷酸原位合成原理、合成工艺进行了详细探讨,设计加工了一套手动压印微阵列的合成装置,并对自驱动单体溶液微通道纤维管进行了筛选.应用该方法在连接有手臂分子的载玻片上,分别合成了4条探针、16和160个位点的寡核苷酸微阵列,通过与互补的靶序列杂交和荧光分析,微阵列上相同寡核苷酸探针的位点荧光强度均匀,表明其寡核苷酸探针分布均匀;错配分析还表明得到的寡核苷酸微阵列能实现单个碱基错配的检测.