摘要：目的采用生物学信息方法分析预测结核分枝杆菌Mce4A蛋白的结构和功能。方法登录NCBI数据库,获取Mce4A蛋白基因信息;运用ProParam工具和ProScale工具分析Mce4A蛋白预测基本理化性质和疏水性;利用SignaIP 4.1Server和TMHMM Server v.2.0工具预测Mce4A蛋白的信号肽和跨膜区;应用SOMPA工具分析Mce4A蛋白的二级结构,并采用SWISS MODEL工具对该蛋白进行三级结构同源建模;运用ABCpred软件和SYFPEITHI预测Mce4A蛋白的B细胞抗原表位和T细胞抗原表位;运用STRING数据库预测Mce4A蛋白的相互作用蛋白。结果Mce4A蛋白基因全长1 203bp,编码400个氨基酸。该蛋白理论分子质量单位(Mr)为42.418 33×103,理论等电点为7.69,分子式为C1900H3022N510O576S6,半衰期为4.4h,脂肪系数为93.70,不稳定系数为27.89,总平均亲水性为0.023,为稳定性亲水蛋白。预测该蛋白在13-35位氨基酸之间形成一个典型的跨膜螺旋区,无信号肽。二级结构中α螺旋、β折叠、β转角、无规则卷曲分别占37%、21%、6.5%和35.5%。预测该蛋白共有18个B细胞抗原表位和23个CTL表位。相互作用蛋白预测显示该蛋白可与5个蛋白协同发挥作用。结论生物信息学分析Mce4A蛋白为稳定性亲水蛋白,具有跨膜区,是典型的跨膜蛋白,在MTB入侵宿主巨噬细胞及存活起重要的作用。该蛋白含有潜在的B、T细胞抗原表位,为药物作用靶位的选定和药物分子的设计提供了新的方向。

摘要：目的研究分枝杆菌噬菌体D29holin基因编码蛋白的理化特点及生物学特性,分析噬菌体抗结核菌的潜力。方法根据GenBank中登录的分枝杆菌噬菌体D29holin基因序列设计上、下游引物,以分枝杆菌噬菌体D29基因组为模板,PCR扩增holin基因,构建重组质粒pET32a-holin,进行双酶切鉴定、测序鉴定及生物信息学分析。结果 PCR扩增得到序列正确的holin基因产物并成功构建重组质粒pET32a-holin。进化分析显示分枝杆菌噬菌体D29holin基因与已知有尾分枝杆菌噬菌体Chy1、Chy4、Chy5holin基因亲缘关系较近。生物信息学分析显示,该基因编码Holin蛋白为稳定、疏水性蛋白,具有2个跨膜区域和亲水性C-端;二级结构中以α-螺旋和无规则卷曲为主,有信号肽,蛋白序列中存在2个丝氨酸磷酸化位点。结论分枝杆菌噬菌体D29 Holin蛋白的两个跨膜区及亲水性C-端构象发生变化,有助于阐明Holin"定时"打孔及启动噬菌体裂解细菌的机制,为研发抗结核Holin多肽药物奠定了基础。