摘要：目的 采用CRISPR/Cas9技术构建吲哚胺-2,3-双加氧酶1(IDO1)基因敲除的THP-1细胞株,为研究IDO1在巨噬细胞中的作用提供细胞模型。方法 设计靶向IDO1基因的3条向导RNA(guide RNA,gRNA),分别构建IDO1-gRNA重组质粒,酶切及测序鉴定后,包装成Lenti-IDO1-gRNA慢病毒。利用Cas9慢病毒感染THP-1细胞获得稳定表达Cas9蛋白的细胞株,再经Lenti-IDO1-gRNA慢病毒感染敲除IDO1基因,有限稀释法获得单克隆细胞株。T7E1酶切检测gRNA打靶效率,PCR产物测序和Western blot鉴定IDO1基因敲除效果。CCK8法检测IDO1基因敲除对THP-1细胞增殖活性的影响,流式细胞术检测对巨噬细胞标志物CD11b、CD68和CD14表达的影响,中性红法检测巨噬细胞吞噬功能。结果 成功构建了3种IDO1-gRNA重组质粒,3条gRNA均能有效编辑IDO1基因,以gRNA2编辑效率最高。经PCR产物测序和Western blot验证获得了3株THP-1 IDO1-KO单克隆细胞株,并发现IDO1基因敲除可抑制THP-1细胞增殖,下调THP-1巨噬细胞CD11b、CD68表达,上调CD14表达,增强THP-1巨噬细胞吞噬功能。结论 成功构建IDO1基因敲除的THP-1细胞株;IDO1对THP-1细胞增殖活性、分化调节以及THP-1巨噬细胞吞噬功能调节有重要作用,为后续进一步探讨IDO1基因在巨噬细胞中的功能及机制研究奠定基础。

摘要：目的建立一种HBV耐药突变的反向杂交检测方法，并对该方法进行优化和评估。方法针对拉米夫定、阿德福韦酯和恩替卡韦3种药物10个耐药位点的常见耐药突变形式，合成兼顾HBV8种基因型的26条简并探针，并固定于同一张带正电荷的尼龙膜上，与地高辛标记的待测样本聚合酶链反应（PCR）产物进行杂交。为了提高检测灵敏度和特异性，从PeR产物标记地高辛的数目，紫外交联探针的能量强度，以及杂交和严格洗脱4个方面进行优化。为了证实方法的可行性，从检测特异性、灵敏度和临床标本的检测准确性3个方面进行评估。结果当检测体系为引物标记3个地高辛分子，紫外交联的能量强度选择1500×0．1mJ／cm2，杂交温度选择42℃，严格洗脱条件选择44℃，用0．5×SSC和0．1％十二烷基硫酸钠严格洗脱30min时，可获得灵敏、特异的结果。在该检测体系的评估中，当PCR产量在10mg／L以上，可以被检测到，且绝大多数探针特异性较好。临床标本的检测结果与直接测序法的检测结果符合率为93．9％（31／33）。结论该方法可以对HBV拉米夫定、阿德福韦和恩替卡韦耐药突变同时进行检测，是一种简便、快速、灵敏的分析方法，但部分探针的特异性有待进一步提高。对于180／181、202／204这4个位点的探针，由于两两距离较近，同一探针序列包含2个位点的密码子，杂交会相互干扰，通过组合距离较近的2个位点的密码子的各种形式来设计探针，可能有助于取得更好的结果。

摘要：目的构建果糖-1,6-二磷酸酶1(FBP1)重组腺病毒,并探究FBP1对肝癌细胞(HepG2)自噬及增殖的影响。方法PCR扩增FBP1cDNA序列并克隆到腺病毒载体pAdTrack-TO4,构建重组腺病毒质粒pAdTrack-FBP1,将重组腺病毒质粒用Lipofectamine3000转染至HEK293细胞中,包装、扩增获得高滴度重组腺病毒AdFBP1。用重组腺病毒AdFBP1感染HepG2细胞,同时设置Mock组和AdGFP组。通过Westernblot技术和激光共聚焦技术观察FBP1对肝癌细胞自噬水平的影响,进一步通过克隆形成实验和MTS实验观察FBP1对肝癌细胞增殖能力的影响。组间均数比较采用t检验、单因素方差分析。结果成功构建高滴度重组腺病毒FBP1。Westernblot和激光共聚焦检测结果显示,与AdGFP组相比,AdFBP1组自噬水平明显降低。Westernblot结果表明,AdGFP组的LC3Ⅱ蛋白相对表达水平为1.10±0.10,AdFBP1组的为0.30±0.01,F=90.36,P<0.01。激光共聚焦结果表明,AdGFP组肝癌细胞的平均自噬体数量为(28.33±1.53)个,AdFBP1组的为(12.33±1.53)个,F=97.40,P<0.01。另外,克隆形成实验和MTS实验结果显示,与AdGFP组相比,AdFBP1组肝癌细胞的增殖明显受到抑制。克隆形成实验结果表明,AdGFP组的细胞克隆为(65.66±2.57)个,AdFBP1组的细胞克隆为(34.00±2.00)个,F=141.50,P<0.01。MTS实验结果表明,AdGFP组96h的吸光度值为39.13±2.21,AdFBP1组在96h的吸光度值为30.61±3.33,F=7.80,P<0.05。结论FBP1抑制肝癌细胞HepG2的自噬及增殖。

