摘要：目的了解萍乡地方株HPV16 L1基因结构特点,分析其结构蛋白L1基因多态性及蛋白特性变化,为基于L1基因工程疫苗的设计和应用提供理论依据。方法设计HPV16型L1基因特异性引物,从宫颈脱落上皮细胞中提取DNA,进行PCR扩增鉴定,将扩增的片段同T-载体连接,然后导入到大肠杆菌DH-5α中培养,提取质粒DNA进行测序。结果测定的序列与标准基因序列（NC Sbjct 496）比较,萍乡地区宫颈癌感染的HPV16型L1基因同源性为98.9%~99.6%,分别形成5种突变模式,其中3处由于核苷酸的改变,翻译的氨基酸也相应发生变化,但有1处由于核苷酸的丢失造成翻译的氨基酸也相应发生变化。结论萍乡地方株HPV16 L1核酸有一定程度的变异,可能会造成HPV16 L1蛋白免疫原性的差异。.此株改变也可能是本地区导致宫颈癌的主要原因。实验结果为研制适应本地区的基于HPV16 L1的基因工程疫苗提供了可靠实验依据。