摘要：引物优劣是PCR反应成败的重要影响因素之一,当前引物设计软件存在通量低、操作复杂、开源性不高等不足。本文开发了一款基于R语言和本地BLAST的针对克隆、qRT-PCR、SNP和InDel标记的高通量引物设计软件(LightPrimer)。该软件通过序列信息从基因组当中提取特定序列,进行片段化处理,然后将片段与基因组进行本地BLAST比对,通过序列特异性指数和比对位点数筛选高特异性片段,然后对Tm值、GC含量、扩增片段长度、引物长度、引物3’末端匹配、末端GC碱基和引物二聚体进行筛选,得到候选引物列表,并通过序列评价诊断图为引物优化提供参考。该软件具有高通量、操作简便、跨平台、开源等特点,可为现有引物设计软件提供有益补充。软件可从github下载(https://***/YangtzeSoyGDB/***)。

摘要：【目的】通过转录组测序开发的SSR分子标记分析蚕豆种质资源遗传多样性,挖掘与蚕豆抗豆象性状相关的分子标记,为蚕豆抗豆象种质资源的保护利用及新品种选育提供参考依据。【方法】采用PacBio三代全长测序技术结合RNA-seq方法,对2个蚕豆品种Y134和Y078进行转录组测序,在此基础上,使用软件MISA对转录组所有Unigene序列进行搜索,寻找包含SSR核心基序的Unigene序列,并利用Primer 3.0批量设计引物。随机挑选100对SSR引物对80份蚕豆种质资源进行遗传多样性分析。【结果】100对SSR引物中有50对扩增出产物,有效扩增率为50%;其中32对引物表现出多态性。占有效产物的64%,占总引物的32%。在32对多态性引物中,每对引物扩增等位基因2~21个,平均值为6.875个;多态信息量(PIC)值为0.25~0.82,平均值为0.58;Shannon信息指数变化范围为0.34~2.31,平均值为1.21。基于UPGMA聚类分析将80份蚕豆材料在相似系数0.70处分为两大类:第1类包含65份种质,其中高抗(HR)品种62份,高感(HS)品种2份,感(S)品种1份;第2类包含15份种质,其中高感(HS)品种7份,感(S)2份,高抗(HR)品种5份,中抗(MR)1份。【结论】利用开发的SSR标记分析了80份蚕豆种质资源的遗传多样性,为蚕豆抗豆象种质资源鉴定与分子标记辅助选择育种等方面的研究奠定了理论基础。

摘要：本研究以在检疫中经常被截获的5种豆象为研究对象,通过对GenBank中5种豆象mtDNA COⅠ序列的查询,并进行序列比对,共设计了30对引物,通过筛选获得5对能分别鉴定5种豆象的特异引物,并用50、25、10、5、1、0.5、0.1、0.05ng/μL 8个不同浓度系列的豆象DNA模板来检测灵敏度,结果表明,豌豆象和四纹豆象特异引物对的灵敏度为0.1ng/μL,蚕豆象、菜豆象和绿豆象特异引物对的灵敏度为0.5ng/μL。该方法可用于快速准确地鉴定5种豆象,对于豆象类害虫的检测监测具有重要意义。

摘要：回顾了国内外超级稻育种的历史,介绍了中国超级稻育种的理论与实践。水稻产量的高低是由其"库"、"源"、"流"决定的,以大幅提高单产为主要目标的中国超级稻育种采取"理想株型塑造与亚种间杂种优势利用相结合"的技术路线,将形态改良与生理机能改进、增加生物产量与优化产量结构相结合,以达到"库"大、"源"足、"流"畅的目的。中国超级稻育种取得了巨大成就,据不完全统计,2005-2014年被农业部确认的超级稻示范推广品种达到135个。提出了将超级稻育种研究引向基因层面应作为今后研究工作重点的观点。

摘要：对海洋硅藻硝酸盐转运蛋白NAT3编码基因的单拷贝插入转基因水稻纯系进行荧光定量PCR检测,获得NAT3基因的超表达株系。NAT3超表达株系中硝酸还原酶基因Os NR1的转录较非转基因对照中花11显著增强。对超表达株系及对照中花11进行不同氮素浓度的培养和栽培试验。结果表明,在低氮培养基培养条件下,转NAT3基因水稻的幼苗干重较中花11高;在低氮盆栽条件下,转NAT3基因超表达株系的叶绿素含量、生物学产量和植株的含氮量均较相同氮素条件下的中花11高,说明NAT3基因超表达能提高转基因水稻在低氮条件下的氮素利用效率,促进水稻生长。