摘要：目的：通过RNA干扰技术沉默内源性抑癌基因Arid2（si Arid2）的表达,观察其对肝癌细胞生长及细胞周期的影响。方法：设计3对特异性沉默Arid2基因的shRNA序列,分别克隆到腺病毒骨架载体上形成重组腺病毒质粒。将质粒转染到HEK293细胞中,包装和扩增形成完整高滴度的重组腺病毒Adsi Arid2-1-3。用构建好的腺病毒感染人肝癌SMMC-7721细胞,Western blotting方法检测Arid2蛋白的表达,筛选干扰效果最佳的重组腺病毒。MTS技术和流式细胞术观察干扰Arid2基因后肝癌细胞增殖和细胞周期的变化。结果：成功构建了高滴度的重组腺病毒Adsi Arid2-1-3。经Western blotting鉴定,Adsi Arid2-3为抑制效果最佳的重组腺病毒。MTS结果显示,Adsi Arid2组细胞在72 h、96 h的吸光度值与空细胞组和Adsicontrol组相比增高,细胞增殖速率明显加快。流式细胞术检测结果显示,Adsi Arid2组处于G1期、S期的细胞百分比与空细胞组和Adsicontrol组相比,G1期细胞百分比明显减少,S期细胞百分比明显增多。结论：成功构建干扰Arid2的重组质粒及重组腺病毒。沉默Arid2可以促进肝癌细胞的增殖,促进其由G1期向S期的转换。

摘要：运用CRISPR/Cas9基因编辑技术,建立SAMHD1基因敲除的Huh7细胞系,并检测敲除SAMHD1基因后对人肝癌细胞Huh7细胞增殖的影响。针对SAMHD1基因作用的功能区域,设计靶向SAMHD1的小向导sg RNA (Small Guide RNA)。构建lentiCRISPRv2-SAMHD1-g RNA重组质粒转化后测序。筛选稳定敲除SAMHD1的稳定细胞系并测序鉴定。采用克隆形成实验分析基因SAMHD1敲除后肝癌细胞Huh7细胞的增殖能力。测序结果显示lentiCRISPRv2-SAMHD1-g RNA载体构建成功。Western blot结果和测序结果表明成功构建敲除SAMHD1的Huh7稳定细胞系。克隆形成实验结果表明,相对于Huh7-WT细胞,Huh7-KO SAMHD1的细胞增殖能力增强(P<0.01)。成功构建基于CRISPR/Cas9技术敲除SAMHD1基因的Huh7细胞系,SAMHD1的表达缺失促进肝癌细胞的增殖。

