摘要：选取64个具有潜力的含磷嘧啶类细胞周期依赖性蛋白激酶(CDK9)小分子抑制剂,采用分子对接方法研究了该类小分子与CDK9的结合作用,结果表明,分子构象、氢键形成、疏水性和氨基酸残基Cys106在此类抑制剂与CDK9的结合过程中具有重要作用.在配体叠合的基础上,运用比较分子力场分析(Co MFA)、比较分子相似性指数分析(Co MSIA)和Topomer Co MFA(T-COMFA)研究了分子结构与抑制活性的关系,发现由训练集立体场、静电场和疏水场组合的Co MSIA模型为最优模型,其内部交叉验证相关系数(Q2=0.557)、非交叉验证相关系数(R2=0.959)和外部预测相关系数(r2=0.863)具有统计学意义,该模型的三维等值线图直观显示了化合物的活性与其三维结构的关系.根据这些结果设计了10个具有新结构的含磷嘧啶类化合物,分子对接和分子动力学模拟结果表明,新化合物和CDK9的结合模式与原化合物64相同,自由能分析从理论上证明了新化合物64d的CDK9抑制活性优于化合物64,并且显示含磷基团与残基Asp109的静电场能在化合物与CDK9作用过程中有重要作用.

摘要：PI3K/Akt/mTOR信号通路在癌细胞的生长和增殖中异常激活,对PI3K和mTOR位点的抑制可有效阻断信号通路的传导,是药物设计的理想靶点.本文选择38个嘧啶类小分子抑制剂进行3D-QSAR和分子对接研究.采用比较分子力场分析(CoMFA)和比较分子相似性指数分析(CoMSIA)方法,建立了三维定量构效关系模型,结果表明,该模型具有良好的稳定性和预测能力,可运用分子对接研究小分子抑制剂与PI3K和mTOR蛋白受体的作用模式.通过对QSAR模型的三维等势图以及受体与配体的相互作用模式分析后,优化出10个小分子化合物并预测其活性,发现一些小分子化合物活性提高,这为PI3K/mTOR双重抑制剂的设计筛选提供了借鉴.

摘要：超声作为一种常用的物理刺激手段,其机械作用在微观范围内对植物细胞的生长会产生一定程度的影响。为了研究超声对绿豆种子生长发育的影响,本研究通过理论分析及仿真设计得出植物矩形细胞的特征频率,并设计了一种超声波刺激装置对绿豆种子进行刺激。利用该装置分别研究了超声频率、刺激时间和正弦波信号激励电压对绿豆种子发芽指数的影响,并在此基础上研究了连续波和脉冲波超声以及超声协同不同浓度NaCl对绿豆发芽的影响。结果表明,脉冲波超声较优于连续波超声,当脉冲波占空比为20%时,在48 kHz、35 min、10 Vpp条件下绿豆发芽率最高,该频率与仿真计算的结果基本一致,而且体积摩尔浓度为17.09 mmol·L^(-1)的NaCl溶液协同超声处理可以极大地加速绿豆发芽。结果证明理论推导及仿真计算结果可信,也由此证明适当的超声和NaCl协同刺激可加快植物种子生长,提高发芽率。