摘要：从大田育种材料中发现一份水稻（Oryzn sativa）苗期白化转绿突变体，该突变体2～4叶从边缘部分向内白化，2、3叶白化严重，第4叶转绿，以后叶色均趋于正常，前面白化3叶也逐渐转绿，以后生长基本与野生型相同。遗传分析表明．该基因由1对隐性核基因控制。在人工控温条件下研究表明．突变体为温度敏感性．其白化临界温度为24℃。在大田种植条件下对苗期、分蘖盛期及孕穗期的叶片叶绿素含量和光合速率进行测定。结果表明．3叶期突变体叶绿素含量仅为野生型的36％；分蘖盛期和孕穗期叶绿素含量与野生型相当；转绿后（5叶期）至孕穗期两者在净光合速率、蒸腾系数、胞间CO2浓度、气孔导度等光合特性参数方面相差无几。该突变体仅在苗期表现且易于识别．转绿后对农艺性状及产量影响不大，为理想的标记性状。

摘要：采用大田试验,设计15d(Y1)和20d(Y2)2个秧龄以及6月25日(播期一,B1)、6月30日(播期二,B2)、7月5日(播期三,B3)3个播期处理,以探讨机械插秧下秧龄和播期对晚稻产量的影响。结果表明:播期二和播期一的产量间无显著差异,但分别高于播期三产量8.7%、3.5%,随着播期延后,播期三各产量构成因子除千粒重外,呈下降趋势。H优518最高产量相比最低产量降低速度显著高于鄂粳403,分别达45.0%、13.5%,花后干物质积累H优518也显著大于鄂粳403。综合分析可知,晚籼稻比晚粳稻对低温反应更敏感,前者高产需提早播种,推迟播期不利于结实灌浆,后者高产也需在较早播种基础上保证足够苗数,两者秧龄都不宜超过20d。播期和秧龄可能导致生理上的变化,还需要进一步研究。

摘要：垩白是评价稻米外观品质的重要指标,培育垩白度较小和垩白粒率较低的水稻(Oryza sativa L.)品种是水稻育种研究的重要目标之一。垩白属于复杂的数量性状,受多基因控制,而且易受环境条件影响。近10年来,在水稻12条染色体上定位了近百个与垩白相关的QTL。对控制垩白性状的QTL特别是能稳定表达QTL的定位研究、垩白相关基因的克隆以及垩白性状与其他农艺性状的关联等方面进行了综述,提出了通过分子育种技术并结合表型鉴定技术培育优质稻品种的策略。

摘要：增加穗粒数是提高水稻产量的有效途径,为了培育高产中熟粳稻新品系,采用回交育种并结合分子标记辅助选择技术,将感温型大穗品系HK05418的大穗基因Gn1a导入到感光型优质晚粳品种秀水134中。在BC2F4代得到农艺性状稳定、等位基因纯合、早熟且每穗粒数、单株产量显著优于秀水134的稳定株系C3068。

摘要：设计了一个新分子标记Wx-YMZC,改良检测Wx基因中(CT)n和G/T类型的方法,使用该标记只需要1次PCR扩增和1次酶切即可检测,简化了试验。此方法已获专利授权(专利号:ZL2013 10488947.7)。通过对55份水稻资源进行Wx基因型检测,分析和验证了不同Wx基因类型对直链淀粉含量的影响,即:1高AC(>22.0%)的资源具有较小n值(n≤14)的(CT)n重复次数的等位基因,在除糯米外的其他水稻资源中,具有低或中等AC的资源都具有较大n值(n≥16)的(CT)n重复次数的等位基因;2Wx基因中G型资源的AC高于T型资源;3Wx基因中存在着(AATT)n的重复序列,其中(AATT)6重复序列的资源多属于高AC,(AATT)5重复序列的资源多属于低或中等AC。还利用Wx-YMZC分子标记对13份R7606系列品系进行了应用研究。