摘要：目的:通过成簇的规律间隔的短回文重复序列(clustered regularly interspaced short palindromic repeats/Cas9,CRISPR/Cas9)系统在SK-Hep1肝癌细胞系中构建AT富集作用域2(AT-rich interaction domain 2,ARID2)基因敲除模型,并初步观察ARID2敲除对肝癌细胞增殖和迁移能力的影响。方法:设计并合成靶向ARID2的向导RNA(single guide RNA,sg RNA)寡核苷酸序列,长度为20 bp,构建到CRISPR表达载体上,转染HEK293T细胞包装慢病毒并筛选稳定细胞株,采用克隆形成、Transwell和划痕实验分别检测细胞增殖和迁移能力。结果:目的 sg RNA寡核苷酸双链成功插入酶切后的Lenti CRISPER-V2质粒载体中且测序正确;经Western blot鉴定ARID2敲除的细胞株筛选成功;ARID2基因敲除后,与亲本细胞系相比,其蛋白表达缺失;克隆形成实验结果示ARID2敲除细胞株(1#6)培养至10 d时克隆形成数为(125.600±5.131)个,亲本细胞株克隆形成数为(69.000±5.567)个(t=12.962,P=0.000);ARID2敲除细胞株(2#1)培养至8 d时克隆形成数为(94.000±8.737)个,亲本细胞株克隆形成数为(67.000±5.292)个(t=4.635,P=0.010),差异有统计学意义。Transwell结果示ARID2敲除细胞株(1#6)在24 h的迁移细胞数为(180.000±5.542)个,亲本细胞组的迁移细胞数为(90.400±5.031)个(t=20.731,P=0.000);ARID2敲除细胞株(2#1)在24 h的迁移细胞数为(138.600±5.749)个,亲本细胞组的迁移细胞数为(78.400±5.703)个(t=12.891,P=0.000),差异有统计学意义。划痕实验结果示ARID2敲除细胞株(1#6)16 h划痕愈合度为(88.000±0.011)%,亲本细胞组划痕愈合度为(52.500±0.047)%(t=12.490,P=0.000);ARID2敲除细胞株(2#1)16 h划痕愈合度为(71.900±0.020)%,亲本细胞组划痕愈合度为(55.200±0.024)%(t=9.190,P=0.001),差异有统计学意义。结论:ARID2敲除可明显促进肝癌细胞的增殖和迁移能力,证实ARID2作为抑癌基因参与肝癌的发生和进程。ARID2敲除细胞模型为肝癌的深入研究提供新的手段。

摘要：目的:探索顺铂诱导乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)再激活的机制。方法:将稳定表达HBV的肝癌细胞系HepAD38分为2组,即磷酸盐缓冲液(phosphate buffered saline,PBS)对照组及顺铂(Cisplatin)处理组,分别检测cAMP应答元件结合蛋白质-1(cAMP responsive element binding protein 1,CREB1)、乙肝病毒蛋白表达(HBsAg、HBcAg)及病毒复制水平(HBV DNA、HBV mRNA);同样在成功构建稳定敲低CREB1(shCREB1)的HepAD38细胞中,同正常表达HBV的肝癌细胞系HepAD38进行对照,检测经顺铂处理后的HBV复制水平(HBV DNA、HBV m RNA)及蛋白表达水平(HBsAg、HBcAg)。结果:稳定表达HBV的肝癌细胞系HepAD38中,Western blot检测显示,与PBS对照组相比,Cisplatin处理组中CREB1相对表达量为1.355±0.049(P=0.010);HBsAg蛋白相对表达量为1.679±0.060(P=0.003);HBcAg蛋白相对表达量为1.488±0.047(P=0.005)。qRTPCR结果显示经顺铂处理后,HBV DNA绝对表达量为249.600±54.400(P=0.006);HBV m RNA相对表达量为3.084±0.256(P=0.000);以上结果表明在HepAD38细胞中乙肝病毒蛋白表达水平以及病毒复制水平较PBS对照组明显上调,均具有统计学差异;与此同时,选择转入shCREB1质粒的HepAD38细胞,即shCREB1细胞,以及转入对照质粒且能正常表达CREB1的HepAD38细胞,即shControl细胞,2种细胞组内均设置PBS对照组和Cisplatin处理组,分别检测乙肝病毒蛋白表达以及病毒复制水平。qRT-PCR结果显示,HBV DNA在shControl细胞的Cisplatin处理组相对表达量为518.300±3.458;而在shCREB1细胞的Cisplatin处理组相对表达量为265.300±3.125 (P=0.000);HBV m RNA在shControl细胞的Cisplatin处理组相对表达量为2.713±0.318;而在shCREB1细胞的Cisplatin处理组相对表达量为1.263±0.056(P=0.000)。Western blot分析显示shControl细胞的Cisplatin处理组中的HBsAg、HBcAg相对表达量分别为1.254±0.001、2.238±0.041;而在shCREB1细胞的Cisplatin处理组中的HBsAg、HBcAg相对表达量分别为1.121±0.036(P=0.021)、1.681±0.015(P=0.000)。结论:顺铂可以通过CREB1促进乙肝病毒复制水平以及蛋白表达水平上调。

