摘要：大麦黄矮病毒GPV株系是我国特有的一个株系,与国外已报道的大麦黄矮病毒MAV,PAV,SGV,RPV和RMY在血清学上无反应.通过对GPV.外壳蛋白基因的序列分析,明确了病毒的外壳蛋白基因由603个核苷酸组成,编码201个氨基酸,分子量为22218ku.同MAV,PAV,RPV株系一样,在GPV外壳蛋白基因框架中(ORF)含有1个Vpg框架结构,分子量为17024ku.外壳蛋白基因序列同源性比较结果显示,GPV株系和RPV株系同源性较高,核苷酸和氨基酸的同源性分别为83.7%和77.5%.而与PAV和MAV株系同源性较低,核苷酸和氨基酸的同源性分别为56.9%,53.2%和44.1%,43.8%.按照GPV外壳蛋白基因序列,设计寡聚核苷酸引物,通过RT-PCR反应,得到GPV外壳蛋白基因全长cDNA,克隆到表达质粒,构建了高等植物表达载体pPPI1,pPPI2和pPPI5.

摘要：从NCBI的EST数据库中获得的木麻黄EST序列共有34 752条,进行拼接后得到全长7 278.578 kb的非冗余序列(Unigene)12 062条,并从中检索得到分布于353条Unigene的367个SSR位点,SSR检出率为2.93%,平均分布距离为19.83 kb,包括39种重复基序类型。其中,以二核苷酸和三核苷酸为主要类型,在总SSRs中所占比例分别为57.77%和34.60%;而二核苷酸重复基序中,AG/CT所占比例最高,为93.87%;在三核苷酸重复基序中AAG/CTT所占比例最高,为44.09%。对检索出的EST-SSR位点设计得到97对引物,其中32对为可有效扩增引物。Blastx分析发现77.3%的含SSR位点的EST序列与非冗余蛋白序列数据库中功能序列具有同源性,而功能已知的序列中葡萄来源的序列占有最大比例(10.4%)。GO功能分类发现,含有SSR位点的EST序列中有47.3%至少具有1个GO注释,归入细胞组分的序列最多,而其中细胞质和细胞核的功能项所占比例较大。