摘要：目的:构建SH3结构域结合蛋白4(SH3-domain binding protein 4,SH3BP4)重组腺病毒载体及shSH3BP4慢病毒载体,初步探索SH3BP4对肝癌细胞迁移增殖能力的影响。方法:PCR扩增SH3BP4 cDNA序列并构建腺病毒重组质粒pAdEasySH3BP4,HEK293细胞包装重组腺病毒AdSH3BP4;构建SH3BP4基因短发夹型RNA干扰慢病毒载体,转染至HEK293T细胞,包装重组慢病毒shSH3BP4。采用Western blot检测SH3BP4在人正常肝脏细胞及肝癌细胞的内源性表达,将SH3BP4过表达实验部分设为3个组:Mock组、AdGFP组和AdSH3BP4组,Mock组为空白对照组,AdGFP组为感染腺病毒AdGFP的对照组,AdSH3BP4组为感染腺病毒AdSH3BP4的实验组;将SH3BP4敲低实验部分设为2个组:sh Control组和shSH3BP4组,sh Control组为感染慢病毒sh PLL3.7的对照组,shSH3BP4组为感染慢病毒shSH3BP4的实验组。通过Transwell和划痕实验检测SH3BP4过表达和敲低对肝癌细胞迁移能力的影响;MTS和直接克隆形成实验检测SH3BP4过表达和敲低对肝癌细胞的增殖能力的影响。结果:经限制性内切酶酶切及DNA测序验证,成功构建AdSH3BP4重组腺病毒载体和shSH3BP4慢病毒载体。Transwell结果表明,AdSH3BP4组(74.800±0.544)相较于空白对照组(219.467±2.640)与AdGFP组(210.533±8.498),迁移的细胞数明显减少(P=0.000);而shSH3BP4组(191.467±3.906))比sh Control组(91.733±2.763)细胞的迁移数目明显增加(P=0.000)。划痕实验结果表明,AdSH3BP4组的细胞修复率[(10.400±0.036)%]明显低于空白对照组[(37.500±0.063)%]与AdGFP组[(50.000±0.063)%](P=0.000);而shSH3BP4组[(55.00±0.05)%]明显高于sh Control组[(23.3±0.029)%](P=0.000)。MTS结果表明:AdSH3BP4组在96 h的吸光度值(0.921±0.053)与空白对照组(1.091±0.043)及AdGFP组(1.062±0.024)相比明显降低(P=0.005)。shSH3BP4组在96 h的吸光度值(1.497±0.020)与sh Control对照组(1.142±0.103)相比明显升高(P=0.004)。直接克隆形成实验结果表明,AdSH3BP4组的细胞克隆形成数(34.333±2.082)相较于空白对照组(86.333±4.726)与AdGFP组(87.333±1.528)明显减少(P=0.000),而shSH3BP4组(65.000±6.557)却明显高于sh Control组(31.000±2.000)(P=0.001)。上述实验结果说明SH3BP4过表达能显著抑制肝癌细胞的迁移、侵袭和增殖能力,而SH3BP4敲低能明显促进肝癌细胞的迁移、侵袭和增殖能力。结论:SH3BP4可抑制肝癌细胞迁移、侵袭和增殖,可能为肝癌的诊治提供一个新的靶标。

摘要：利用反向斑点杂交技术,设计出特异性基因分型探针,并将探针固定在带正电荷的尼龙膜上,与PCR扩增带有地高辛标记的临床血清样本进行杂交。通过优化杂交反应条件,建立起简单、快速、特异地检测HBV基因型的方法。利用该方法对重庆地区临床样本进行分型检测,并与直接测序结果比较。结果表明新建的HBV基因分型方法可对拷贝数在103以上的血清样本准确分型,特异性达到96.67%。重庆地区感染HBV主要以B型为主。

摘要：目的:从乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)低拷贝的血清样本中提取病毒DNA并通过PCR扩增得到全长DNA片段。将全长片段经过环化处理后转染HuH7细胞,体外评价病毒的复制水平。方法:设计含有BspQⅠ酶切位点的HBV全长扩增引物和分段扩增引物,选择HBV低拷贝的临床病人血清样本,经抽提纯化后的病毒DNA作为模板,用巢式PCR结合分段扩增的方法扩增得到HBV全长DNA,PCR产物经BspQⅠ酶切后自连环化,将环化的HBV DNA转染HuH 7细胞,经5 d细胞培养,提取细胞中的病毒复制中间体,通过Southern blot分析病毒复制水平。结果:通过PCR扩增得到5个HBV全长DNA,经过酶切连接全长基因后转染HuH7细胞,Southern blot检测均有复制表达。结论:本实验成功构建能够有复制表达的HBV环化全长,为研究血清中低拷贝HBV病毒的不同病人复制水平与DNA序列关系打下基础。